Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Emiliania huxleyi chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007288AAAG3196419741175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
2NC_007288AGCG3204220521125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
3NC_007288GCA4758875981133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %71842223
4NC_007288TG699869996110 %50 %50 %0 %9 %71842224
5NC_007288TGT41189311904120 %66.67 %33.33 %0 %8 %71842225
6NC_007288AAG414367143771166.67 %0 %33.33 %0 %9 %71842227
7NC_007288TATT314778147881125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_007288TTTAAA315331153481850 %50 %0 %0 %5 %71842230
9NC_007288AAATTT319068190861950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
10NC_007288TTA420907209171133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_007288ACA422860228711266.67 %0 %0 %33.33 %8 %71842235
12NC_007288ACA426345263551166.67 %0 %0 %33.33 %9 %71842239
13NC_007288TTCAAT326657266751933.33 %50 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
14NC_007288TTTCAG329154291701716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %71842244
15NC_007288TAA429570295821366.67 %33.33 %0 %0 %7 %71842244
16NC_007288AT830522305371650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_007288TGCT33127031280110 %50 %25 %25 %9 %71842246
18NC_007288TGA431712317221133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %71842246
19NC_007288AAT432400324111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %71842246
20NC_007288TTGG33328033292130 %50 %50 %0 %7 %71842248
21NC_007288GCT43457934590120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %71842249
22NC_007288GGT43547035481120 %33.33 %66.67 %0 %8 %71842249
23NC_007288AGAA336196362071275 %0 %25 %0 %8 %71842250
24NC_007288CAA437702377131266.67 %0 %0 %33.33 %8 %71842251
25NC_007288AAT438750387611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_007288TATTT442974429921920 %80 %0 %0 %10 %71842259
27NC_007288AATTT443771437891940 %60 %0 %0 %5 %71842259
28NC_007288ATATTA343821438371750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
29NC_007288TAA445226452371266.67 %33.33 %0 %0 %8 %71842262
30NC_007288TAAA345640456511275 %25 %0 %0 %8 %71842262
31NC_007288ATA445756457661166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
32NC_007288ATA446852468631266.67 %33.33 %0 %0 %8 %71842265
33NC_007288ATTT348381483921225 %75 %0 %0 %8 %71842270
34NC_007288AAT449777497871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %71842271
35NC_007288TGTA353576535881325 %50 %25 %0 %7 %71842273
36NC_007288TAA456245562561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %71842274
37NC_007288AGA456381563921266.67 %0 %33.33 %0 %8 %71842274
38NC_007288GAAA356900569111275 %0 %25 %0 %8 %71842274
39NC_007288AGA457303573131166.67 %0 %33.33 %0 %9 %71842274
40NC_007288ATTT358763587741225 %75 %0 %0 %8 %71842274
41NC_007288AATT359171591821250 %50 %0 %0 %8 %71842275
42NC_007288AGA460007600181266.67 %0 %33.33 %0 %8 %71842276
43NC_007288ATA460514605251266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_007288TCT46149361505130 %66.67 %0 %33.33 %7 %71842278
45NC_007288GTTA362719627291125 %50 %25 %0 %9 %71842281
46NC_007288TACA365028650391250 %25 %0 %25 %0 %Non-Coding
47NC_007288AGA465257652681266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
48NC_007288CTG46575665767120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %71842283
49NC_007288TTTC36870168711110 %75 %0 %25 %9 %71842285
50NC_007288TTTA369367693781225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
51NC_007288ATT469951699621233.33 %66.67 %0 %0 %0 %71842289
52NC_007288A12702437025412100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
53NC_007288TGA470863708741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %71842290
54NC_007288AATA371307713191375 %25 %0 %0 %7 %71842290
55NC_007288ACTTT372544725571420 %60 %0 %20 %7 %71842291
56NC_007288TTG47282572836120 %66.67 %33.33 %0 %8 %71842291
57NC_007288TTC47297572986120 %66.67 %0 %33.33 %8 %71842291
58NC_007288TATC373609736201225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
59NC_007288AAC474659746701266.67 %0 %0 %33.33 %8 %71842293
60NC_007288ATTT375343753541225 %75 %0 %0 %8 %71842293
61NC_007288TGC57555175565150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %71842294
62NC_007288ATA476706767161166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_007288TTTAAA377004770211850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
64NC_007288TAA579040790531466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
65NC_007288TTC48204382053110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
66NC_007288GAAA383086830971275 %0 %25 %0 %8 %71842304
67NC_007288ATTT385508855191225 %75 %0 %0 %8 %71842307
68NC_007288AAAT386227862381275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
69NC_007288AT786492865041350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_007288TA686972869821150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_007288TAAA388594886051275 %25 %0 %0 %8 %71842312
72NC_007288TAA489597896071166.67 %33.33 %0 %0 %9 %71842313
73NC_007288TTGA389765897761225 %50 %25 %0 %8 %71842313
74NC_007288TAT490797908091333.33 %66.67 %0 %0 %7 %71842314
75NC_007288ATTG390935909461225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
76NC_007288TATG393230932411225 %50 %25 %0 %8 %71842319
77NC_007288TAAA396892969021175 %25 %0 %0 %9 %71842326
78NC_007288GTT49703897049120 %66.67 %33.33 %0 %0 %71842327
79NC_007288AGTTGG397067970841816.67 %33.33 %50 %0 %0 %71842327
80NC_007288ATT497935979461233.33 %66.67 %0 %0 %8 %71842328
81NC_007288ATT498070980801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %71842328
82NC_007288TGG49954699557120 %33.33 %66.67 %0 %8 %71842331
83NC_007288AAAC31008911009011175 %0 %0 %25 %9 %71842333
84NC_007288AG61010831010941250 %0 %50 %0 %8 %71842333
85NC_007288AATT31012031012141250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_007288ACA41015601015711266.67 %0 %0 %33.33 %8 %71842335
87NC_007288ATT41020331020431133.33 %66.67 %0 %0 %9 %71842336
88NC_007288GAA41022651022751166.67 %0 %33.33 %0 %9 %71842336
89NC_007288CAAA31022761022871275 %0 %0 %25 %8 %71842336
90NC_007288ACA41031841031941166.67 %0 %0 %33.33 %9 %71842337