Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Placopecten magellanicus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007234GAAA3295529661275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
2NC_007234TTTTTG344884505180 %83.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
3NC_007234GTAG3583558461225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
4NC_007234TG658925902110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
5NC_007234ATA4673567451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_007234GTT468256836120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
7NC_007234TTTTTG389368953180 %83.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
8NC_007234GTTTG393799394160 %60 %40 %0 %6 %Non-Coding
9NC_007234GGTT394249435120 %50 %50 %0 %0 %Non-Coding
10NC_007234TCT595349549160 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
11NC_007234GTT41005210063120 %66.67 %33.33 %0 %8 %71657927
12NC_007234TA610116101261150 %50 %0 %0 %9 %71657927
13NC_007234GGTG31023510245110 %25 %75 %0 %9 %71657927
14NC_007234ATTT310518105281125 %75 %0 %0 %9 %71657927
15NC_007234GTT41124911261130 %66.67 %33.33 %0 %7 %71657928
16NC_007234AGTG312998130081125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
17NC_007234GTTT31402814039120 %75 %25 %0 %8 %71657929
18NC_007234GGAT314163141741225 %25 %50 %0 %8 %71657930
19NC_007234T141428014293140 %100 %0 %0 %7 %71657930
20NC_007234TCT41442314434120 %66.67 %0 %33.33 %8 %71657930
21NC_007234GTT41465914670120 %66.67 %33.33 %0 %8 %71657930
22NC_007234TAT415419154301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %71657930
23NC_007234TTGG31754917560120 %50 %50 %0 %0 %71657931
24NC_007234GTG41768317693110 %33.33 %66.67 %0 %9 %71657931
25NC_007234TGG41778717798120 %33.33 %66.67 %0 %8 %168487814
26NC_007234T171906519081170 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_007234A12197301974112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_007234A22201202014122100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
29NC_007234GGAG320278202881125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
30NC_007234A12211652117612100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_007234A22215552157622100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
32NC_007234GGAG321713217231125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
33NC_007234GGTT32229422305120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
34NC_007234TTAGT322844228571420 %60 %20 %0 %7 %Non-Coding
35NC_007234TG72293922951130 %50 %50 %0 %7 %Non-Coding
36NC_007234GAG423992240031233.33 %0 %66.67 %0 %8 %71657934
37NC_007234GTG42412224133120 %33.33 %66.67 %0 %8 %71657934
38NC_007234TTGG32430624317120 %50 %50 %0 %8 %71657934
39NC_007234GTTG32435324365130 %50 %50 %0 %7 %71657934
40NC_007234GTTTT32481424827140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
41NC_007234TTTG32496424974110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
42NC_007234TTG42599326004120 %66.67 %33.33 %0 %8 %71657935
43NC_007234ATTTT326017260301420 %80 %0 %0 %7 %71657935
44NC_007234TTTC32619626206110 %75 %0 %25 %9 %71657935
45NC_007234TGG42621026221120 %33.33 %66.67 %0 %8 %71657935
46NC_007234TTTG32785427865120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
47NC_007234T253057230596250 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
48NC_007234GGAG331250312601125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding