ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Montastraea faveolata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007226	CAGA	3	216	226	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007226	TGG	4	619	630	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_007226	TAA	4	742	752	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_007226	A	13	856	868	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007226	ATT	4	1058	1069	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007226	A	12	1191	1202	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007226	A	15	1972	1986	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_007226	TTTA	3	2670	2681	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	71733146
9	NC_007226	TAT	4	3573	3584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71733146
10	NC_007226	TTTG	3	3603	3613	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	71733146
11	NC_007226	GGGT	3	3616	3627	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	71733146
12	NC_007226	T	12	4080	4091	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	71733146
13	NC_007226	T	31	4518	4548	31	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	71733146
14	NC_007226	TTTTA	3	4881	4894	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	71733146
15	NC_007226	TTTC	3	5027	5038	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	71733146
16	NC_007226	TTGT	3	5256	5267	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	71733146
17	NC_007226	TTTTC	3	6201	6215	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	71733146
18	NC_007226	ATCT	3	6601	6611	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	71733146
19	NC_007226	TGTT	3	7452	7462	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	71733146
20	NC_007226	T	13	7988	8000	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	71733146
21	NC_007226	TTG	4	8722	8733	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	71733146
22	NC_007226	TTCT	3	8737	8747	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	71733146
23	NC_007226	TTTAT	3	9168	9182	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	71733146
24	NC_007226	TTTC	3	9207	9217	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	71733146
25	NC_007226	AAAAG	3	9450	9463	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	71733146
26	NC_007226	AAGT	3	9940	9952	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	71733146
27	NC_007226	G	12	10115	10126	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	71733146
28	NC_007226	T	21	10392	10412	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	71733146
29	NC_007226	TTA	4	11012	11022	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71733146
30	NC_007226	TGT	4	11025	11035	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	71733146
31	NC_007226	TAT	4	11675	11686	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71733146
32	NC_007226	CTTTT	3	11716	11730	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	71733146
33	NC_007226	TTTC	3	11955	11966	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	71733146
34	NC_007226	A	12	12237	12248	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	71733146
35	NC_007226	T	23	13094	13116	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	71733146
36	NC_007226	TTTC	3	13130	13141	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	71733146
37	NC_007226	T	12	13190	13201	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	71733146
38	NC_007226	GTT	4	13374	13385	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	71733146
39	NC_007226	TTTG	3	13526	13536	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	71733157
40	NC_007226	T	14	13545	13558	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	71733157
41	NC_007226	AT	6	15302	15312	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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