ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Cucumis sativus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007144	TCT	4	3024	3035	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68164784
2	NC_007144	A	12	3159	3170	12	100 %	0 %	0 %	0 %	68164784
3	NC_007144	A	14	6683	6696	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007144	A	15	7889	7903	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007144	A	15	8136	8150	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007144	A	16	9254	9269	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007144	AATT	3	10283	10294	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007144	T	13	19404	19416	13	0 %	100 %	0 %	0 %	126165906
9	NC_007144	A	16	23587	23602	16	100 %	0 %	0 %	0 %	270039012
10	NC_007144	TA	6	28499	28510	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007144	TTTA	3	28668	28679	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007144	ACT	4	29249	29260	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007144	TTTA	3	32948	32959	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007144	TTTA	3	32970	32981	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007144	T	12	33820	33831	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007144	ATAAG	3	34474	34488	15	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007144	TAAT	3	38787	38798	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007144	TAAT	3	38803	38814	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007144	A	12	44680	44691	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007144	TTATT	3	48311	48325	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007144	TTA	4	49018	49029	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007144	A	12	59534	59545	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007144	T	14	67509	67522	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007144	T	18	72961	72978	18	0 %	100 %	0 %	0 %	68164827
25	NC_007144	A	12	72980	72991	12	100 %	0 %	0 %	0 %	68164827
26	NC_007144	TAA	4	74303	74314	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68164827
27	NC_007144	T	14	82348	82361	14	0 %	100 %	0 %	0 %	68164827
28	NC_007144	A	13	83396	83408	13	100 %	0 %	0 %	0 %	68164827
29	NC_007144	T	15	84781	84795	15	0 %	100 %	0 %	0 %	68164827
30	NC_007144	T	14	86663	86676	14	0 %	100 %	0 %	0 %	68164827
31	NC_007144	ATTT	4	89715	89730	16	25 %	75 %	0 %	0 %	68164827
32	NC_007144	ATGAA	3	94787	94801	15	60 %	20 %	20 %	0 %	68164827
33	NC_007144	T	13	100519	100531	13	0 %	100 %	0 %	0 %	68164828
34	NC_007144	AGTA	3	112728	112739	12	50 %	25 %	25 %	0 %	68164828
35	NC_007144	A	12	115117	115128	12	100 %	0 %	0 %	0 %	68164828
36	NC_007144	T	13	115958	115970	13	0 %	100 %	0 %	0 %	68164828
37	NC_007144	ATAA	4	119285	119300	16	75 %	25 %	0 %	0 %	68164828
38	NC_007144	CAAA	3	120625	120636	12	75 %	0 %	0 %	25 %	68164828
39	NC_007144	A	15	122194	122208	15	100 %	0 %	0 %	0 %	68164828
40	NC_007144	T	14	125203	125216	14	0 %	100 %	0 %	0 %	68164828
41	NC_007144	T	15	127066	127080	15	0 %	100 %	0 %	0 %	68164828
42	NC_007144	T	13	128239	128251	13	0 %	100 %	0 %	0 %	68164828
43	NC_007144	AGTCGA	3	129055	129072	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68164828
44	NC_007144	GAAGTC	3	129095	129112	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68164828
45	NC_007144	GAAGTC	3	129185	129202	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68164828
46	NC_007144	AGTAGA	3	129247	129264	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68164828
47	NC_007144	A	13	141379	141391	13	100 %	0 %	0 %	0 %	68164828
48	NC_007144	TTTCA	3	147110	147124	15	20 %	60 %	0 %	20 %	68164865
49	NC_007144	AAAT	4	152176	152191	16	75 %	25 %	0 %	0 %	68164865
50	NC_007144	A	14	155230	155243	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Cucumis sativus chloroplast