ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Eriocheir sinensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006992	TAAATT	3	556	573	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	63025113
2	NC_006992	TA	6	681	692	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	63025113
3	NC_006992	GAAA	4	709	723	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	63025113
4	NC_006992	ACT	4	1096	1108	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	63025113
5	NC_006992	AT	6	1279	1290	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	63025113
6	NC_006992	ATT	4	1636	1648	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	63025113
7	NC_006992	CTCG	3	1653	1664	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	63025113
8	NC_006992	TA	9	1749	1765	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	63025113
9	NC_006992	TAT	4	2267	2278	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	63025115
10	NC_006992	TTAT	3	2350	2362	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	63025115
11	NC_006992	TTTA	3	2459	2470	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	63025115
12	NC_006992	CTTT	3	2518	2528	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	63025115
13	NC_006992	CAT	4	2611	2622	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	63025115
14	NC_006992	TTG	4	2725	2736	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	63025115
15	NC_006992	AATT	3	2738	2748	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	63025115
16	NC_006992	TC	6	5616	5627	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	63025118
17	NC_006992	AATC	3	7079	7090	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	63025119
18	NC_006992	TTG	4	9227	9238	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	63025122
19	NC_006992	TA	7	9963	9976	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_006992	A	13	10362	10374	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	63025123
21	NC_006992	TTTA	3	11216	11227	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_006992	TTTC	3	12377	12388	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_006992	TAAT	3	12521	12531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_006992	ATA	4	12701	12712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_006992	ATA	4	13063	13075	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_006992	TTA	4	13198	13209	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_006992	TA	7	13420	13432	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_006992	TTA	4	13822	13833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	63025124
29	NC_006992	TTAA	3	13859	13870	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	63025124
30	NC_006992	GAAA	3	14396	14407	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	63025124
31	NC_006992	AAT	4	14538	14550	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	63025124
32	NC_006992	TAT	4	15545	15555	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_006992	TAAA	3	15627	15639	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_006992	ACT	4	15945	15955	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_006992	AAATAT	3	15990	16006	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_006992	AT	14	16036	16062	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_006992	TA	12	16062	16085	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006992	TA	47	16062	16155	94	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_006992	AT	31	16159	16219	61	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_006992	TA	79	16160	16316	157	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Eriocheir sinensis mitochondrion