ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Geodia neptuni mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006990	TA	6	316	327	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_006990	TTTA	4	1724	1739	16	25 %	75 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_006990	TAT	4	2311	2321	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_006990	TA	7	2367	2379	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_006990	T	12	3170	3181	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006990	AGAA	5	3416	3435	20	75 %	0 %	25 %	10 %	63025099
7	NC_006990	TAA	4	3454	3464	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	63025099
8	NC_006990	TTAA	3	3489	3501	13	50 %	50 %	0 %	7 %	63025100
9	NC_006990	ATG	4	3560	3571	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	63025100
10	NC_006990	AATA	3	3608	3619	12	75 %	25 %	0 %	8 %	63025100
11	NC_006990	TA	6	3649	3660	12	50 %	50 %	0 %	8 %	63025100
12	NC_006990	GTAT	3	3813	3824	12	25 %	50 %	25 %	8 %	63025100
13	NC_006990	ATTT	3	4008	4018	11	25 %	75 %	0 %	9 %	63025100
14	NC_006990	TAA	5	4276	4290	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_006990	ATTTT	3	4551	4564	14	20 %	80 %	0 %	7 %	63025101
16	NC_006990	TAA	4	5089	5099	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_006990	T	12	5671	5682	12	0 %	100 %	0 %	8 %	63025102
18	NC_006990	TAA	4	5768	5779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	63025102
19	NC_006990	TTTTA	3	6302	6315	14	20 %	80 %	0 %	7 %	63025102
20	NC_006990	GGTTT	3	8365	8379	15	0 %	60 %	40 %	6 %	63025104
21	NC_006990	ATT	4	8693	8703	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	63025105
22	NC_006990	TAT	4	8717	8727	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	63025105
23	NC_006990	TTAT	3	9104	9115	12	25 %	75 %	0 %	0 %	63025105
24	NC_006990	GTA	4	11925	11936	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	63025109
25	NC_006990	ATT	4	13562	13573	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	63025110
26	NC_006990	TAT	4	14183	14193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	63025110
27	NC_006990	TAT	4	14361	14371	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	63025110
28	NC_006990	AG	6	14489	14500	12	50 %	0 %	50 %	8 %	63025110
29	NC_006990	TTA	4	15629	15640	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	63025111
30	NC_006990	TAT	4	15984	15995	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	63025111
31	NC_006990	TTTA	3	16124	16134	11	25 %	75 %	0 %	9 %	63025111

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Geodia neptuni mitochondrion