ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Polysphondylium pallidum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006862	GAAA	3	168	179	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_006862	GAAA	3	535	546	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_006862	ATT	4	933	944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_006862	TAAA	3	1268	1280	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_006862	TTTA	3	1428	1439	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_006862	TAAA	3	2598	2609	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_006862	GAT	4	2784	2794	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_006862	AATAT	3	3122	3135	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_006862	TAAA	3	3308	3318	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_006862	ATAA	3	3346	3357	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_006862	TAA	4	3621	3632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006862	TAT	4	3636	3646	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_006862	T	12	4002	4013	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	60117109
14	NC_006862	ATA	4	4910	4920	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_006862	ATA	4	4993	5004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_006862	TAAA	3	5248	5259	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117110
17	NC_006862	AATTA	3	5332	5345	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	60117111
18	NC_006862	AT	6	5727	5737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117111
19	NC_006862	ATAA	3	5763	5774	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117111
20	NC_006862	TAA	4	6415	6426	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117113
21	NC_006862	GAAT	3	6699	6710	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	60117113
22	NC_006862	AG	6	7215	7226	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	60117114
23	NC_006862	GAT	4	7525	7536	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	60117114
24	NC_006862	TTTA	3	8204	8215	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	60117115
25	NC_006862	TAA	4	8790	8800	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_006862	TAA	4	9217	9227	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	60117116
27	NC_006862	ATTAA	3	9541	9554	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	60117117
28	NC_006862	TAA	4	9618	9630	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	60117117
29	NC_006862	TAAA	3	9786	9796	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117117
30	NC_006862	TAT	5	9806	9820	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	60117117
31	NC_006862	TAAA	3	10310	10320	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117118
32	NC_006862	TAT	4	10402	10413	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117119
33	NC_006862	ATA	4	10650	10660	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	60117119
34	NC_006862	TAA	4	11232	11243	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117120
35	NC_006862	AGAA	3	11337	11348	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	60117120
36	NC_006862	ATTA	3	11523	11533	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117120
37	NC_006862	A	16	11561	11576	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	60117120
38	NC_006862	TA	6	11710	11720	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117121
39	NC_006862	TAAAAA	3	11811	11829	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	60117121
40	NC_006862	AAAG	3	12014	12024	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	60117122
41	NC_006862	TTTC	3	12040	12050	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	60117122
42	NC_006862	TAAA	3	12155	12165	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117122
43	NC_006862	TAA	7	12584	12604	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	60117122
44	NC_006862	TAAA	3	12728	12738	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117122
45	NC_006862	TTA	4	12747	12758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117122
46	NC_006862	TTTTAA	3	12840	12857	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	60117122
47	NC_006862	AGA	4	12931	12942	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	60117122
48	NC_006862	ATT	4	12953	12963	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117122
49	NC_006862	ATAA	3	12964	12974	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117122
50	NC_006862	ATT	4	13523	13533	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117123
51	NC_006862	TAAAA	3	13600	13614	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	60117123
52	NC_006862	A	18	13715	13732	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	60117123
53	NC_006862	TTA	5	13967	13981	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	60117123
54	NC_006862	TAA	5	14894	14908	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	60117123
55	NC_006862	CAAAA	3	14922	14935	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	60117123
56	NC_006862	AAT	4	15262	15272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	60117124
57	NC_006862	CAAAA	3	15418	15431	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	60117125
58	NC_006862	TAG	5	15455	15469	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	60117125
59	NC_006862	AATA	3	15613	15623	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117125
60	NC_006862	TATT	3	16399	16409	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	60117127
61	NC_006862	AT	8	16887	16901	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	60117128
62	NC_006862	TTTA	3	17178	17188	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	60117129
63	NC_006862	AAATT	3	17222	17236	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	60117129
64	NC_006862	AAAG	3	17521	17532	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	60117129
65	NC_006862	AAG	4	17861	17872	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	60117130
66	NC_006862	AAGA	3	17946	17956	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	60117130
67	NC_006862	TAAAAT	3	18048	18066	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	60117131
68	NC_006862	ATTT	3	18176	18187	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	60117131
69	NC_006862	TAT	4	18510	18520	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117132
70	NC_006862	TAAA	3	18535	18545	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117132
71	NC_006862	AAAG	3	18823	18833	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	60117132
72	NC_006862	AT	6	19016	19027	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	60117132
73	NC_006862	ATT	5	19172	19186	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	60117132
74	NC_006862	TTTAAA	3	19325	19342	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	60117132
75	NC_006862	ATTT	3	19909	19920	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	60117132
76	NC_006862	ATA	5	19927	19940	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	60117132
77	NC_006862	TTAA	3	20068	20079	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	60117132
78	NC_006862	ATT	4	20162	20174	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	60117132
79	NC_006862	CAAA	3	20266	20277	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	60117132
80	NC_006862	AAG	4	20284	20295	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	60117132
81	NC_006862	TAA	4	20699	20711	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_006862	AAAT	3	21729	21739	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117133
83	NC_006862	ATTT	3	21986	21996	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	60117133
84	NC_006862	AAAT	3	22392	22402	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117133
85	NC_006862	AAT	4	22498	22509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117133
86	NC_006862	TTTA	3	22644	22656	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	60117133
87	NC_006862	TATT	3	22700	22711	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	60117133
88	NC_006862	TAAA	3	22734	22745	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117133
89	NC_006862	TAT	4	22800	22811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117133
90	NC_006862	TA	7	23021	23033	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	60117134
91	NC_006862	ATT	4	23931	23942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117134
92	NC_006862	ATT	4	24201	24212	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117134
93	NC_006862	TCTT	3	24379	24389	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	60117134
94	NC_006862	ATTT	3	24621	24632	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	60117134
95	NC_006862	TTTC	3	24755	24765	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	60117134
96	NC_006862	TTATT	3	24766	24780	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	60117134
97	NC_006862	TAT	5	24846	24861	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	60117134
98	NC_006862	TAAA	3	25204	25215	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117135
99	NC_006862	GTAA	3	25851	25862	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	60117135
100	NC_006862	AT	7	26130	26142	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	60117136
101	NC_006862	AAAG	3	26236	26246	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	60117136
102	NC_006862	TTTA	3	26608	26618	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	60117136
103	NC_006862	TAA	5	26665	26679	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	60117136
104	NC_006862	TTTAAT	3	26734	26757	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117137
105	NC_006862	TA	6	26907	26917	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117137
106	NC_006862	ATAA	3	27019	27030	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117137
107	NC_006862	AT	7	27484	27496	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	60117138
108	NC_006862	ATT	4	27839	27850	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117138
109	NC_006862	TA	6	27885	27895	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117138
110	NC_006862	TAA	4	29231	29243	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	60117139
111	NC_006862	TATT	3	29583	29594	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	60117139
112	NC_006862	AT	6	29914	29927	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	60117139
113	NC_006862	AAAT	3	30195	30205	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117139
114	NC_006862	ATATTA	3	30363	30379	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	60117139
115	NC_006862	TAAA	3	30794	30805	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117140
116	NC_006862	TAT	5	31388	31402	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	60117141
117	NC_006862	ATT	4	32079	32089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117141
118	NC_006862	AGT	4	32143	32154	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	60117141
119	NC_006862	A	14	32256	32269	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	60117142
120	NC_006862	TTATT	3	32412	32426	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	60117142
121	NC_006862	ATT	4	32532	32543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117142
122	NC_006862	AATT	3	32635	32646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	60117142
123	NC_006862	TA	6	32862	32872	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117142
124	NC_006862	TAT	4	32943	32954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117142
125	NC_006862	ATT	4	32970	32981	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117142
126	NC_006862	ATA	4	33083	33094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117142
127	NC_006862	A	12	33262	33273	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	60117143
128	NC_006862	GGA	4	33953	33963	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	60117143
129	NC_006862	TTAG	3	34242	34253	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	60117143
130	NC_006862	TAT	4	34345	34355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117143
131	NC_006862	ATT	4	34690	34701	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	60117143
132	NC_006862	TATTT	3	34903	34917	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	60117143
133	NC_006862	ATTAA	3	35895	35909	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	60117144
134	NC_006862	CAAA	3	36334	36344	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	60117144
135	NC_006862	TAA	5	37293	37308	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	60117144
136	NC_006862	TAA	4	37380	37391	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117145
137	NC_006862	GA	6	37545	37555	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	60117145
138	NC_006862	TA	6	37751	37761	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117145
139	NC_006862	GGTT	3	38503	38513	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_006862	AT	6	38557	38567	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_006862	AATTTT	3	38677	38694	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
142	NC_006862	GAAA	3	39505	39515	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_006862	TAA	4	40335	40346	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_006862	TA	6	40631	40641	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_006862	AATA	3	41019	41030	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117146
146	NC_006862	TAT	4	41066	41076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117146
147	NC_006862	CAGAAG	3	41428	41445	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	60117146
148	NC_006862	AATT	3	41571	41582	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	60117146
149	NC_006862	ATA	4	41601	41612	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117146
150	NC_006862	TAA	4	41752	41762	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	60117146
151	NC_006862	TAAA	3	42273	42283	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	60117147
152	NC_006862	AAT	4	42900	42911	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117148
153	NC_006862	AGCAGG	4	43539	43562	24	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	4 %	60117149
154	NC_006862	AATA	3	43677	43688	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	60117149
155	NC_006862	GAT	4	43810	43820	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	60117149
156	NC_006862	TATGTT	3	44274	44290	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	60117150
157	NC_006862	ATTAGA	3	44733	44750	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	60117150
158	NC_006862	TAT	5	44818	44831	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	60117150
159	NC_006862	TAA	4	44838	44849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117150
160	NC_006862	TATTT	5	44854	44880	27	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	60117150
161	NC_006862	TAT	4	44900	44910	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	60117150
162	NC_006862	TAA	4	45162	45172	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	60117150
163	NC_006862	TAAAAA	3	45606	45622	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	60117150
164	NC_006862	AT	6	46046	46056	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	60117150
165	NC_006862	ATG	4	46173	46183	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	60117150
166	NC_006862	ATA	4	46511	46522	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	60117150
167	NC_006862	ATTT	3	46649	46659	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	60117150

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Polysphondylium pallidum mitochondrion