ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Polysphondylium pallidum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006862	ATT	4	933	944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_006862	GAT	4	2784	2794	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_006862	TAA	4	3621	3632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006862	TAT	4	3636	3646	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_006862	ATA	4	4910	4920	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_006862	ATA	4	4993	5004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_006862	TAA	4	6415	6426	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117113
8	NC_006862	GAT	4	7525	7536	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	60117114
9	NC_006862	TAA	4	8790	8800	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_006862	TAA	4	9217	9227	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	60117116
11	NC_006862	TAA	4	9618	9630	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	60117117
12	NC_006862	TAT	5	9806	9820	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	60117117
13	NC_006862	TAT	4	10402	10413	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117119
14	NC_006862	ATA	4	10650	10660	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	60117119
15	NC_006862	TAA	4	11232	11243	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117120
16	NC_006862	TAA	7	12584	12604	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	60117122
17	NC_006862	TTA	4	12747	12758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117122
18	NC_006862	AGA	4	12931	12942	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	60117122
19	NC_006862	ATT	4	12953	12963	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117122
20	NC_006862	ATT	4	13523	13533	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117123
21	NC_006862	TTA	5	13967	13981	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	60117123
22	NC_006862	TAA	5	14894	14908	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	60117123
23	NC_006862	AAT	4	15262	15272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	60117124
24	NC_006862	TAG	5	15455	15469	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	60117125
25	NC_006862	AAG	4	17861	17872	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	60117130
26	NC_006862	TAT	4	18510	18520	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117132
27	NC_006862	ATT	5	19172	19186	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	60117132
28	NC_006862	ATA	5	19927	19940	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	60117132
29	NC_006862	ATT	4	20162	20174	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	60117132
30	NC_006862	AAG	4	20284	20295	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	60117132
31	NC_006862	TAA	4	20699	20711	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_006862	AAT	4	22498	22509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117133
33	NC_006862	TAT	4	22800	22811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117133
34	NC_006862	ATT	4	23931	23942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117134
35	NC_006862	ATT	4	24201	24212	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117134
36	NC_006862	TAT	5	24846	24861	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	60117134
37	NC_006862	TAA	5	26665	26679	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	60117136
38	NC_006862	ATT	4	27839	27850	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117138
39	NC_006862	TAA	4	29231	29243	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	60117139
40	NC_006862	TAT	5	31388	31402	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60117141
41	NC_006862	ATT	4	32079	32089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117141
42	NC_006862	AGT	4	32143	32154	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	60117141
43	NC_006862	ATT	4	32532	32543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117142
44	NC_006862	TAT	4	32943	32954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117142
45	NC_006862	ATT	4	32970	32981	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117142
46	NC_006862	ATA	4	33083	33094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117142
47	NC_006862	GGA	4	33953	33963	11	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	60117143
48	NC_006862	TAT	4	34345	34355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117143
49	NC_006862	ATT	4	34690	34701	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	60117143
50	NC_006862	TAA	5	37293	37308	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	60117144
51	NC_006862	TAA	4	37380	37391	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117145
52	NC_006862	TAA	4	40335	40346	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_006862	TAT	4	41066	41076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117146
54	NC_006862	ATA	4	41601	41612	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117146
55	NC_006862	TAA	4	41752	41762	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	60117146
56	NC_006862	AAT	4	42900	42911	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117148
57	NC_006862	GAT	4	43810	43820	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	60117149
58	NC_006862	TAT	5	44818	44831	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	60117150
59	NC_006862	TAA	4	44838	44849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117150
60	NC_006862	TAT	4	44900	44910	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	60117150
61	NC_006862	TAA	4	45162	45172	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	60117150
62	NC_006862	ATG	4	46173	46183	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	60117150
63	NC_006862	ATA	4	46511	46522	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	60117150

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Polysphondylium pallidum mitochondrion