ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mortierella verticillata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006838	AATT	3	201	211	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006838	AAG	4	401	411	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_006838	AATAA	3	426	439	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_006838	TAAA	3	596	607	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006838	TAAG	3	630	640	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_006838	AATC	3	1066	1076	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_006838	ATA	5	1203	1217	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_006838	TA	6	1284	1294	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_006838	ATT	4	1547	1558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_006838	AAT	4	1845	1856	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_006838	AAAAT	3	2223	2237	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_006838	GGTA	3	2261	2272	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_006838	ATA	4	2357	2368	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_006838	A	14	4531	4544	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_006838	TAA	4	4821	4831	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_006838	TA	8	5018	5032	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_006838	AATAT	3	5084	5098	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_006838	TTTA	3	5216	5226	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_006838	TAT	4	5364	5376	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_006838	ATTT	4	5673	5688	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_006838	ATT	5	6053	6066	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_006838	TAT	4	6112	6122	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_006838	ATA	4	6167	6178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578625
24	NC_006838	TA	8	6522	6537	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_006838	AAT	4	7221	7232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_006838	GAA	4	8397	8408	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	58578627
27	NC_006838	TTAA	3	8473	8484	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578627
28	NC_006838	TAA	6	9492	9509	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	58578628
29	NC_006838	ATTA	3	9520	9531	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578628
30	NC_006838	TAAA	3	9671	9681	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	58578628
31	NC_006838	TAA	4	9819	9829	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578628
32	NC_006838	CTG	5	9869	9883	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	58578628
33	NC_006838	AAT	4	10333	10344	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578628
34	NC_006838	GTAC	3	10698	10709	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_006838	ATA	4	11464	11474	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_006838	AAAATT	3	12514	12530	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_006838	TAT	4	12851	12862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006838	TAAA	6	13012	13035	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_006838	TAT	4	13339	13350	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578629
40	NC_006838	TAT	4	13423	13434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578629
41	NC_006838	AATT	3	13848	13859	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	58578629
42	NC_006838	TAA	4	14152	14162	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_006838	TTAA	3	14858	14870	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578630
44	NC_006838	ATA	4	16177	16187	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578631
45	NC_006838	TA	6	16225	16236	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578631
46	NC_006838	TAA	4	16372	16382	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578631
47	NC_006838	TA	7	16564	16577	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578631
48	NC_006838	AAAG	3	16778	16788	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	58578631
49	NC_006838	TAT	4	17656	17667	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578631
50	NC_006838	TAT	7	17733	17753	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58578631
51	NC_006838	TTCT	3	18618	18628	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	58578631
52	NC_006838	TTAA	4	18860	18874	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	58578631
53	NC_006838	GAAAC	3	19184	19199	16	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	58578631
54	NC_006838	ATT	4	19877	19889	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58578631
55	NC_006838	TTA	4	20011	20022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	58578631
56	NC_006838	AAAT	3	20424	20434	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	58578631
57	NC_006838	TAAT	3	20950	20961	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578631
58	NC_006838	AATA	3	21682	21692	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_006838	TTATT	3	22016	22030	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_006838	AATT	3	22122	22133	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_006838	TA	7	22275	22287	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_006838	TAAT	3	22961	22972	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_006838	TTAATC	3	23265	23282	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
64	NC_006838	AATT	3	24451	24461	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_006838	AAAAT	3	24508	24521	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_006838	ATA	4	24691	24701	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578635
67	NC_006838	TAT	4	24825	24837	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58578635
68	NC_006838	TAA	4	25675	25686	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_006838	TAAA	3	26066	26077	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006838	TC	7	26896	26908	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
71	NC_006838	AATT	3	27430	27441	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_006838	ATT	4	27823	27835	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58578636
73	NC_006838	AT	6	27857	27868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578636
74	NC_006838	TA	7	28163	28176	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578636
75	NC_006838	ATA	5	28408	28422	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_006838	AT	7	28659	28671	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_006838	TA	6	29399	29412	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_006838	AATC	3	29683	29693	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_006838	TAT	4	30407	30418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578637
80	NC_006838	ATT	4	31297	31308	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_006838	ATA	5	31347	31360	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	58578638
82	NC_006838	AGA	4	31718	31728	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	58578638
83	NC_006838	AAT	4	32445	32457	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	58578638
84	NC_006838	TAT	4	32549	32560	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578638
85	NC_006838	AATT	3	32716	32726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58578638
86	NC_006838	AAAC	3	33236	33247	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_006838	AATAA	3	33265	33278	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_006838	TGT	4	33581	33591	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	58578640
89	NC_006838	ATAA	3	33934	33945	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	58578640
90	NC_006838	AAT	4	34350	34361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578640
91	NC_006838	CTA	4	35073	35084	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	58578641
92	NC_006838	A	13	35359	35371	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_006838	TTAA	3	35393	35403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_006838	TA	6	35405	35415	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_006838	ATTC	3	35700	35711	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_006838	ATA	4	36299	36309	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578642
97	NC_006838	TAT	5	36352	36366	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	58578642
98	NC_006838	ATTCTG	3	37510	37527	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578643
99	NC_006838	ATT	4	38145	38156	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_006838	TAAA	3	38636	38647	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_006838	TAA	4	38990	39001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_006838	ATT	5	39658	39671	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_006838	TTA	4	42055	42066	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578644
104	NC_006838	TTTA	3	42440	42451	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_006838	AAT	4	44180	44191	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578645
106	NC_006838	AAT	4	44792	44803	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578645
107	NC_006838	AT	6	45768	45778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58578646
108	NC_006838	ATATT	3	46177	46191	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_006838	CTTT	3	46288	46299	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_006838	AT	6	46520	46530	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_006838	TTTA	3	46672	46683	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006838	ATAA	3	46725	46736	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_006838	TA	8	46942	46957	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_006838	TTTC	3	49388	49399	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_006838	ATT	4	49438	49450	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_006838	AT	6	49567	49577	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_006838	CTTAA	3	49651	49665	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
118	NC_006838	A	12	49862	49873	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_006838	TAA	4	50101	50112	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_006838	ATA	4	50928	50938	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_006838	ATT	4	51211	51222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_006838	TATC	3	51562	51573	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_006838	TAT	4	52060	52071	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_006838	AAT	4	52090	52101	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_006838	TA	6	52278	52288	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_006838	TATAT	3	52435	52449	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_006838	TA	6	52584	52594	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_006838	T	15	52604	52618	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_006838	AT	7	52651	52664	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_006838	ATT	4	53647	53658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578648
131	NC_006838	AATT	3	54651	54663	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_006838	TAT	4	54935	54947	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_006838	ACGT	3	54988	54998	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_006838	TAA	4	55141	55153	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_006838	TAA	4	55201	55213	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_006838	ATA	5	55273	55287	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_006838	AAT	4	55362	55373	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_006838	AT	6	55642	55652	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_006838	TA	6	55703	55713	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_006838	TAAA	3	55755	55765	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_006838	TTATC	3	56298	56312	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006838	AGGG	3	56661	56673	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_006838	ATT	4	56858	56869	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_006838	ATTT	3	57027	57038	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_006838	TTATT	3	57226	57240	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	58578649
146	NC_006838	TAT	4	57648	57659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578649
147	NC_006838	TTAAA	3	57820	57834	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_006838	AAAGA	3	57971	57985	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
149	NC_006838	TAA	5	58116	58129	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_006838	TAA	4	58422	58434	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Mortierella verticillata mitochondrion