ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhizopus oryzae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006836	TAA	4	3355	3365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006836	AAT	4	3370	3382	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_006836	ATT	4	3759	3769	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_006836	TAA	4	3811	3822	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_006836	ATT	4	4558	4568	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58578600
6	NC_006836	TTA	4	4713	4723	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58578600
7	NC_006836	ATT	4	7617	7628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_006836	ATT	4	8348	8359	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_006836	ATA	4	8987	8997	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_006836	AAT	4	9133	9145	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	58578601
11	NC_006836	TAT	4	9258	9269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578601
12	NC_006836	ATA	5	9489	9502	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	58578601
13	NC_006836	ATA	5	9778	9792	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_006836	GTC	4	10059	10070	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006836	TAA	4	11582	11593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_006836	ATT	4	13923	13934	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578602
17	NC_006836	AGG	4	14740	14751	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	58578602
18	NC_006836	ATA	4	16706	16716	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_006836	TAA	4	17037	17048	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_006836	TAA	4	17082	17094	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_006836	ATT	5	18635	18649	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	58578606
22	NC_006836	TAT	4	20188	20199	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_006836	ATT	4	20749	20760	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578608
24	NC_006836	CTA	4	22412	22423	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	58578609
25	NC_006836	TAT	4	22457	22468	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578609
26	NC_006836	ATA	4	22772	22783	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578609
27	NC_006836	TAT	4	24565	24575	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_006836	TTA	4	25359	25369	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_006836	ATT	4	25899	25910	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_006836	TAA	4	25963	25975	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_006836	TAA	4	26002	26014	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_006836	TTA	4	26042	26052	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_006836	TAA	4	26463	26473	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_006836	TTA	4	26554	26564	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_006836	ATA	4	26867	26879	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_006836	ATT	4	26887	26898	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_006836	TAA	4	27225	27236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006836	ATA	4	27317	27328	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_006836	TAA	4	27995	28007	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_006836	ATA	4	28433	28444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_006836	ATT	4	29099	29109	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_006836	ATT	4	31855	31865	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_006836	TTA	4	34083	34094	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578612
44	NC_006836	TAT	5	34450	34463	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58578612
45	NC_006836	TTA	4	34897	34908	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578612
46	NC_006836	ATT	4	35417	35428	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578612
47	NC_006836	TAT	4	35958	35968	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_006836	ATA	4	36057	36067	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_006836	TAT	4	36992	37003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578613
50	NC_006836	TAA	4	37224	37236	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_006836	ATT	4	37685	37695	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58578614
52	NC_006836	TAA	4	38401	38411	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_006836	ATT	4	38651	38662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_006836	CTA	4	39066	39077	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	58578615
55	NC_006836	TTA	4	40256	40267	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578615
56	NC_006836	AAT	4	41342	41353	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578615
57	NC_006836	TTC	4	41613	41623	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	58578615
58	NC_006836	AAG	4	42467	42478	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	58578615
59	NC_006836	TAA	4	42923	42934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_006836	ATT	4	42939	42950	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_006836	ATA	4	43205	43215	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_006836	ATT	4	43512	43523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_006836	TAT	4	43885	43899	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_006836	TTA	4	44727	44737	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_006836	TAA	4	46671	46682	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_006836	TTA	5	47822	47836	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	58578620
67	NC_006836	ATA	4	49140	49150	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_006836	ATA	4	50909	50919	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578623
69	NC_006836	TAA	4	52819	52831	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_006836	TTA	4	52920	52930	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_006836	TAT	4	53957	53968	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhizopus oryzae mitochondrion