ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aedes albopictus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006817	TTA	4	237	247	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58372090
2	NC_006817	TAA	4	438	449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372090
3	NC_006817	AAT	5	466	481	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	58372090
4	NC_006817	TAT	4	1067	1077	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58372090
5	NC_006817	ATTA	3	1126	1136	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58372090
6	NC_006817	ATA	5	1143	1157	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	58372090
7	NC_006817	TTAA	3	1309	1319	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_006817	ATTT	3	2807	2818	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	58372091
9	NC_006817	TTAATT	3	3129	3146	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	58372092
10	NC_006817	CTTT	3	3275	3286	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	58372092
11	NC_006817	TTTA	3	3914	3924	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	58372093
12	NC_006817	TATTT	3	4995	5009	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	58372095
13	NC_006817	TA	6	5512	5523	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_006817	TTAA	3	5809	5819	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58372096
15	NC_006817	TATTTT	3	5855	5873	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	58372096
16	NC_006817	AATTT	3	6038	6052	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_006817	AAAG	3	6151	6161	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_006817	TTTA	3	6258	6268	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_006817	AATT	4	6337	6352	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	58372084
20	NC_006817	TAT	4	6359	6370	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58372084
21	NC_006817	AT	6	6388	6398	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58372084
22	NC_006817	ATT	4	6419	6429	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58372084
23	NC_006817	A	22	6926	6947	22	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	58372084
24	NC_006817	TAA	4	7334	7345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372084
25	NC_006817	TAA	4	7388	7398	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58372084
26	NC_006817	AAG	4	7474	7485	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	58372084
27	NC_006817	ATT	4	7533	7544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58372084
28	NC_006817	TAT	4	7778	7790	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58372084
29	NC_006817	AAAAT	3	8016	8029	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	58372084
30	NC_006817	TAA	4	8224	8235	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372085
31	NC_006817	AAAT	3	8945	8957	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	58372085
32	NC_006817	AAAT	3	9067	9077	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	58372085
33	NC_006817	TAA	4	9208	9219	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372085
34	NC_006817	AAT	4	9369	9379	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58372085
35	NC_006817	ATATAA	4	9468	9491	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372085
36	NC_006817	AT	7	9771	9784	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58372086
37	NC_006817	AAGA	3	9860	9870	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_006817	TTAA	3	9937	9949	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58372087
39	NC_006817	TTTTAT	4	9954	9977	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	58372087
40	NC_006817	TTTA	3	10116	10127	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	58372087
41	NC_006817	ATTTT	3	10215	10228	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	58372087
42	NC_006817	TAA	4	10257	10268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372087
43	NC_006817	TTA	4	10360	10372	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58372087
44	NC_006817	TTTTA	4	10986	11006	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	58372088
45	NC_006817	ATTT	3	11038	11048	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	58372088
46	NC_006817	ATTT	3	11144	11154	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	58372088
47	NC_006817	ATTT	3	11186	11197	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	58372088
48	NC_006817	ATT	4	11533	11543	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58372088
49	NC_006817	ATTAA	3	11576	11590	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	58372088
50	NC_006817	TTAAT	3	11643	11656	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_006817	TAAA	3	12134	12145	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	58372089
52	NC_006817	TAA	4	12149	12159	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58372089
53	NC_006817	CTA	4	12550	12561	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	58372089
54	NC_006817	TAA	4	12572	12583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372089
55	NC_006817	TAA	4	12593	12604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58372089
56	NC_006817	TAAT	5	13799	13817	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_006817	ATT	4	13964	13975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_006817	TAAA	6	13988	14012	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_006817	TAA	5	14584	14599	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_006817	TAAATT	4	14623	14647	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_006817	TAT	4	14936	14946	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_006817	TAA	5	14989	15003	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_006817	TTAAT	3	15050	15064	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_006817	TAT	4	15125	15135	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_006817	TAA	5	15178	15192	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_006817	TTAAT	3	15238	15252	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_006817	TAT	4	15313	15323	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_006817	TAA	5	15367	15381	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_006817	TTAAT	3	15428	15442	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_006817	TAT	4	15502	15512	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_006817	AAT	5	15557	15571	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_006817	TTAAT	3	15617	15631	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_006817	TAT	4	15692	15702	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_006817	TAA	5	15746	15760	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_006817	T	18	15858	15875	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_006817	TA	8	15923	15938	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_006817	AT	26	15943	15994	52	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_006817	AT	17	16003	16037	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_006817	AT	12	16049	16073	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_006817	AAT	4	16071	16082	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_006817	TA	9	16108	16124	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_006817	TA	14	16129	16154	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_006817	TAAT	3	16173	16184	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006817	TAT	4	16204	16214	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_006817	ATT	4	16218	16230	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_006817	T	15	16237	16251	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_006817	TA	7	16323	16335	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_006817	AT	7	16366	16378	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_006817	AT	6	16401	16411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_006817	ATATTT	5	16477	16505	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
91	NC_006817	ATA	4	16575	16588	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_006817	ATA	4	16644	16655	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_006817	A	12	16652	16663	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Aedes albopictus mitochondrion