ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Kluyveromyces thermotolerans mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006626	TA	6	10	20	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006626	AT	6	330	341	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_006626	AAAT	3	375	386	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_006626	AAAT	3	465	475	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_006626	C	13	542	554	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006626	G	12	564	575	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006626	ATAA	3	576	587	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_006626	TAGG	3	626	636	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_006626	TA	6	1519	1529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_006626	TA	6	1692	1702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_006626	ATT	5	1840	1853	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_006626	TTTA	3	1861	1872	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_006626	AT	6	1886	1899	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_006626	GAGG	3	2019	2030	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_006626	G	15	2104	2118	15	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006626	TA	7	2313	2325	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_006626	TA	6	2594	2605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_006626	AT	8	2665	2680	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_006626	TTA	4	2696	2706	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_006626	ATA	4	2840	2851	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_006626	ATT	4	3004	3014	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_006626	TAT	4	3383	3394	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_006626	TAA	6	3400	3420	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_006626	TAT	4	3439	3451	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_006626	ATA	4	3458	3468	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_006626	AT	17	3513	3545	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_006626	AT	6	4226	4236	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_006626	TA	6	4483	4493	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_006626	AAT	4	4608	4618	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_006626	TTTTAT	3	5220	5237	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_006626	ATATTT	3	5339	5355	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_006626	AAT	4	5489	5499	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_006626	TCATTA	3	5528	5546	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
34	NC_006626	TAA	4	5957	5970	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_006626	AT	8	5987	6003	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_006626	AT	18	6072	6105	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	57790524
37	NC_006626	CTTA	3	7185	7195	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57790524
38	NC_006626	TA	8	7429	7443	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_006626	AT	6	7485	7496	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_006626	AT	7	7649	7663	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_006626	AT	12	7852	7877	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_006626	AGTT	3	7924	7935	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006626	ATCT	3	7939	7951	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
44	NC_006626	TAA	5	7956	7969	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_006626	ATCT	3	8034	8046	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
46	NC_006626	AT	6	8116	8126	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_006626	TA	6	8284	8294	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_006626	TAT	4	8317	8328	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_006626	AAT	5	8326	8341	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_006626	TAA	4	8380	8392	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_006626	TAA	6	8708	8725	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	57790525
52	NC_006626	TAA	6	9302	9319	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	57790525
53	NC_006626	ATAA	4	9688	9703	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	57790525
54	NC_006626	ATT	4	9813	9823	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	57790525
55	NC_006626	ATA	4	9855	9865	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	57790525
56	NC_006626	AT	15	10075	10105	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	57790525
57	NC_006626	TTTAG	3	10302	10315	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	57790525
58	NC_006626	A	12	10566	10577	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	57790525
59	NC_006626	TAA	4	10923	10934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	57790525
60	NC_006626	TTA	7	11951	11971	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	57790525
61	NC_006626	TATT	3	12422	12432	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	57790525
62	NC_006626	TAA	4	12826	12838	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	57790525
63	NC_006626	ATT	4	13100	13111	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	57790525
64	NC_006626	ATT	4	13274	13286	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	57790525
65	NC_006626	ATTT	3	13376	13386	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	57790525
66	NC_006626	TAT	4	14493	14504	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_006626	TA	6	14798	14811	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_006626	TAT	5	14881	14895	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	57790529
69	NC_006626	TAA	4	15048	15060	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_006626	CTAC	3	15079	15090	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
71	NC_006626	GTAA	3	15128	15138	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_006626	ATT	4	15162	15173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_006626	TTA	4	15232	15243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_006626	ATA	4	15371	15385	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_006626	AAT	4	15386	15396	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	57790530
76	NC_006626	ATTGT	3	15527	15540	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	57790530
77	NC_006626	TCTTTA	3	15702	15719	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	57790530
78	NC_006626	TTA	4	15983	15994	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	57790530
79	NC_006626	CTT	4	16140	16151	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	57790530
80	NC_006626	ATA	4	16333	16343	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_006626	AAAT	3	16349	16359	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_006626	AT	8	16364	16378	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_006626	TA	6	16380	16390	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_006626	ATTAT	3	16393	16407	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_006626	TTA	4	16648	16658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	57790531
86	NC_006626	ATA	4	16691	16701	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_006626	TCC	4	17159	17170	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
88	NC_006626	ATTT	3	17180	17191	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_006626	TA	6	17326	17336	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_006626	TAA	4	17351	17363	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_006626	TAA	4	17387	17399	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_006626	ATT	4	17573	17584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	57790532
93	NC_006626	AT	6	17621	17632	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	57790532
94	NC_006626	TATTT	3	17711	17725	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	57790532
95	NC_006626	AT	6	18182	18193	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_006626	TAA	4	18299	18310	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_006626	CTCC	4	18475	18490	16	0 %	25 %	0 %	75 %	6 %	Non-Coding
98	NC_006626	C	12	18485	18496	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006626	TAA	4	18593	18603	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_006626	ATA	4	18785	18795	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_006626	ATAAAA	4	18892	18916	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_006626	ATT	4	19007	19018	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	57790533
103	NC_006626	AGCATT	3	19019	19036	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	57790533
104	NC_006626	ATT	4	19190	19201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	57790533
105	NC_006626	TAAA	3	19738	19748	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_006626	ATT	4	19811	19822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_006626	TAA	4	19830	19842	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_006626	TTAAAT	3	20224	20242	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
109	NC_006626	C	14	20293	20306	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
110	NC_006626	G	14	20320	20333	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006626	ATA	4	20372	20383	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_006626	AT	7	20465	20478	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_006626	TAA	4	20601	20612	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_006626	ATT	4	20621	20632	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_006626	TA	6	20781	20791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_006626	ATT	4	21171	21182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_006626	AT	6	21186	21196	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_006626	AATT	3	21205	21215	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_006626	ATT	5	21253	21268	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_006626	AATAT	3	21373	21387	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006626	AT	6	21405	21415	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_006626	TAAT	3	21458	21468	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_006626	TAAA	3	21693	21703	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	57790534
124	NC_006626	TAAA	3	21723	21735	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	57790534
125	NC_006626	TAT	5	21929	21943	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	57790534
126	NC_006626	ATT	4	21984	21995	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	57790534
127	NC_006626	ATA	4	22035	22046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	57790534
128	NC_006626	TTA	4	22063	22074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	57790534
129	NC_006626	ATA	4	22287	22298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	57790534
130	NC_006626	TAA	5	22531	22545	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	57790534
131	NC_006626	CCCT	3	22752	22762	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
132	NC_006626	TAA	6	22862	22880	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
133	NC_006626	A	14	22954	22967	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_006626	AAT	4	23305	23315	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_006626	ATA	5	23432	23446	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_006626	ATA	4	23522	23534	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_006626	C	12	23543	23554	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006626	G	17	23564	23580	17	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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