ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana tabacum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006581	TAGG	3	2100	2111	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_006581	TTGG	3	3418	3428	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_006581	GATC	3	5793	5803	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	57013880
4	NC_006581	AATA	3	13158	13168	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	57013995
5	NC_006581	AAAG	3	15429	15440	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	57013995
6	NC_006581	AAAT	3	20416	20427	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	57013995
7	NC_006581	CCCA	3	20609	20619	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	57013995
8	NC_006581	TAAG	3	22288	22299	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	57013995
9	NC_006581	GAAG	3	22885	22896	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	57013995
10	NC_006581	AACT	3	24117	24127	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	57013995
11	NC_006581	CTTG	3	24163	24173	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
12	NC_006581	CTTA	3	29512	29522	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
13	NC_006581	GAAA	3	34319	34329	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	57013995
14	NC_006581	ATGG	3	35767	35778	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	57013995
15	NC_006581	ATTT	4	42046	42061	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	57013995
16	NC_006581	ACCT	3	43340	43351	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	57013995
17	NC_006581	AAAG	3	46155	46167	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	57013995
18	NC_006581	TCCT	3	47874	47885	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	57013995
19	NC_006581	ATGA	4	48068	48082	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	57013995
20	NC_006581	AAAG	3	48623	48634	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	57013995
21	NC_006581	GTGA	3	52996	53006	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	57013995
22	NC_006581	GGAA	3	53115	53126	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	57013995
23	NC_006581	AATG	3	58263	58273	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	57013995
24	NC_006581	CCTG	3	58610	58621	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	57013995
25	NC_006581	AGAA	4	63418	63432	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	57013995
26	NC_006581	TCTT	4	63784	63799	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	57013995
27	NC_006581	GTAA	3	65511	65522	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	57013995
28	NC_006581	GGAT	3	70652	70662	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	57013995
29	NC_006581	GAAA	3	72305	72316	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	57013995
30	NC_006581	TCGC	3	77550	77562	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	57013995
31	NC_006581	GCTT	3	79465	79476	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	57013995
32	NC_006581	TAGC	3	80436	80446	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	57013995
33	NC_006581	TCAA	3	85461	85472	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	57013995
34	NC_006581	CGTT	3	86308	86318	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
35	NC_006581	TTTA	3	87497	87508	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	57013995
36	NC_006581	TAAA	3	88077	88088	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	57013995
37	NC_006581	AGAA	3	88618	88629	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	57013995
38	NC_006581	AAGC	3	89234	89245	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	57013995
39	NC_006581	AACT	3	89724	89734	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	57013995
40	NC_006581	CTAA	3	89735	89746	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	57013995
41	NC_006581	ATAG	3	90993	91004	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	57013995
42	NC_006581	TTCT	3	91428	91439	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	57013995
43	NC_006581	ACTT	3	91540	91551	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	57013995
44	NC_006581	TGCT	3	92448	92459	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	57013995
45	NC_006581	AGGA	3	94276	94286	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	57013995
46	NC_006581	TTTA	3	95202	95212	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	57013995
47	NC_006581	CACT	3	95623	95633	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	57013995
48	NC_006581	TGCT	3	96912	96922	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
49	NC_006581	AAGC	3	97018	97028	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	57013995
50	NC_006581	AGTT	3	97925	97936	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	57013995
51	NC_006581	CATT	3	98806	98817	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	57013995
52	NC_006581	ACTC	3	99306	99317	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	57013995
53	NC_006581	TCTT	3	103008	103018	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	57013995
54	NC_006581	CTTC	4	103653	103668	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	57013995
55	NC_006581	AATC	3	105062	105072	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	57013995
56	NC_006581	GGCA	3	107335	107345	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	57013995
57	NC_006581	GGCG	3	110301	110312	12	0 %	0 %	75 %	25 %	0 %	57013995
58	NC_006581	CTTT	4	111118	111133	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	57013995
59	NC_006581	TCTT	3	116612	116623	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	57013995
60	NC_006581	CCTT	3	117118	117129	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	57013995
61	NC_006581	ACCT	3	117289	117299	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	57013995
62	NC_006581	GCCC	3	120298	120309	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	57013995
63	NC_006581	ATTC	3	120949	120959	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
64	NC_006581	CATT	3	125226	125236	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
65	NC_006581	TATT	3	126816	126826	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	57013995
66	NC_006581	TCTT	3	127236	127247	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	57013995
67	NC_006581	TCTG	3	136001	136011	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
68	NC_006581	CATC	3	136146	136157	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	57013995
69	NC_006581	AAAT	3	139301	139311	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	57013995
70	NC_006581	TAGC	4	141685	141701	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	57013995
71	NC_006581	GAAT	3	142551	142561	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	57013995
72	NC_006581	CTTG	3	142713	142723	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
73	NC_006581	CTTA	3	142725	142737	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	57013995
74	NC_006581	TTGA	3	145282	145293	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	57013995
75	NC_006581	CTCG	3	145612	145624	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	57013995
76	NC_006581	GCTT	3	146971	146982	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	57013995
77	NC_006581	ATGC	3	150487	150497	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	57013995
78	NC_006581	CAGG	3	151711	151723	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	57013995
79	NC_006581	GCCC	3	153511	153521	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	57013995
80	NC_006581	CATT	3	154193	154204	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	57013995
81	NC_006581	GGCC	3	157605	157616	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	57013995
82	NC_006581	ACTA	3	157987	157998	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	57013995
83	NC_006581	TCGC	3	158541	158552	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	57013995
84	NC_006581	GGGA	3	159449	159460	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	57013995
85	NC_006581	ACCT	3	160309	160320	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	57013995
86	NC_006581	CCAA	3	164737	164748	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	57013995
87	NC_006581	ATTC	3	167393	167403	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
88	NC_006581	TTGC	3	168386	168397	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	57013995
89	NC_006581	TCAT	3	170150	170161	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	57013995
90	NC_006581	TAAG	3	170987	170998	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	57013995
91	NC_006581	TGCT	4	173538	173552	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	57013995
92	NC_006581	AAAG	3	173622	173633	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	57013995
93	NC_006581	GTTC	3	175609	175619	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
94	NC_006581	TTCC	3	175793	175804	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	57013995
95	NC_006581	ATCT	3	176047	176057	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
96	NC_006581	TCTT	3	179369	179379	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	57013995
97	NC_006581	TTCT	3	179908	179918	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	57013995
98	NC_006581	CCAG	3	181044	181055	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	57013995
99	NC_006581	GAAA	3	181916	181927	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	57013995
100	NC_006581	AGGG	3	182186	182196	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	57013995
101	NC_006581	AAAG	3	183331	183341	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	57013995
102	NC_006581	GCAA	3	186319	186329	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	57013995
103	NC_006581	GGAC	3	188945	188955	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	57013995
104	NC_006581	TTTA	3	189539	189550	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	57013995
105	NC_006581	CATT	3	189844	189856	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	57013995
106	NC_006581	TTCG	3	192055	192065	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	57013995
107	NC_006581	ATCA	5	192077	192096	20	50 %	25 %	0 %	25 %	10 %	57013995
108	NC_006581	TTCA	3	195299	195309	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
109	NC_006581	GAAA	3	196730	196740	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	57013995
110	NC_006581	GCAA	4	197037	197051	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	57013995
111	NC_006581	CGAA	3	199743	199753	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	57013995
112	NC_006581	TTCA	3	199937	199948	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	57013995
113	NC_006581	ATAG	3	204908	204919	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	57013995
114	NC_006581	ATCC	4	204920	204935	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	57013995
115	NC_006581	AAAG	3	206043	206054	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	57013995
116	NC_006581	TTCT	3	206124	206135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	57013995
117	NC_006581	ACTT	3	206256	206266	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	57013995
118	NC_006581	CTTT	3	208660	208670	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	57013995
119	NC_006581	GGAG	3	209162	209173	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	57013995
120	NC_006581	AAAG	3	210218	210228	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	57013995
121	NC_006581	CTAG	3	211137	211149	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	57013995
122	NC_006581	TTAG	3	211856	211866	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	57013995
123	NC_006581	TGAA	3	214693	214704	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	57013995
124	NC_006581	TTGT	3	215707	215718	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	57013995
125	NC_006581	ATTG	3	224863	224874	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	57013995
126	NC_006581	GGAA	3	225885	225896	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	57013995
127	NC_006581	AAAG	3	227550	227561	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	57013995
128	NC_006581	AAAG	3	227950	227960	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	57013995
129	NC_006581	AGCA	3	228631	228642	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	57013995
130	NC_006581	TCGG	4	229492	229507	16	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	57013995
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226	NC_006581	TCGC	3	428300	428312	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
227	NC_006581	GCTT	3	430215	430226	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana tabacum mitochondrion