ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Todarodes pacificus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006354	TAT	4	1031	1041	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	53793997
2	NC_006354	ATCT	3	1298	1308	11	25 %	50 %	25 %	9 %	53793997
3	NC_006354	AAAT	3	1394	1405	12	75 %	25 %	0 %	8 %	53793998
4	NC_006354	ATT	4	3589	3599	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	168487808
5	NC_006354	TTA	4	4091	4102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53794001
6	NC_006354	TAATTA	3	4649	4667	19	50 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
7	NC_006354	AT	7	5144	5157	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_006354	TAA	4	5270	5281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_006354	TATT	3	5680	5691	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_006354	TA	8	5867	5881	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_006354	TA	9	6184	6201	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_006354	TTA	4	7625	7636	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53794003
13	NC_006354	TA	6	7647	7657	11	50 %	50 %	0 %	9 %	53794003
14	NC_006354	CAAA	3	8104	8114	11	75 %	0 %	25 %	9 %	53794003
15	NC_006354	TTTA	3	8386	8396	11	25 %	75 %	0 %	9 %	53794003
16	NC_006354	ATT	4	8404	8414	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	53794003
17	NC_006354	ATT	4	10606	10616	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	53794005
18	NC_006354	TTA	4	11108	11119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53794007
19	NC_006354	TTA	4	11678	11689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53794008
20	NC_006354	TAT	4	12433	12444	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53794008
21	NC_006354	TCATAT	3	12483	12499	17	33.33 %	50 %	16.67 %	5 %	53794008
22	NC_006354	CA	6	12504	12514	11	50 %	0 %	50 %	9 %	53794008
23	NC_006354	TAAA	3	12577	12588	12	75 %	25 %	0 %	8 %	53794008
24	NC_006354	AACAC	3	13257	13271	15	60 %	0 %	40 %	6 %	53794008
25	NC_006354	ATAA	3	13392	13402	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53794009
26	NC_006354	ATA	5	13548	13561	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	53794009
27	NC_006354	TA	6	13572	13583	12	50 %	50 %	0 %	8 %	53794009
28	NC_006354	TAA	4	14498	14509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	53794009
29	NC_006354	AAAT	3	15453	15463	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53794011
30	NC_006354	TAA	7	15564	15583	20	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	53794011
31	NC_006354	AAAT	3	16536	16547	12	75 %	25 %	0 %	8 %	53794012
32	NC_006354	AATT	3	16577	16589	13	50 %	50 %	0 %	7 %	53794012
33	NC_006354	TAAA	4	16866	16881	16	75 %	25 %	0 %	6 %	53794013
34	NC_006354	ATA	5	17472	17486	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	53794013
35	NC_006354	ATA	4	17949	17959	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_006354	TAAA	3	18406	18416	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_006354	TA	6	18714	18725	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006354	CTA	4	19186	19197	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_006354	TAAA	3	19196	19207	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006354	TTA	4	19405	19416	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_006354	TA	8	19731	19745	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_006354	AT	12	20041	20066	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Todarodes pacificus mitochondrion