ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hydromantes brunus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006345	AAAG	3	832	842	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006345	TAC	4	1675	1686	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_006345	TTAA	3	2123	2135	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_006345	GTTC	3	2395	2406	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_006345	TTA	4	3157	3167	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53686391
6	NC_006345	TA	6	3420	3430	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686391
7	NC_006345	ATT	4	4439	4450	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686392
8	NC_006345	ATTT	4	4461	4476	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	53686392
9	NC_006345	AT	6	4973	4983	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_006345	AGG	4	6363	6374	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	53686393
11	NC_006345	ATA	4	7090	7101	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686393
12	NC_006345	CCCT	3	7188	7198	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	53686393
13	NC_006345	AAGG	3	7245	7256	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_006345	ATTT	3	8169	8179	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686395
15	NC_006345	TTAGT	3	8194	8207	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	53686395
16	NC_006345	TAT	4	8383	8393	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53686396
17	NC_006345	TATT	3	8546	8557	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53686396
18	NC_006345	CAA	4	8584	8594	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	53686396
19	NC_006345	TTA	4	8725	8736	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686396
20	NC_006345	TAAT	3	8812	8824	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53686396
21	NC_006345	TTAC	3	9056	9066	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53686397
22	NC_006345	ATA	5	9131	9145	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53686397
23	NC_006345	TAT	4	10108	10119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686398
24	NC_006345	TTA	4	10927	10938	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686400
25	NC_006345	AATT	3	11270	11282	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53686400
26	NC_006345	ATTT	3	11312	11322	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686400
27	NC_006345	AATT	3	12446	12457	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53686401
28	NC_006345	GAT	4	12574	12584	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53686401
29	NC_006345	CATTAT	3	13573	13591	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	53686401
30	NC_006345	ATT	4	13899	13910	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686401
31	NC_006345	TAAA	4	14247	14262	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	53686402
32	NC_006345	ATT	4	14425	14436	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53686402
33	NC_006345	TTTA	3	14551	14562	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53686403
34	NC_006345	AT	6	14814	14824	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686403
35	NC_006345	ATTT	3	15057	15067	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686403
36	NC_006345	TTAT	3	15165	15175	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686403
37	NC_006345	ATTT	5	15818	15838	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_006345	ATTA	3	15852	15864	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_006345	ATT	4	15901	15912	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_006345	AT	6	16089	16099	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_006345	TA	6	16145	16157	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_006345	TTAT	3	16258	16269	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_006345	AAC	4	16290	16300	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_006345	GAAA	3	16396	16406	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_006345	T	13	16825	16837	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_006345	GTAT	3	16903	16913	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_006345	TATT	3	16997	17007	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hydromantes brunus mitochondrion