ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Batrachoseps attenuatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006340	TTAA	3	1014	1024	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006340	GTTC	3	2373	2384	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_006340	GCA	4	4036	4047	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53686518
4	NC_006340	ATTA	3	4122	4132	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686518
5	NC_006340	TAA	4	4469	4480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53686518
6	NC_006340	TTAT	3	4687	4698	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53686518
7	NC_006340	CCA	4	4736	4747	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	53686518
8	NC_006340	CTA	4	5420	5430	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_006340	TATAA	3	5752	5765	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	53686519
10	NC_006340	GCGG	3	6131	6141	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	53686519
11	NC_006340	AAGG	3	7014	7025	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_006340	ATA	4	7286	7298	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53686520
13	NC_006340	TAT	4	7363	7374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686520
14	NC_006340	TAATT	3	7968	7981	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53686521
15	NC_006340	TTGATA	3	8299	8316	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	53686522
16	NC_006340	ATTA	3	8320	8331	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53686522
17	NC_006340	TA	6	8881	8891	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686523
18	NC_006340	TTAT	3	10750	10760	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686526
19	NC_006340	TC	6	10794	10804	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	53686526
20	NC_006340	TAC	4	10846	10856	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53686526
21	NC_006340	AATT	3	11439	11449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686526
22	NC_006340	AT	6	12206	12216	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686527
23	NC_006340	GAT	4	12360	12370	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53686527
24	NC_006340	ATTA	3	12436	12446	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686527
25	NC_006340	TTA	5	13689	13702	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53686527
26	NC_006340	TA	6	14613	14624	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53686529
27	NC_006340	AATTTT	3	15185	15202	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53686529
28	NC_006340	ATG	4	15428	15439	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53686529
29	NC_006340	AAAAT	4	15629	15649	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_006340	TAAA	3	15840	15850	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_006340	GGGGA	3	15972	15986	15	20 %	0 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_006340	CCT	4	16830	16841	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
33	NC_006340	TAAA	3	17240	17251	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_006340	AACAA	3	17287	17300	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
35	NC_006340	TAT	4	17332	17344	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_006340	ATT	4	17523	17533	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Batrachoseps attenuatus mitochondrion