ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Desmognathus fuscus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006339	TA	6	444	454	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006339	AAATG	4	743	762	20	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
3	NC_006339	TAA	4	775	786	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_006339	AAAG	3	833	843	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_006339	TAAA	4	914	929	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_006339	TTA	4	1463	1474	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_006339	TAAA	4	1510	1525	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006339	ATT	4	1527	1538	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_006339	AT	9	1757	1773	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_006339	ATA	4	1897	1907	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_006339	TA	6	2137	2148	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_006339	ATA	4	2236	2247	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_006339	GTTC	3	2393	2404	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_006339	TTTA	3	3150	3162	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53686321
15	NC_006339	TCA	4	3413	3424	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53686321
16	NC_006339	ATA	4	3597	3608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686321
17	NC_006339	TAA	4	3768	3778	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_006339	ATT	4	4119	4130	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53686322
19	NC_006339	GGA	5	4330	4344	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	53686322
20	NC_006339	TAA	5	4487	4500	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53686322
21	NC_006339	TAA	4	4512	4523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686322
22	NC_006339	ATT	4	4570	4580	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53686322
23	NC_006339	TATAA	3	5532	5545	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	53686323
24	NC_006339	TAT	4	5825	5836	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686323
25	NC_006339	ATA	4	6640	6651	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686323
26	NC_006339	ATT	4	6987	6997	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53686324
27	NC_006339	TTATTG	3	7142	7159	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	53686324
28	NC_006339	AACC	3	7468	7479	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	53686324
29	NC_006339	TAATT	3	7744	7757	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53686325
30	NC_006339	TTAATA	3	7761	7779	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	53686325
31	NC_006339	CAA	4	8133	8143	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	53686326
32	NC_006339	AT	6	8646	8656	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686327
33	NC_006339	ATT	5	9653	9667	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53686328
34	NC_006339	GATT	3	9744	9754	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_006339	AAT	4	10105	10116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53686330
36	NC_006339	ATT	4	10472	10483	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686330
37	NC_006339	CAA	4	10638	10649	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	53686330
38	NC_006339	AATT	3	11211	11221	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686330
39	NC_006339	AT	6	11299	11309	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686330
40	NC_006339	TAT	5	11409	11423	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53686330
41	NC_006339	GAAAT	3	11493	11508	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_006339	TATT	3	13416	13426	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686331
43	NC_006339	AATA	3	13686	13698	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53686332
44	NC_006339	AT	6	14364	14375	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53686333
45	NC_006339	TAT	4	14768	14779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686333
46	NC_006339	ATATAA	3	15253	15270	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_006339	TTA	4	15577	15587	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_006339	T	12	16228	16239	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Desmognathus fuscus mitochondrion