ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhyacotriton variegatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006331	AAAT	5	362	381	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_006331	AT	6	1521	1531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_006331	GTTC	3	2372	2383	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_006331	TCCTC	3	3676	3690	15	0 %	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006331	AAT	4	4395	4406	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686574
6	NC_006331	TAA	4	4478	4489	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686574
7	NC_006331	ATA	4	4555	4566	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686574
8	NC_006331	TATAA	3	5541	5554	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	53686575
9	NC_006331	AGCTGG	3	5610	5627	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	53686575
10	NC_006331	TTTA	3	6283	6294	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53686575
11	NC_006331	ATA	4	6649	6660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686575
12	NC_006331	TAT	4	8453	8464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686578
13	NC_006331	ATTA	3	8684	8694	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53686579
14	NC_006331	AC	6	8753	8763	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	53686579
15	NC_006331	TTAT	3	10538	10548	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53686582
16	NC_006331	TAA	4	11152	11163	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53686582
17	NC_006331	TTAT	3	11236	11247	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53686582
18	NC_006331	ATATT	3	11915	11929	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	53686583
19	NC_006331	AT	6	11981	11992	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53686583
20	NC_006331	ATT	4	13059	13070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686583
21	NC_006331	ATAATT	3	13416	13433	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53686583
22	NC_006331	CAA	5	13591	13605	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	53686584
23	NC_006331	CAA	4	13834	13845	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53686584
24	NC_006331	TAT	4	14399	14410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53686585
25	NC_006331	TAT	4	14605	14615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53686585
26	NC_006331	TA	6	14742	14754	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53686585
27	NC_006331	G	14	15482	15495	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006331	TAT	4	15674	15685	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_006331	TA	6	16014	16025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_006331	CCTT	3	16154	16166	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
31	NC_006331	TA	7	16539	16551	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_006331	TA	6	16883	16894	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_006331	G	12	17240	17251	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006331	TAT	4	17425	17436	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_006331	TA	6	17766	17777	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_006331	TA	6	18297	18309	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_006331	TA	6	18645	18656	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006331	TAT	4	19186	19197	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_006331	TA	6	19527	19538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_006331	TAT	6	20059	20077	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_006331	AACC	3	20972	20982	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_006331	T	12	21183	21194	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_006331	ATTT	3	21424	21434	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Rhyacotriton variegatus mitochondrion