ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetraleurodes acaciae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006292	T	16	1394	1409	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	52221067
2	NC_006292	T	18	2621	2638	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	52221070
3	NC_006292	CTTTT	3	2722	2735	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	52221070
4	NC_006292	TAT	4	3376	3387	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52221071
5	NC_006292	GTTTTT	3	3793	3811	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	52221071
6	NC_006292	TTA	4	4002	4013	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52221071
7	NC_006292	ATT	4	4469	4480	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52221071
8	NC_006292	ATT	4	4547	4558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52221071
9	NC_006292	ACTT	3	4746	4757	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	52221071
10	NC_006292	ATGA	3	4823	4833	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52221071
11	NC_006292	TAT	4	4846	4857	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	52221071
12	NC_006292	TAT	4	5009	5020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_006292	ATA	4	5201	5211	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52221072
14	NC_006292	TAT	5	5229	5243	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52221072
15	NC_006292	GAT	4	5646	5656	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52221072
16	NC_006292	TAA	4	6005	6016	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52221072
17	NC_006292	GAT	4	6389	6400	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52221073
18	NC_006292	ATTT	3	7083	7094	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52221074
19	NC_006292	TTTG	3	7164	7175	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	52221074
20	NC_006292	T	16	7502	7517	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	52221075
21	NC_006292	TTTA	3	7944	7954	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52221075
22	NC_006292	AAT	4	8800	8812	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52221076
23	NC_006292	TTA	4	9774	9785	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_006292	ATTT	3	10378	10389	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_006292	TTAAA	3	10524	10537	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_006292	AATT	3	10599	10610	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_006292	TA	6	10780	10790	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_006292	AATT	3	11465	11477	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_006292	A	13	11684	11696	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52221077
30	NC_006292	TAA	4	12177	12188	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52221078
31	NC_006292	AGAA	3	12674	12686	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	52221078
32	NC_006292	A	14	12688	12701	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52221078
33	NC_006292	AAAT	3	13035	13046	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_006292	T	45	13203	13247	45	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_006292	ATT	4	13355	13367	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_006292	ATT	4	13483	13495	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_006292	ATT	4	13611	13623	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_006292	ATTTA	3	13942	13956	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	52221079
39	NC_006292	T	21	14473	14493	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	52221079
40	NC_006292	TATTTT	4	14750	14773	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	52221079
41	NC_006292	T	13	14842	14854	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	52221079

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetraleurodes acaciae mitochondrion