ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Geocalamus acutus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006285	CAA	4	58	68	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006285	CAC	4	1788	1799	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
3	NC_006285	GAAA	3	1843	1854	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006285	GTTC	3	2386	2397	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_006285	AAT	4	2504	2514	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_006285	TAA	4	3217	3228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52221025
7	NC_006285	ATA	4	3369	3379	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52221025
8	NC_006285	CGC	4	3892	3903	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	52221026
9	NC_006285	CGAA	3	3986	3997	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	52221026
10	NC_006285	TAA	4	4140	4150	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52221026
11	NC_006285	AAC	4	4468	4479	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52221026
12	NC_006285	ACT	4	4831	4842	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221026
13	NC_006285	TTAA	3	4883	4893	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_006285	CGG	4	5914	5926	13	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	52221027
15	NC_006285	TTTA	4	6279	6294	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	52221027
16	NC_006285	ATTC	3	6429	6440	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	52221027
17	NC_006285	ATA	4	6642	6653	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52221027
18	NC_006285	ATT	4	7977	7987	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52221030
19	NC_006285	CTA	5	8423	8437	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	52221030
20	NC_006285	TCA	4	8774	8784	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52221031
21	NC_006285	ATT	5	9648	9661	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52221032
22	NC_006285	ACT	4	11709	11720	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221035
23	NC_006285	TA	6	11954	11964	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52221035
24	NC_006285	AAAT	3	11978	11989	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52221035
25	NC_006285	ACTC	3	12483	12495	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	52221035
26	NC_006285	ATA	4	13153	13164	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52221035
27	NC_006285	CAAA	3	13240	13251	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52221035
28	NC_006285	ACAA	6	13491	13514	24	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52221036
29	NC_006285	ACT	5	14745	14759	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	52221037
30	NC_006285	TAC	4	14765	14776	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221037
31	NC_006285	AGAC	3	15928	15939	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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