ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhineura floridana mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006282	CAA	5	348	361	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_006282	CCCA	3	1079	1089	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
3	NC_006282	ACAAA	3	1142	1155	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
4	NC_006282	GA	6	1589	1600	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_006282	CATA	3	2164	2175	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_006282	GTTC	3	2464	2475	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_006282	CTC	4	2725	2735	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
8	NC_006282	CCAA	3	2923	2935	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	52221039
9	NC_006282	TAA	4	3287	3298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52221039
10	NC_006282	ACT	4	3836	3846	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_006282	AGC	4	4108	4119	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52221040
12	NC_006282	TAT	4	4539	4551	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52221040
13	NC_006282	CTC	4	5659	5670	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	52221041
14	NC_006282	TAC	4	5912	5923	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221041
15	NC_006282	GGCA	3	5940	5950	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	52221041
16	NC_006282	AGG	4	6003	6014	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	52221041
17	NC_006282	AACC	3	8279	8291	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	52221044
18	NC_006282	TCA	4	8862	8872	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52221045
19	NC_006282	CTCA	3	9045	9055	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	52221045
20	NC_006282	TACA	3	10236	10246	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	52221048
21	NC_006282	ACT	4	10359	10370	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221048
22	NC_006282	ACT	4	10380	10391	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221048
23	NC_006282	AACCA	4	10918	10938	21	60 %	0 %	0 %	40 %	9 %	52221048
24	NC_006282	CAG	4	11354	11365	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52221048
25	NC_006282	ACT	4	12385	12396	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221049
26	NC_006282	ACTC	3	13429	13440	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	52221049
27	NC_006282	CAA	4	13464	13475	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52221049
28	NC_006282	CTA	4	13936	13947	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52221050
29	NC_006282	CTAAA	3	15219	15232	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	52221051
30	NC_006282	CCAAA	3	15260	15274	15	60 %	0 %	0 %	40 %	0 %	52221051
31	NC_006282	TAT	4	15652	15663	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_006282	TAT	4	15728	15739	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_006282	TAT	4	15804	15815	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_006282	CTGG	3	16415	16425	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_006282	T	12	16431	16442	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Rhineura floridana mitochondrion