ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Trialeurodes vaporariorum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006280	TAT	4	1400	1412	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52220969
2	NC_006280	ATA	4	2360	2371	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_006280	TATTT	3	2802	2816	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	52220972
4	NC_006280	T	21	3374	3394	21	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	52220973
5	NC_006280	T	22	4372	4393	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	52220974
6	NC_006280	TAT	4	4872	4883	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220975
7	NC_006280	TTTA	3	5037	5047	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52220975
8	NC_006280	TAT	4	5991	6002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220975
9	NC_006280	ATT	4	6439	6450	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220975
10	NC_006280	CTT	4	6547	6557	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_006280	ATT	4	6776	6787	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220976
12	NC_006280	ATA	5	7529	7543	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52220976
13	NC_006280	TATTTT	4	7997	8021	25	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	52220977
14	NC_006280	ATTTT	3	8435	8448	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	52220978
15	NC_006280	TGTA	3	8478	8489	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	52220978
16	NC_006280	T	20	8575	8594	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	52220978
17	NC_006280	GTGG	3	9011	9021	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	52220979
18	NC_006280	T	12	9054	9065	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	52220979
19	NC_006280	TTTC	3	9493	9504	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52220979
20	NC_006280	TTA	4	9701	9712	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220979
21	NC_006280	T	25	9856	9880	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	52220979
22	NC_006280	TTA	4	10380	10391	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220980
23	NC_006280	ATT	4	10472	10483	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52220980
24	NC_006280	TTTA	3	11377	11388	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006280	ATT	4	11551	11562	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_006280	T	24	11648	11671	24	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
27	NC_006280	TTTTC	3	12091	12105	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
28	NC_006280	TTTA	3	12133	12143	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_006280	TTCT	3	12389	12399	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_006280	TA	6	13230	13240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_006280	ATA	4	13270	13282	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_006280	A	26	13538	13563	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_006280	TA	6	13951	13961	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_006280	ATA	4	13991	14003	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_006280	A	26	14259	14284	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_006280	TA	6	14672	14682	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_006280	ATA	4	14712	14724	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_006280	A	26	14980	15005	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_006280	TA	6	15393	15403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_006280	ATA	4	15433	15445	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_006280	A	26	15701	15726	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_006280	TA	6	16114	16124	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_006280	ATA	4	16154	16166	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_006280	A	26	16422	16447	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_006280	TAT	4	17786	17796	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52220981
46	NC_006280	T	25	17997	18021	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_006280	TTAT	3	18239	18249	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Trialeurodes vaporariorum mitochondrion