ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Neomaskellia andropogonis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006159	TAT	4	320	331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830184
2	NC_006159	ACTGGA	4	346	369	24	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	4 %	51830184
3	NC_006159	GGA	4	664	674	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	51830184
4	NC_006159	TTTG	3	796	807	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	51830184
5	NC_006159	ATTT	4	1173	1188	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51830184
6	NC_006159	ATTTTT	3	1398	1416	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	51830184
7	NC_006159	ATTT	3	1749	1761	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51830185
8	NC_006159	T	22	2627	2648	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	51830187
9	NC_006159	T	16	2671	2686	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51830187
10	NC_006159	T	16	2777	2792	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51830187
11	NC_006159	ATTT	3	2842	2852	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51830187
12	NC_006159	T	19	3107	3125	19	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51830187
13	NC_006159	TTA	4	3564	3575	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830188
14	NC_006159	T	15	3643	3657	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51830188
15	NC_006159	TAT	9	3826	3851	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51830188
16	NC_006159	TTA	4	3939	3950	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830188
17	NC_006159	TTA	4	4542	4553	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830188
18	NC_006159	ATTA	3	4588	4598	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51830188
19	NC_006159	TAT	4	5250	5261	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830189
20	NC_006159	ATT	4	6031	6042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830189
21	NC_006159	ATA	5	6456	6470	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51830190
22	NC_006159	TTAA	3	6736	6748	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_006159	TAAT	3	6948	6958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51830191
24	NC_006159	T	18	7123	7140	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51830191
25	NC_006159	TTC	4	7155	7166	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51830191
26	NC_006159	ATTT	3	7934	7946	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51830192
27	NC_006159	TATT	3	8214	8225	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51830192
28	NC_006159	TTTATT	5	8305	8335	31	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	9 %	51830192
29	NC_006159	ATT	4	8467	8478	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	51830193
30	NC_006159	A	14	9028	9041	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51830193
31	NC_006159	AAAT	3	10303	10314	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_006159	ATT	4	10335	10346	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_006159	ATTT	3	10538	10549	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_006159	TAT	4	10676	10687	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830194
35	NC_006159	TAT	4	10919	10930	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830194
36	NC_006159	TTGAA	3	11167	11181	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	51830195
37	NC_006159	AATAA	3	11412	11426	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	51830195
38	NC_006159	ATT	4	11484	11494	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51830195
39	NC_006159	A	12	11544	11555	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	51830195
40	NC_006159	TTAAA	3	11697	11710	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51830195
41	NC_006159	TA	6	11994	12005	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_006159	AT	8	12035	12050	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_006159	TA	6	12052	12063	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_006159	AT	7	12090	12104	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_006159	TAA	5	12227	12241	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_006159	A	14	12237	12250	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006159	TTAT	3	13854	13864	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51830196
48	NC_006159	T	13	14036	14048	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51830196
49	NC_006159	ATA	4	14114	14124	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51830196
50	NC_006159	TAATTT	3	14289	14307	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51830196
51	NC_006159	T	17	14410	14426	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51830196

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Neomaskellia andropogonis mitochondrion