ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Squilla mantis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006081	TCT	4	284	295	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	170675699
2	NC_006081	ATTT	3	568	578	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	170675699
3	NC_006081	AATT	3	694	705	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	170675699
4	NC_006081	TTTAT	3	791	804	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	170675699
5	NC_006081	CTT	4	879	890	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170675699
6	NC_006081	TAT	4	1058	1068	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	170675699
7	NC_006081	TTTA	3	1198	1208	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	170675699
8	NC_006081	TTA	4	1745	1757	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50812331
9	NC_006081	AGGA	3	2200	2211	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	50812331
10	NC_006081	TTTA	3	2444	2455	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50812331
11	NC_006081	TTTC	3	3888	3898	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	50812333
12	NC_006081	TAT	4	5080	5090	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50812335
13	NC_006081	GTTT	3	5416	5427	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	50812335
14	NC_006081	TTA	4	5545	5556	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50812336
15	NC_006081	TAA	4	6293	6305	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50812337
16	NC_006081	CAAAA	4	6306	6325	20	80 %	0 %	0 %	20 %	10 %	50812337
17	NC_006081	TAA	4	6729	6740	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50812337
18	NC_006081	TTA	4	7154	7165	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50812337
19	NC_006081	AAAC	3	7718	7728	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	50812337
20	NC_006081	TAAA	3	7737	7748	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	50812337
21	NC_006081	TAA	4	7968	7979	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50812337
22	NC_006081	AT	6	8460	8470	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50812338
23	NC_006081	ACA	4	8518	8529	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50812338
24	NC_006081	TAAAAT	3	9051	9068	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	50812338
25	NC_006081	AGAA	3	9394	9405	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	50812338
26	NC_006081	TAT	4	9879	9889	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_006081	TTTA	3	9917	9928	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50812340
28	NC_006081	TAT	4	10158	10170	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50812340
29	NC_006081	CTTA	3	10376	10386	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50812340
30	NC_006081	TTTA	3	10659	10670	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50812341
31	NC_006081	TTAT	3	10706	10717	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	50812341
32	NC_006081	ATTT	3	10933	10943	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50812341
33	NC_006081	TATT	3	11205	11215	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50812341
34	NC_006081	ATA	4	11628	11639	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_006081	CTC	4	12132	12142	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	50812342
36	NC_006081	TAAA	3	12540	12551	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50812342
37	NC_006081	TAA	4	12869	12880	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006081	TTTA	3	13839	13849	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_006081	ATT	4	13964	13975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_006081	TTTA	4	14437	14452	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_006081	AT	6	14525	14535	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_006081	TTTA	3	14814	14825	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_006081	AT	6	15156	15167	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_006081	AT	7	15202	15214	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_006081	TA	6	15468	15481	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Squilla mantis mitochondrion