ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nymphaea alba chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006050	TAACAA	3	217	235	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
2	NC_006050	AT	6	297	309	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_006050	CAG	4	1115	1126	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50346762
4	NC_006050	AAGT	3	1221	1231	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50346762
5	NC_006050	TTAATT	3	3965	3981	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_006050	AAAT	3	4675	4686	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_006050	ATTCT	3	4787	4801	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
8	NC_006050	AG	6	5214	5225	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_006050	GGAT	3	5525	5536	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	50346764
10	NC_006050	C	12	5545	5556	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	50346764
11	NC_006050	ACTAA	3	6691	6705	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
12	NC_006050	ATA	4	7139	7152	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_006050	ATAAA	3	7205	7219	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_006050	TGTT	4	7381	7395	15	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_006050	TAGA	3	8023	8033	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_006050	AGAA	3	8368	8379	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_006050	GA	6	9794	9805	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_006050	TA	6	10230	10240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_006050	A	16	10367	10382	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006050	TA	6	10400	10410	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_006050	TTAT	3	14413	14424	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50346768
22	NC_006050	CTTT	3	14838	14848	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_006050	T	16	14883	14898	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_006050	A	12	15324	15335	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006050	TA	6	15377	15387	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_006050	GTT	4	16175	16186	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_006050	TATCA	3	16411	16424	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
28	NC_006050	TTC	4	17085	17096	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50346770
29	NC_006050	ATTA	3	17468	17479	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_006050	TCAA	3	18765	18776	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	126165899
31	NC_006050	T	15	20540	20554	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	126165899
32	NC_006050	CATT	3	23184	23195	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	50346773
33	NC_006050	ATTCC	3	24224	24237	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	50346773
34	NC_006050	GAAT	3	24712	24722	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50346773
35	NC_006050	TTC	4	25373	25384	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50346773
36	NC_006050	GTT	4	25594	25605	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50346773
37	NC_006050	CTT	4	27375	27386	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50346774
38	NC_006050	GAAA	3	28240	28252	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	50346774
39	NC_006050	TAGAA	3	28312	28327	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	50346774
40	NC_006050	AT	6	29014	29025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_006050	ATACC	3	29169	29183	15	40 %	20 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006050	TAGT	3	29501	29511	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_006050	AATTGG	3	29735	29751	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_006050	ATTT	3	30152	30162	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_006050	CAA	4	30823	30833	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_006050	TAT	4	31056	31067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_006050	TTTAA	3	31380	31395	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_006050	TA	8	32194	32210	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_006050	TA	8	32232	32248	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_006050	CTAT	3	32400	32412	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
51	NC_006050	TCCTT	3	33212	33225	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
52	NC_006050	TGTATA	3	34608	34626	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_006050	TCC	4	35248	35259	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
54	NC_006050	A	12	35380	35391	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_006050	TACTAT	4	35756	35779	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
56	NC_006050	TAG	4	35851	35861	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_006050	GAAA	3	37820	37831	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	50346778
58	NC_006050	CAAAC	3	38970	38984	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
59	NC_006050	AG	6	39016	39026	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_006050	TA	6	39253	39264	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_006050	C	13	39698	39710	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006050	TTGAA	3	39803	39816	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_006050	AAG	4	43336	43346	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	50346782
64	NC_006050	AATG	3	43735	43746	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	50346782
65	NC_006050	GCA	4	44140	44151	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50346782
66	NC_006050	AT	6	45429	45440	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_006050	ATCA	3	46371	46381	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	50346783
68	NC_006050	TCTT	4	46904	46919	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	50346783
69	NC_006050	ACTA	3	48193	48203	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_006050	CTT	4	49063	49073	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_006050	TGTA	3	50034	50045	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_006050	TAGT	3	50359	50370	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_006050	AGA	4	50506	50517	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_006050	AATG	3	50730	50742	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_006050	TA	9	51133	51149	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_006050	CTT	4	52023	52034	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_006050	CTTT	3	53796	53807	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_006050	TTA	5	54677	54692	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_006050	TAAC	3	55629	55639	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_006050	TTTC	3	55692	55702	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_006050	TA	6	59459	59470	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_006050	AT	6	59472	59482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_006050	ATATAC	3	59605	59623	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
84	NC_006050	TAT	4	59654	59664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_006050	TTA	5	61996	62010	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_006050	TAT	5	64222	64235	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_006050	TATAAT	3	64251	64269	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
88	NC_006050	AT	7	64640	64652	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_006050	TGAA	3	67065	67076	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	50346794
90	NC_006050	GAT	4	67353	67363	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50346795
91	NC_006050	AATTAT	3	68313	68329	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_006050	AAAG	3	68880	68890	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_006050	TTTC	3	69704	69716	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
94	NC_006050	ATTT	3	69860	69871	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	50346798
95	NC_006050	TTCC	3	70455	70466	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_006050	TTTC	3	72011	72021	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_006050	GTAA	3	72307	72319	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_006050	AGAGTT	3	72553	72570	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_006050	A	17	72637	72653	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_006050	TA	7	72771	72783	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_006050	AAGAT	3	73174	73188	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_006050	TCT	4	73356	73367	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_006050	GAA	5	73372	73385	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_006050	TGA	4	75613	75624	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50346806
105	NC_006050	TAT	4	76530	76542	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50346806
106	NC_006050	A	14	76970	76983	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	50346806
107	NC_006050	ATTTTC	3	77046	77063	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	50346806
108	NC_006050	A	17	77098	77114	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	50346806
109	NC_006050	GAAAA	3	77880	77893	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	50346806
110	NC_006050	TGCTT	4	79552	79570	19	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	50346806
111	NC_006050	TAT	4	80813	80824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50346806
112	NC_006050	GTTCT	3	81010	81024	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	50346806
113	NC_006050	TATT	3	82210	82220	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50346806
114	NC_006050	GGA	4	82248	82258	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	50346806
115	NC_006050	GTTA	3	83695	83707	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	50346806
116	NC_006050	TACC	3	84632	84642	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	50346806
117	NC_006050	TTTA	3	84892	84903	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50346806
118	NC_006050	GGA	4	85975	85987	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	50346806
119	NC_006050	CT	6	86003	86013	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	50346806
120	NC_006050	TTTC	3	86503	86514	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50346806
121	NC_006050	TTCA	3	87081	87091	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50346806
122	NC_006050	TAAT	3	87638	87649	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50346806
123	NC_006050	CA	6	89572	89582	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	50346806
124	NC_006050	ATTT	3	90029	90039	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50346806
125	NC_006050	GAT	4	90567	90577	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50346806
126	NC_006050	GAT	4	91962	91972	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50346806
127	NC_006050	TTCT	3	93652	93662	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	50346806
128	NC_006050	GAAA	3	93779	93791	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	50346806
129	NC_006050	GAT	4	94976	94987	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50346806
130	NC_006050	AAAT	3	95792	95803	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50346806
131	NC_006050	ATCA	3	96470	96482	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	50346806
132	NC_006050	TGAT	3	96559	96571	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	50346806
133	NC_006050	TGA	4	96610	96621	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50346806
134	NC_006050	TGA	4	97138	97149	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50346806
135	NC_006050	AATA	3	97439	97451	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	50346806
136	NC_006050	TTTC	3	97501	97512	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50346806
137	NC_006050	GAAGGA	3	98213	98230	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	50346806
138	NC_006050	ACTT	3	98620	98630	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50346806
139	NC_006050	TCCGG	3	100444	100458	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	50346806
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141	NC_006050	TTTGTT	3	103470	103488	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	50346806
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143	NC_006050	TAC	4	104358	104369	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50346806
144	NC_006050	TAA	4	104777	104788	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50346807
145	NC_006050	ATCC	3	108664	108675	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	50346807
146	NC_006050	TCTA	3	109059	109070	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	50346807
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149	NC_006050	AGGT	3	112021	112032	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	50346807
150	NC_006050	TAAG	3	113141	113151	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50346807
151	NC_006050	AGGG	3	113492	113503	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	50346807
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157	NC_006050	AAT	4	118329	118343	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	50346807
158	NC_006050	TTTA	3	120487	120497	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50346807
159	NC_006050	GAAA	3	120742	120753	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	50346807
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161	NC_006050	ATTT	3	122241	122252	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50346807
162	NC_006050	TA	6	122803	122813	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50346807
163	NC_006050	TTGA	3	122979	122990	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	50346807
164	NC_006050	TA	8	124340	124355	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	50346807
165	NC_006050	GAAA	3	125758	125768	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50346807
166	NC_006050	ATCC	3	125854	125866	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	50346807
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169	NC_006050	CTTT	3	128668	128679	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50346807
170	NC_006050	AAT	4	128710	128721	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50346807
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173	NC_006050	CATT	3	130861	130872	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	50346807
174	NC_006050	CTT	4	131359	131370	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50346807
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178	NC_006050	ATA	4	134867	134878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	50346807
179	NC_006050	TTAATG	3	135615	135631	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	50346807
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181	NC_006050	ATT	4	136368	136378	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50346807
182	NC_006050	CCCT	3	136442	136453	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	50346807
183	NC_006050	CTTA	3	136794	136804	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50346807
184	NC_006050	CCTT	3	140732	140742	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	50346807
185	NC_006050	GGAT	3	141270	141281	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	50346807
186	NC_006050	TCT	4	145152	145163	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50346807
187	NC_006050	GTA	4	145576	145587	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50346807
188	NC_006050	TGA	4	145724	145735	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50346807
189	NC_006050	ACCGG	3	149486	149500	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
190	NC_006050	CATAC	3	150828	150841	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
191	NC_006050	AAGT	3	151315	151325	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50346848
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193	NC_006050	TCCTTC	3	151715	151732	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	50346848
194	NC_006050	TGAA	3	152432	152443	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	50346848
195	NC_006050	TCA	4	152796	152807	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50346848
196	NC_006050	TCA	4	153327	153339	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	50346848
197	NC_006050	TGAT	3	153463	153475	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	50346848
198	NC_006050	ATC	4	154958	154969	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50346848
199	NC_006050	AAAG	3	155114	155124	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50346848
200	NC_006050	ATC	4	157973	157983	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
201	NC_006050	ATC	4	159368	159378	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50346850
202	NC_006050	AAT	4	159907	159919	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nymphaea alba chloroplast