ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Saprolegnia ferax mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005984	TAA	4	771	781	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261277
2	NC_005984	ATT	4	1571	1581	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261277
3	NC_005984	ATA	4	1736	1746	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261277
4	NC_005984	TAT	4	3080	3091	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261317
5	NC_005984	ATT	4	8916	8926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_005984	TTA	4	10754	10765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_005984	ATT	4	11552	11565	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_005984	ATA	4	12920	12931	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261282
9	NC_005984	TAT	4	13022	13032	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261282
10	NC_005984	ATA	4	13671	13681	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261283
11	NC_005984	TTA	4	13957	13967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261283
12	NC_005984	ATA	4	14548	14559	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261283
13	NC_005984	AAT	4	15082	15093	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261318
14	NC_005984	ACA	4	16190	16201	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50261318
15	NC_005984	TAT	4	16428	16438	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_005984	TAT	6	16510	16526	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_005984	ATT	4	18626	18638	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50261286
18	NC_005984	ATT	4	18755	18766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261286
19	NC_005984	ATT	4	22432	22444	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_005984	ATA	4	23136	23146	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261294
21	NC_005984	TAA	7	23282	23300	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	50261294
22	NC_005984	ATA	4	24857	24867	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261298
23	NC_005984	ATA	4	25257	25267	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261298
24	NC_005984	ATA	4	26070	26080	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261300
25	NC_005984	CAA	4	26165	26175	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	50261300
26	NC_005984	ATA	7	26240	26260	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261300
27	NC_005984	TAA	5	26382	26395	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50261300
28	NC_005984	ATT	4	29805	29816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261303
29	NC_005984	TAT	4	30754	30765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261304
30	NC_005984	TAT	4	31654	31664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_005984	ATT	4	31811	31825	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_005984	ATT	4	33017	33028	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261306
33	NC_005984	TAT	4	33274	33285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261306
34	NC_005984	TAA	4	34455	34466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261307
35	NC_005984	TAT	4	34491	34501	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261307
36	NC_005984	ATT	4	34504	34515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261307
37	NC_005984	TAT	4	35366	35376	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261307
38	NC_005984	ATT	4	35548	35559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261307
39	NC_005984	ATA	4	36017	36028	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261308
40	NC_005984	AGA	4	37414	37424	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	50261310
41	NC_005984	ATA	4	38284	38295	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_005984	TAT	4	40916	40927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_005984	TAA	4	42382	42392	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_005984	TAA	5	43225	43239	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	50261311
45	NC_005984	TAT	5	44077	44090	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_005984	TAT	4	44451	44461	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261313
47	NC_005984	ATT	4	45132	45142	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261314
48	NC_005984	TTA	4	46140	46151	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261314
49	NC_005984	TAT	4	46214	46224	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Saprolegnia ferax mitochondrion