ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Saprolegnia ferax mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005984	TAA	4	771	781	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261277
2	NC_005984	ATTT	3	1064	1074	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50261277
3	NC_005984	AAAATA	3	1553	1570	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	50261277
4	NC_005984	ATT	4	1571	1581	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261277
5	NC_005984	ATA	4	1736	1746	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261277
6	NC_005984	A	12	1770	1781	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50261277
7	NC_005984	TAAAA	4	1887	1906	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	50261277
8	NC_005984	A	15	1998	2012	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	50261277
9	NC_005984	TAT	4	3080	3091	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261317
10	NC_005984	TAAAAA	3	3138	3155	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_005984	AT	7	3183	3195	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_005984	AT	8	4229	4245	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_005984	ATTTT	3	4294	4308	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	50261278
14	NC_005984	TTTA	3	4508	4518	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50261278
15	NC_005984	TATTT	3	5135	5150	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	50261279
16	NC_005984	TA	6	6083	6094	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261279
17	NC_005984	AT	6	6449	6461	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50261279
18	NC_005984	T	12	6563	6574	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261279
19	NC_005984	AAAT	3	6581	6592	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50261279
20	NC_005984	TA	6	6682	6692	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_005984	AATTAA	5	6783	6811	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_005984	GTTT	3	8300	8311	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_005984	TATATT	3	8474	8491	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_005984	TATTTT	4	8544	8567	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_005984	TA	6	8681	8692	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_005984	ATT	4	8916	8926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_005984	TTTA	3	9146	9157	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_005984	TTAA	3	9164	9175	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_005984	TTA	4	10754	10765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_005984	ATT	4	11552	11565	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_005984	TAAA	3	11576	11586	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50261316
32	NC_005984	T	15	11593	11607	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261316
33	NC_005984	T	12	11866	11877	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261316
34	NC_005984	ATTT	3	11904	11915	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50261316
35	NC_005984	GTTTTT	3	11963	11979	17	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	50261316
36	NC_005984	T	14	12396	12409	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261281
37	NC_005984	TA	8	12467	12482	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_005984	ATA	4	12920	12931	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261282
39	NC_005984	T	13	12993	13005	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261282
40	NC_005984	TAT	4	13022	13032	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261282
41	NC_005984	TTTA	3	13034	13044	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50261282
42	NC_005984	AT	6	13133	13143	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_005984	A	14	13287	13300	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	50261283
44	NC_005984	TAAA	3	13406	13416	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50261283
45	NC_005984	ATA	4	13671	13681	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261283
46	NC_005984	TTA	4	13957	13967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261283
47	NC_005984	ATA	4	14548	14559	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261283
48	NC_005984	AAAT	3	14560	14571	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50261283
49	NC_005984	AAT	4	15082	15093	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261318
50	NC_005984	ATAA	3	15613	15623	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50261318
51	NC_005984	ACA	4	16190	16201	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50261318
52	NC_005984	TAT	4	16428	16438	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_005984	TAT	6	16510	16526	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_005984	TAAAA	3	16693	16707	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_005984	T	12	17183	17194	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261284
56	NC_005984	T	12	17375	17386	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	50261285
57	NC_005984	T	17	17557	17573	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	50261285
58	NC_005984	AT	7	18141	18154	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50261286
59	NC_005984	TTTTAT	3	18215	18233	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	50261286
60	NC_005984	T	17	18341	18357	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	50261286
61	NC_005984	AT	6	18378	18389	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261286
62	NC_005984	TA	11	18513	18533	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50261286
63	NC_005984	ATT	4	18626	18638	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50261286
64	NC_005984	ATT	4	18755	18766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261286
65	NC_005984	TAAA	3	18962	18972	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_005984	CCAT	3	19139	19150	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
67	NC_005984	T	13	19522	19534	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	50261288
68	NC_005984	TTAA	3	19747	19758	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261289
69	NC_005984	A	12	20749	20760	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50261290
70	NC_005984	AT	6	20975	20986	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261291
71	NC_005984	A	12	20994	21005	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	50261291
72	NC_005984	ATTT	3	21202	21213	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50261292
73	NC_005984	A	13	21389	21401	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	50261292
74	NC_005984	A	13	21507	21519	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50261292
75	NC_005984	TAAA	3	21797	21808	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50261292
76	NC_005984	ATT	4	22432	22444	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_005984	TAAAAA	3	22564	22581	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	50261294
78	NC_005984	AATT	3	22768	22778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50261294
79	NC_005984	A	16	22895	22910	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	50261294
80	NC_005984	A	18	23027	23044	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	50261294
81	NC_005984	ATA	4	23136	23146	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261294
82	NC_005984	AATT	3	23217	23228	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261294
83	NC_005984	TAA	7	23282	23300	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	50261294
84	NC_005984	T	12	23361	23372	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50261295
85	NC_005984	TATT	3	23379	23390	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50261295
86	NC_005984	AAAT	5	23485	23503	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	50261295
87	NC_005984	ATTA	3	23711	23722	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_005984	AAAT	3	24254	24264	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50261297
89	NC_005984	A	13	24373	24385	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	50261297
90	NC_005984	TA	6	24465	24475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50261297
91	NC_005984	TA	7	24510	24522	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50261297
92	NC_005984	TAAA	4	24613	24629	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_005984	ATA	4	24857	24867	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261298
94	NC_005984	AAAAAG	3	24894	24911	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	50261298
95	NC_005984	AAAATT	3	25025	25043	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	50261298
96	NC_005984	ATA	4	25257	25267	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261298
97	NC_005984	AATT	3	25416	25426	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50261299
98	NC_005984	AAAT	3	25488	25499	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50261299
99	NC_005984	A	13	25944	25956	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50261300
100	NC_005984	ATA	4	26070	26080	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261300
101	NC_005984	AATT	3	26106	26117	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261300
102	NC_005984	CAA	4	26165	26175	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	50261300
103	NC_005984	ATA	7	26240	26260	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50261300
104	NC_005984	TAA	5	26382	26395	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50261300
105	NC_005984	A	15	26475	26489	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50261300
106	NC_005984	AT	6	26691	26701	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_005984	T	12	26744	26755	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_005984	A	15	26809	26823	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50261301
109	NC_005984	AAAT	3	28147	28158	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50261302
110	NC_005984	ATTT	4	28301	28316	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	50261302
111	NC_005984	T	17	28592	28608	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	50261303
112	NC_005984	ATGA	3	28609	28619	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50261303
113	NC_005984	ATTT	3	28669	28680	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50261303
114	NC_005984	TTTA	3	28788	28798	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50261303
115	NC_005984	ATTTTT	3	28871	28889	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	50261303
116	NC_005984	ATTT	3	28931	28942	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50261303
117	NC_005984	TTAT	4	29031	29046	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	50261303
118	NC_005984	AT	6	29087	29098	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50261303
119	NC_005984	T	16	29175	29190	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	50261303
120	NC_005984	CTATT	3	29642	29655	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	50261303
121	NC_005984	AATT	3	29717	29727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50261303
122	NC_005984	ATT	4	29805	29816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261303
123	NC_005984	TAT	4	30754	30765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261304
124	NC_005984	TAT	4	31654	31664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_005984	TTTTTA	3	31750	31768	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_005984	ATT	4	31811	31825	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_005984	ATT	4	33017	33028	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261306
128	NC_005984	TAT	4	33274	33285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261306
129	NC_005984	TTAG	3	33652	33663	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	50261306
130	NC_005984	TATAT	3	34098	34111	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	50261306
131	NC_005984	TAA	4	34455	34466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50261307
132	NC_005984	AATT	3	34468	34478	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50261307
133	NC_005984	TAT	4	34491	34501	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261307
134	NC_005984	ATT	4	34504	34515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50261307
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136	NC_005984	TAT	4	35366	35376	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50261307
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138	NC_005984	TTTA	3	35631	35641	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50261307
139	NC_005984	T	13	35750	35762	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	50261307
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155	NC_005984	AAAATA	4	40480	40503	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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159	NC_005984	AAAT	3	42158	42169	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
160	NC_005984	TTAATT	3	42247	42264	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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162	NC_005984	AT	6	42354	42364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
163	NC_005984	TAA	4	42382	42392	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
164	NC_005984	AAATA	3	42393	42408	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
165	NC_005984	A	16	42473	42488	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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167	NC_005984	ATTT	3	42768	42778	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
168	NC_005984	AT	7	42899	42911	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
169	NC_005984	TA	7	42919	42931	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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184	NC_005984	TAT	4	46214	46224	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Saprolegnia ferax mitochondrion