ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Amblyomma triguttatum mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005963	TTTA	3	299	310	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49619213
2	NC_005963	TTTAT	3	441	454	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	49619213
3	NC_005963	ATA	4	748	759	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619213
4	NC_005963	ATT	4	811	821	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49619213
5	NC_005963	TAAAT	3	917	931	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	49619213
6	NC_005963	ATT	5	2543	2557	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	49619214
7	NC_005963	TC	6	2591	2601	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49619214
8	NC_005963	AAT	4	2768	2779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619215
9	NC_005963	CCCTT	3	2917	2930	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	49619215
10	NC_005963	TAT	5	3532	3547	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	49619216
11	NC_005963	ATA	4	3692	3703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619217
12	NC_005963	ATT	4	3878	3888	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49619217
13	NC_005963	TTAA	3	3999	4010	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49619217
14	NC_005963	ATA	4	4175	4186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619217
15	NC_005963	ATT	4	5054	5065	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49619218
16	NC_005963	ATT	4	5436	5446	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49619219
17	NC_005963	AAATTG	3	5522	5540	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_005963	TTAA	3	5664	5675	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_005963	ATT	4	5914	5926	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49619220
20	NC_005963	TTA	4	5975	5986	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49619220
21	NC_005963	AATT	3	5996	6006	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49619220
22	NC_005963	TAT	4	7263	7274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_005963	TTAA	3	7734	7746	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_005963	ATTC	3	8237	8249	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
25	NC_005963	ATA	4	8306	8316	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_005963	TCAC	3	8445	8456	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_005963	ATT	4	8587	8598	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_005963	TTTA	3	8608	8619	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_005963	AATT	3	8758	8769	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005963	TAT	4	8802	8813	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_005963	TAA	4	9531	9541	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49619221
32	NC_005963	ATT	4	9572	9583	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49619221
33	NC_005963	A	12	9850	9861	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49619221
34	NC_005963	ATT	4	10109	10120	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49619221
35	NC_005963	TA	6	10719	10729	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49619221
36	NC_005963	A	14	11189	11202	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49619222
37	NC_005963	TAA	4	11426	11437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619222
38	NC_005963	AAT	4	11957	11968	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619222
39	NC_005963	A	15	11990	12004	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	49619222
40	NC_005963	ATA	4	12241	12251	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49619222
41	NC_005963	AT	6	12491	12502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49619223
42	NC_005963	ATTT	3	12830	12840	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49619224
43	NC_005963	TA	6	12912	12922	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49619224
44	NC_005963	T	13	13044	13056	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49619224
45	NC_005963	TAT	5	13066	13080	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	49619224
46	NC_005963	AAT	4	13075	13086	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49619224
47	NC_005963	ATTA	3	13481	13491	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49619225

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Amblyomma triguttatum mitochondrion