ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Philaenus spumarius mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005944	ATT	4	350	361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146631
2	NC_005944	TTTA	3	556	567	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49146631
3	NC_005944	TAT	4	606	617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146631
4	NC_005944	ATTT	3	811	822	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	49146631
5	NC_005944	ATT	4	951	963	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146631
6	NC_005944	ATT	4	1119	1129	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49146631
7	NC_005944	CTTC	3	1688	1698	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49146632
8	NC_005944	TAATTA	3	3066	3083	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	49146633
9	NC_005944	ATCAT	3	3337	3350	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	49146633
10	NC_005944	TAAA	3	3883	3895	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	49146634
11	NC_005944	ATT	4	4017	4029	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146635
12	NC_005944	ATTT	3	4073	4084	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49146635
13	NC_005944	TAA	4	4115	4126	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146635
14	NC_005944	ATT	4	4495	4506	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146635
15	NC_005944	TTTATT	3	4715	4732	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	49146636
16	NC_005944	ATT	5	4740	4753	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146636
17	NC_005944	TAT	4	4846	4858	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49146636
18	NC_005944	TTG	4	5329	5340	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	49146636
19	NC_005944	ATTAT	3	5727	5740	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	49146637
20	NC_005944	AATT	3	5968	5980	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_005944	CTTA	3	6107	6118	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_005944	CATA	3	6652	6663	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	49146638
23	NC_005944	TAA	4	6743	6754	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146638
24	NC_005944	TTA	4	6781	6791	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49146638
25	NC_005944	TGAA	3	7232	7242	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	49146638
26	NC_005944	ATTT	3	7486	7496	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49146638
27	NC_005944	TAAA	4	7609	7624	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	49146638
28	NC_005944	ATCA	3	7640	7650	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	49146638
29	NC_005944	ATA	5	7960	7974	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	49146639
30	NC_005944	A	15	8945	8959	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	49146639
31	NC_005944	ATT	4	9041	9052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146639
32	NC_005944	ATA	4	9196	9207	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146639
33	NC_005944	AT	11	9524	9546	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49146640
34	NC_005944	AAT	5	9703	9717	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	49146641
35	NC_005944	ATA	4	9944	9955	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146641
36	NC_005944	ATT	4	9953	9964	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146641
37	NC_005944	TTA	4	10247	10258	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49146642
38	NC_005944	ATTA	5	11421	11440	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	49146643
39	NC_005944	A	15	11455	11469	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	49146643
40	NC_005944	TA	6	11505	11515	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49146643
41	NC_005944	ATA	4	11844	11855	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146643
42	NC_005944	TAA	4	12308	12319	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49146643
43	NC_005944	A	14	12683	12696	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_005944	A	15	13155	13169	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_005944	TAAT	4	13482	13497	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_005944	AATA	3	13515	13526	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_005944	AGAA	3	13971	13981	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_005944	TAA	4	14121	14132	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_005944	AAATAA	4	14197	14219	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_005944	TTTA	3	14241	14251	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Philaenus spumarius mitochondrion