ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aleurodicus dugesii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005939	TAT	5	572	586	15	33.33 %	66.67 %	6 %	49146479
2	NC_005939	AATT	3	1219	1230	12	50 %	50 %	8 %	49146479
3	NC_005939	AATT	3	1539	1550	12	50 %	50 %	8 %	49146479
4	NC_005939	TAA	4	2390	2401	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_005939	T	32	2442	2473	32	0 %	100 %	3 %	49146481
6	NC_005939	TAT	4	2484	2495	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146481
7	NC_005939	ATTTAA	3	2592	2609	18	50 %	50 %	5 %	49146482
8	NC_005939	AAT	4	2694	2706	13	66.67 %	33.33 %	7 %	49146482
9	NC_005939	ATT	4	3118	3129	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146482
10	NC_005939	T	45	3310	3354	45	0 %	100 %	6 %	49146483
11	NC_005939	TAAAAT	3	3423	3440	18	66.67 %	33.33 %	5 %	49146483
12	NC_005939	T	15	3832	3846	15	0 %	100 %	6 %	49146483
13	NC_005939	ATTTTT	4	3949	3972	24	16.67 %	83.33 %	8 %	49146483
14	NC_005939	T	14	4094	4107	14	0 %	100 %	7 %	49146484
15	NC_005939	TTTA	3	4141	4152	12	25 %	75 %	8 %	49146484
16	NC_005939	T	14	4227	4240	14	0 %	100 %	7 %	49146484
17	NC_005939	T	28	4314	4341	28	0 %	100 %	7 %	49146484
18	NC_005939	ATT	4	4339	4352	14	33.33 %	66.67 %	7 %	49146484
19	NC_005939	AATTTT	3	4347	4364	18	33.33 %	66.67 %	5 %	49146484
20	NC_005939	AATT	3	4404	4415	12	50 %	50 %	8 %	49146484
21	NC_005939	ATTATA	4	4792	4815	24	50 %	50 %	8 %	49146485
22	NC_005939	ATT	4	4822	4833	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146485
23	NC_005939	ATTT	3	5023	5034	12	25 %	75 %	8 %	49146485
24	NC_005939	TTAA	3	5059	5069	11	50 %	50 %	9 %	49146485
25	NC_005939	ATA	4	5098	5109	12	66.67 %	33.33 %	8 %	49146485
26	NC_005939	ATT	4	5287	5297	11	33.33 %	66.67 %	9 %	49146485
27	NC_005939	ATT	5	5364	5379	16	33.33 %	66.67 %	6 %	49146485
28	NC_005939	ATTT	3	5742	5752	11	25 %	75 %	9 %	49146485
29	NC_005939	TTA	4	5933	5943	11	33.33 %	66.67 %	9 %	49146485
30	NC_005939	TAT	4	5979	5990	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146485
31	NC_005939	ATT	4	6024	6036	13	33.33 %	66.67 %	7 %	49146485
32	NC_005939	TTA	4	6044	6055	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146485
33	NC_005939	TAATA	3	6159	6174	16	60 %	40 %	6 %	49146485
34	NC_005939	T	14	6202	6215	14	0 %	100 %	7 %	49146485
35	NC_005939	TAAA	3	6699	6709	11	75 %	25 %	9 %	49146486
36	NC_005939	ATTAT	3	6832	6845	14	40 %	60 %	7 %	49146486
37	NC_005939	TA	6	6884	6894	11	50 %	50 %	9 %	49146486
38	NC_005939	AAAT	3	6899	6909	11	75 %	25 %	9 %	49146486
39	NC_005939	ATA	4	7102	7113	12	66.67 %	33.33 %	8 %	49146486
40	NC_005939	ATTAAA	3	7692	7710	19	66.67 %	33.33 %	10 %	49146486
41	NC_005939	ATA	5	7947	7962	16	66.67 %	33.33 %	6 %	49146487
42	NC_005939	ATT	4	8000	8011	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146487
43	NC_005939	ATA	4	8018	8030	13	66.67 %	33.33 %	7 %	49146487
44	NC_005939	T	29	8224	8252	29	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
45	NC_005939	AT	6	8251	8262	12	50 %	50 %	8 %	49146488
46	NC_005939	TAT	5	8276	8291	16	33.33 %	66.67 %	6 %	49146488
47	NC_005939	TATTTA	3	8307	8324	18	33.33 %	66.67 %	5 %	49146488
48	NC_005939	ATTA	3	8382	8392	11	50 %	50 %	9 %	49146488
49	NC_005939	TTTA	3	8395	8406	12	25 %	75 %	8 %	49146488
50	NC_005939	T	33	8443	8475	33	0 %	100 %	9 %	49146488
51	NC_005939	ATT	4	8477	8488	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146488
52	NC_005939	ATTT	3	8549	8559	11	25 %	75 %	9 %	49146488
53	NC_005939	TTA	4	8615	8627	13	33.33 %	66.67 %	7 %	49146488
54	NC_005939	AT	6	8918	8929	12	50 %	50 %	8 %	49146489
55	NC_005939	ATTTT	3	8942	8956	15	20 %	80 %	6 %	49146489
56	NC_005939	TAT	4	9037	9048	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146489
57	NC_005939	TAA	4	9043	9054	12	66.67 %	33.33 %	8 %	49146489
58	NC_005939	TTTTA	4	9236	9254	19	20 %	80 %	10 %	49146489
59	NC_005939	ATTT	3	9265	9275	11	25 %	75 %	9 %	49146489
60	NC_005939	T	23	9376	9398	23	0 %	100 %	8 %	49146489
61	NC_005939	ATT	5	9396	9410	15	33.33 %	66.67 %	6 %	49146489
62	NC_005939	T	23	9646	9668	23	0 %	100 %	8 %	49146489
63	NC_005939	T	43	9740	9782	43	0 %	100 %	6 %	49146489
64	NC_005939	A	12	9905	9916	12	100 %	0 %	8 %	49146490
65	NC_005939	TAAA	3	10118	10129	12	75 %	25 %	8 %	49146490
66	NC_005939	AAATAT	3	10240	10258	19	66.67 %	33.33 %	10 %	49146490
67	NC_005939	AT	6	10273	10283	11	50 %	50 %	9 %	49146490
68	NC_005939	ATA	4	10341	10352	12	66.67 %	33.33 %	8 %	49146490
69	NC_005939	ATA	4	10446	10457	12	66.67 %	33.33 %	8 %	49146490
70	NC_005939	TTA	4	10474	10485	12	33.33 %	66.67 %	8 %	49146490
71	NC_005939	TAA	4	10763	10773	11	66.67 %	33.33 %	9 %	49146490
72	NC_005939	ATTA	3	11220	11231	12	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005939	AAAT	3	11233	11244	12	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
74	NC_005939	TAAA	3	11291	11301	11	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_005939	ATTT	3	11328	11338	11	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
76	NC_005939	TAA	4	11721	11732	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_005939	ATTT	3	11765	11776	12	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005939	TAA	4	11842	11854	13	66.67 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
79	NC_005939	TTAAAT	3	11884	11900	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
80	NC_005939	ATTTT	3	11983	11998	16	20 %	80 %	6 %	Non-Coding
81	NC_005939	TTAAAT	3	11998	12015	18	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
82	NC_005939	TTAA	3	12284	12294	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_005939	TTAA	3	12651	12662	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_005939	ATTT	3	12677	12688	12	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
85	NC_005939	TTAA	3	12856	12867	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_005939	T	17	12924	12940	17	0 %	100 %	5 %	Non-Coding
87	NC_005939	TTAATA	3	13019	13037	19	50 %	50 %	10 %	Non-Coding
88	NC_005939	T	19	13050	13068	19	0 %	100 %	5 %	Non-Coding
89	NC_005939	TA	6	13087	13097	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_005939	TTTA	3	13103	13114	12	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
91	NC_005939	TAAA	3	13247	13257	11	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_005939	TAAA	5	13280	13300	21	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_005939	TAAA	4	13403	13418	16	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
94	NC_005939	ATA	4	13416	13426	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_005939	AATA	3	13461	13473	13	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
96	NC_005939	TAA	4	13480	13491	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_005939	TAAA	4	13566	13581	16	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
98	NC_005939	ATA	4	13579	13589	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_005939	AATA	3	13624	13636	13	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
100	NC_005939	TAA	4	13643	13654	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_005939	TAAA	4	13729	13744	16	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
102	NC_005939	ATA	4	13742	13752	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
103	NC_005939	AATA	3	13787	13799	13	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
104	NC_005939	TAA	4	13806	13817	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
105	NC_005939	TAAA	4	13892	13907	16	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
106	NC_005939	ATA	4	13905	13915	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_005939	AATA	3	13950	13962	13	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
108	NC_005939	TAA	4	13969	13980	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_005939	TAAA	4	14055	14070	16	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
110	NC_005939	ATA	4	14068	14078	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_005939	AATA	3	14113	14125	13	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
112	NC_005939	TAA	4	14132	14143	12	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_005939	TAAA	4	14218	14233	16	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
114	NC_005939	ATA	4	14231	14241	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_005939	TA	8	14343	14359	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
116	NC_005939	A	37	14362	14398	37	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_005939	ATT	4	14424	14434	11	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
118	NC_005939	AT	6	14479	14490	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
119	NC_005939	TAA	4	14494	14504	11	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
120	NC_005939	AATT	3	14560	14570	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_005939	ATA	4	14585	14596	12	66.67 %	33.33 %	8 %	49146491
122	NC_005939	TAT	4	14763	14776	14	33.33 %	66.67 %	7 %	49146491
123	NC_005939	TAATT	4	14794	14812	19	40 %	60 %	10 %	49146491
124	NC_005939	TTAA	3	14834	14844	11	50 %	50 %	9 %	49146491
125	NC_005939	TAT	4	14946	14956	11	33.33 %	66.67 %	9 %	49146491
126	NC_005939	AAT	5	15088	15102	15	66.67 %	33.33 %	6 %	49146491
127	NC_005939	ATTT	3	15119	15129	11	25 %	75 %	9 %	49146491
128	NC_005939	TTAT	3	15142	15153	12	25 %	75 %	0 %	49146491
129	NC_005939	TAA	4	15169	15179	11	66.67 %	33.33 %	9 %	49146491
130	NC_005939	T	33	15229	15261	33	0 %	100 %	9 %	49146491
131	NC_005939	TAA	5	15318	15333	16	66.67 %	33.33 %	6 %	49146491
132	NC_005939	T	15	15404	15418	15	0 %	100 %	6 %	49146491
133	NC_005939	TATT	3	15420	15431	12	25 %	75 %	0 %	49146491
134	NC_005939	T	14	15483	15496	14	0 %	100 %	7 %	49146491
135	NC_005939	TTTTA	3	15514	15527	14	20 %	80 %	7 %	49146491
136	NC_005939	TAT	4	15612	15623	12	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
137	NC_005939	TTAA	3	15669	15679	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
138	NC_005939	TTA	4	15701	15711	11	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding

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