ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Moniliophthora perniciosa mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_005927CTCC313091320120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
2NC_005927GATA3186818781150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
3NC_005927AAGG3512251331250 %0 %50 %0 %8 %49147038
4NC_005927TTCC365216531110 %50 %0 %50 %9 %49147039
5NC_005927CTTG367896800120 %50 %25 %25 %8 %49147039
6NC_005927AGCA3680468151250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
7NC_005927ATAA3747174831375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_005927TGCT376817692120 %50 %25 %25 %8 %49147041
9NC_005927GCAA3769577061250 %0 %25 %25 %8 %49147041
10NC_005927TAAC3853785481250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
11NC_005927GGAA3994399531150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
12NC_005927TTAT310542105521125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_005927AGCA311378113881150 %0 %25 %25 %9 %49147078
14NC_005927TCCC31234412355120 %25 %0 %75 %0 %Non-Coding
15NC_005927AAGG312429124391150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
16NC_005927CAAG312564125741150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
17NC_005927GCAA312911129211150 %0 %25 %25 %9 %49147081
18NC_005927AAAG316547165571175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
19NC_005927CTTT31691516925110 %75 %0 %25 %9 %49147043
20NC_005927TAAA317671176821275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
21NC_005927AGAA321826218381375 %0 %25 %0 %7 %49147026
22NC_005927ATTT321881218921225 %75 %0 %0 %8 %49147026
23NC_005927TTAC323718237281125 %50 %0 %25 %9 %49147026
24NC_005927ATTA324423244341250 %50 %0 %0 %0 %49147026
25NC_005927AGTT324658246691225 %50 %25 %0 %8 %49147026
26NC_005927TAAA326256262671275 %25 %0 %0 %8 %49147026
27NC_005927AGGG426944269581525 %0 %75 %0 %6 %Non-Coding
28NC_005927ATTT327507275171125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_005927AAAT329245292561275 %25 %0 %0 %8 %49147047
30NC_005927AATT429278292921550 %50 %0 %0 %6 %49147047
31NC_005927AAAT429591296061675 %25 %0 %0 %6 %49147047
32NC_005927ATTT430352303671625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
33NC_005927TCCC33049630508130 %25 %0 %75 %7 %49147049
34NC_005927TTTA330803308141225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_005927AATT331184311951250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_005927TATT333152331631225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_005927CAAG333417334271150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
38NC_005927ATTA334074340851250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
39NC_005927TTTA334443344541225 %75 %0 %0 %8 %49147052
40NC_005927ATGG334671346811125 %25 %50 %0 %9 %49147052
41NC_005927TTTA434841348561625 %75 %0 %0 %6 %49147052
42NC_005927GATT336698367091225 %50 %25 %0 %8 %49147017
43NC_005927TTCC33732037331120 %50 %0 %50 %8 %49147017
44NC_005927TTTA339377393881225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_005927GTAG339783397931125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
46NC_005927TTTA340081400921225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
47NC_005927TTAA340167401781250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
48NC_005927AATT341377413881250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_005927TTTA341838418491225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
50NC_005927CTTT34213442144110 %75 %0 %25 %9 %49147054
51NC_005927AGGG442258422721525 %0 %75 %0 %6 %49147054
52NC_005927AGGG342340423501125 %0 %75 %0 %9 %49147054
53NC_005927GCAA343618436291250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
54NC_005927TTAA344003440131150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_005927AAGC344634446441150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
56NC_005927TCCT34491744927110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
57NC_005927ATTT348126481361125 %75 %0 %0 %9 %49147057
58NC_005927TAAA348182481921175 %25 %0 %0 %9 %49147057
59NC_005927TGCT34891548925110 %50 %25 %25 %9 %49147058
60NC_005927ATTT549499495182025 %75 %0 %0 %10 %49147014
61NC_005927TGCT35232452334110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
62NC_005927ATAA354360543711275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
63NC_005927TGCT35463654646110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
64NC_005927GGAA354745547551150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
65NC_005927GGAA355632556421150 %0 %50 %0 %9 %49147090
66NC_005927CAAG356421564311150 %0 %25 %25 %9 %49147085
67NC_005927TTGC35770657716110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
68NC_005927TGCT35859758607110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
69NC_005927GAAA358704587141175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
70NC_005927CTTC35896358973110 %50 %0 %50 %9 %49147060
71NC_005927CTTT35912959139110 %75 %0 %25 %9 %49147060
72NC_005927TGCT36048860498110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
73NC_005927TTTC36069160702120 %75 %0 %25 %8 %49147061
74NC_005927AGCA360835608451150 %0 %25 %25 %9 %49147061
75NC_005927AATT362167621781250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_005927AGTA362186621971250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
77NC_005927AGGG462578625931625 %0 %75 %0 %6 %Non-Coding
78NC_005927TCCC36514665158130 %25 %0 %75 %7 %Non-Coding
79NC_005927TAAG368369683801250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
80NC_005927TTTC36916869179120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
81NC_005927TTTA370474704851225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_005927TTTA370543705541225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
83NC_005927AAAG372984729941175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
84NC_005927TAGG373157731681225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
85NC_005927CAAA373795738051175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
86NC_005927AATT374272742831250 %50 %0 %0 %8 %49147035
87NC_005927ATTT375266752761125 %75 %0 %0 %9 %49147036
88NC_005927TTTA375847758581225 %75 %0 %0 %8 %49147036
89NC_005927TTAA378571785821250 %50 %0 %0 %8 %49147034
90NC_005927AAAT378964789741175 %25 %0 %0 %9 %49147034
91NC_005927TTAA380636806471250 %50 %0 %0 %8 %49147033
92NC_005927CTAT382621826311125 %50 %0 %25 %9 %49147033
93NC_005927TTTA383113831241225 %75 %0 %0 %8 %49147033
94NC_005927TTTG38443684446110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
95NC_005927TAAT386160861711250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
96NC_005927TTAA386229862401250 %50 %0 %0 %8 %49147076
97NC_005927TAGA388377883871150 %25 %25 %0 %9 %49147063
98NC_005927CTTG39076790778120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
99NC_005927AGCA390782907931250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
100NC_005927CCTT39189491904110 %50 %0 %50 %9 %49147069
101NC_005927GCAA392036920471250 %0 %25 %25 %8 %49147069
102NC_005927TCCT39210392113110 %50 %0 %50 %9 %49147069
103NC_005927CCGT39278292793120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
104NC_005927TAAA393361933711175 %25 %0 %0 %9 %49147021
105NC_005927TTGC39376693776110 %50 %25 %25 %9 %49147021
106NC_005927AAAG393957939681275 %0 %25 %0 %8 %49147021
107NC_005927TTGC39510395113110 %50 %25 %25 %9 %49147021
108NC_005927TAAA396729967401275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
109NC_005927TTAT397717977271125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
110NC_005927TGCT39780697816110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
111NC_005927TATT398054980641125 %75 %0 %0 %9 %49147072
112NC_005927TTGC39958399593110 %50 %25 %25 %9 %49147025
113NC_005927ATTT31012741012861325 %75 %0 %0 %7 %49147073
114NC_005927TCTA31012881012981125 %50 %0 %25 %9 %49147073
115NC_005927TTAG41040411040551525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
116NC_005927AATT31042111042221250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
117NC_005927TACT31045451045561225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
118NC_005927TAAA31047011047121275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
119NC_005927TGCT3105273105283110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
120NC_005927ACTA31061611061711150 %25 %0 %25 %9 %49147074
121NC_005927CTTT3106285106296120 %75 %0 %25 %8 %49147074
122NC_005927TGTA31067291067391125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
123NC_005927AAGC31073581073681150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
124NC_005927AAGA31076131076241275 %0 %25 %0 %8 %49147032
125NC_005927ATTT31079031079151325 %75 %0 %0 %7 %49147032
126NC_005927TTTA31081611081711125 %75 %0 %0 %9 %49147032
127NC_005927GAAG31086101086211250 %0 %50 %0 %8 %49147032