ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Moniliophthora perniciosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005927	AAG	5	13	27	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_005927	CTT	5	33	47	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
3	NC_005927	CTT	4	206	217	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_005927	AGA	4	244	255	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_005927	TTA	4	682	692	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_005927	ATA	5	694	707	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_005927	TAA	4	2389	2400	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_005927	AAG	5	5062	5076	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	49147038
9	NC_005927	GAA	4	5137	5147	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	49147038
10	NC_005927	AAG	4	5176	5187	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49147038
11	NC_005927	AAG	4	5673	5684	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_005927	GAA	4	5735	5746	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_005927	CTT	4	6077	6088	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_005927	AAT	4	6503	6513	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49147039
15	NC_005927	TTC	4	6545	6556	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147039
16	NC_005927	CTG	4	6703	6714	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	49147039
17	NC_005927	GAA	4	7708	7718	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	49147041
18	NC_005927	AGA	5	7792	7806	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	49147041
19	NC_005927	AGC	5	7801	7815	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	49147041
20	NC_005927	TTC	4	8778	8789	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147040
21	NC_005927	CCT	4	9281	9291	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	49147082
22	NC_005927	CTT	4	9765	9777	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_005927	AAG	4	9926	9937	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_005927	CTT	4	10211	10222	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_005927	AGC	4	10956	10967	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005927	TTC	4	11235	11245	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_005927	CTT	5	11484	11497	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49147078
28	NC_005927	CTT	4	12583	12594	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_005927	CTT	7	13200	13220	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	Non-Coding
30	NC_005927	GAA	4	13291	13302	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_005927	CTT	5	13851	13866	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	49147080
32	NC_005927	GGA	4	14009	14021	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_005927	AAG	4	14060	14072	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_005927	GCT	4	14380	14391	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005927	ATT	5	14622	14636	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_005927	GAA	4	14825	14836	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_005927	AGA	4	14845	14856	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_005927	CTT	5	14922	14935	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_005927	GAG	4	15057	15068	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_005927	AGG	4	15114	15126	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_005927	GTA	4	15328	15340	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_005927	TTA	4	15471	15482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_005927	TAG	4	15496	15508	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_005927	AGC	4	15532	15542	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_005927	CTT	4	17042	17054	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49147043
46	NC_005927	AAG	5	17064	17078	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	49147043
47	NC_005927	CTT	4	17101	17113	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49147043
48	NC_005927	CTT	5	17227	17242	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	49147043
49	NC_005927	CTT	4	17289	17299	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	49147043
50	NC_005927	GAA	4	17309	17323	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	49147043
51	NC_005927	TAA	4	19909	19920	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49147026
52	NC_005927	TAA	4	20227	20238	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49147026
53	NC_005927	TCT	4	20957	20969	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49147026
54	NC_005927	TAA	4	21738	21749	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49147026
55	NC_005927	TAA	4	22223	22234	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49147026
56	NC_005927	TTA	4	24617	24627	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49147026
57	NC_005927	TAA	4	26014	26024	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49147026
58	NC_005927	ATT	4	26834	26845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_005927	TAT	5	27381	27395	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	49147044
60	NC_005927	TAT	4	27456	27467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_005927	ATA	5	27525	27538	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_005927	TTA	4	29350	29361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147047
63	NC_005927	TGA	4	29770	29781	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_005927	ATA	4	30052	30062	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49147048
65	NC_005927	ATT	4	30288	30298	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49147048
66	NC_005927	ATT	4	30316	30327	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147048
67	NC_005927	GAA	5	30621	30635	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	49147049
68	NC_005927	TAA	4	30792	30802	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_005927	CTT	4	31061	31072	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_005927	TTA	4	31699	31711	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	49147024
71	NC_005927	ATT	4	33509	33520	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_005927	TAT	4	34967	34978	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147017
73	NC_005927	TTA	4	35965	35976	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147017
74	NC_005927	TAT	7	36051	36071	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49147017
75	NC_005927	TTC	4	36208	36218	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	49147017
76	NC_005927	AAT	4	38168	38180	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	49147017
77	NC_005927	CTT	4	38647	38657	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_005927	ATT	4	39431	39443	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_005927	AGG	4	42958	42968	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_005927	CTG	4	43146	43158	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
81	NC_005927	CTT	5	43187	43202	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
82	NC_005927	CTT	6	43958	43978	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	Non-Coding
83	NC_005927	AAG	4	44099	44111	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_005927	TCC	5	44539	44553	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
85	NC_005927	TAA	5	45114	45128	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_005927	ATT	5	45289	45304	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_005927	CTT	4	45845	45857	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49147055
88	NC_005927	CTT	4	45890	45903	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49147055
89	NC_005927	AGA	4	45964	45975	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49147055
90	NC_005927	TTA	4	46293	46303	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49147010
91	NC_005927	TTC	4	46424	46436	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_005927	CTT	5	46490	46503	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_005927	TCC	4	48239	48249	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
94	NC_005927	CTT	4	48329	48341	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
95	NC_005927	GAA	5	48362	48376	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_005927	TTC	4	48458	48469	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_005927	AGA	4	48476	48486	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_005927	AAG	4	48625	48636	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_005927	TCC	4	48960	48970	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	49147058
100	NC_005927	TCT	4	49049	49060	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147058
101	NC_005927	ATT	4	49423	49433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49147014
102	NC_005927	TAA	4	51331	51343	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	49147014
103	NC_005927	TAT	4	51657	51667	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49147014
104	NC_005927	TAT	4	52180	52191	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_005927	GCT	4	52250	52261	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_005927	TCT	4	53874	53885	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147086
107	NC_005927	CTT	4	54520	54533	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_005927	AGA	4	55761	55771	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	49147090
109	NC_005927	CTT	5	56073	56087	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	49147085
110	NC_005927	GAA	4	56272	56283	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49147085
111	NC_005927	CTT	4	57222	57233	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147091
112	NC_005927	AAG	4	57520	57531	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_005927	TGC	4	57566	57577	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_005927	CTT	5	57657	57671	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
115	NC_005927	AAG	4	57814	57826	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_005927	CTT	4	58533	58545	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
117	NC_005927	GAA	4	59508	59519	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_005927	TTC	4	60249	60260	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147020
119	NC_005927	TAT	4	60353	60364	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147020
120	NC_005927	CTT	4	60465	60476	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_005927	GAA	4	60820	60831	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49147061
122	NC_005927	CTT	4	62339	62351	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
123	NC_005927	CTT	4	62407	62419	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
124	NC_005927	CTT	5	63526	63540	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
125	NC_005927	CTT	4	63753	63763	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	49147093
126	NC_005927	AAG	4	64301	64312	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49147062
127	NC_005927	CTT	4	64385	64396	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49147062
128	NC_005927	AGA	4	64547	64558	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_005927	AAG	4	64635	64646	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_005927	CTT	4	64778	64790	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
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207	NC_005927	TCC	4	109009	109020	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Moniliophthora perniciosa mitochondrion