ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pseudendoclonium akinetum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005926	ATAA	3	1295	1306	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005926	TAT	4	6108	6119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147160
3	NC_005926	TTTG	3	6162	6173	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	49147160
4	NC_005926	T	15	6240	6254	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	49147160
5	NC_005926	TCGTAA	3	9731	9749	19	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
6	NC_005926	AAAG	3	11072	11082	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_005926	TGT	4	13536	13548	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	49147163
8	NC_005926	TAAACC	3	14072	14089	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49147164
9	NC_005926	TAA	4	16061	16071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49147166
10	NC_005926	GTTA	3	16827	16838	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	49147166
11	NC_005926	TTAA	3	18069	18079	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_005926	CTTT	3	18650	18660	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_005926	TCAA	3	18705	18717	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_005926	ATAC	3	19097	19108	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	49147171
15	NC_005926	TAAC	3	19109	19121	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	49147171
16	NC_005926	AACCAA	3	19127	19145	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10 %	49147171
17	NC_005926	TACA	3	21345	21355	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	49147171
18	NC_005926	TA	6	23024	23034	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49147171
19	NC_005926	CCAA	3	23179	23190	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	49147171
20	NC_005926	TAC	4	23757	23767	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	49147171
21	NC_005926	CGC	4	26148	26158	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	49147171
22	NC_005926	AAT	4	26994	27004	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49147171
23	NC_005926	TTTA	3	27740	27750	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_005926	TAC	5	28173	28187	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
25	NC_005926	AGA	4	28650	28661	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_005926	TAAAAA	3	28800	28818	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
27	NC_005926	TCTTT	4	29520	29539	20	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
28	NC_005926	CTA	4	30791	30801	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	49147174
29	NC_005926	GGTT	3	31186	31196	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_005926	TA	8	31569	31583	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_005926	ACA	4	33862	33873	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	49147178
32	NC_005926	AACA	3	34156	34166	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	49147178
33	NC_005926	AAAAT	3	34200	34214	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	49147178
34	NC_005926	AT	6	34556	34567	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_005926	TAA	5	35919	35933	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	49147180
36	NC_005926	TAGATA	3	37334	37351	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_005926	AAT	4	38907	38918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49147182
38	NC_005926	GAAT	3	39029	39039	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	49147182
39	NC_005926	CCTT	3	41776	41787	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	49147184
40	NC_005926	TTATA	3	46986	46999	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	49147191
41	NC_005926	AT	6	48152	48162	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49147191
42	NC_005926	CTA	4	48516	48527	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	49147191
43	NC_005926	ATTT	3	48981	48993	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_005926	TTTA	3	49905	49915	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_005926	TAATTA	3	52717	52734	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005926	CTA	4	52927	52937	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_005926	AGC	4	57934	57944	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_005926	AATA	3	58155	58166	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005926	TTG	4	59561	59572	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	49147198
50	NC_005926	CTATTT	3	60775	60792	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	49147200
51	NC_005926	GTA	4	61449	61460	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	49147200
52	NC_005926	GTAA	3	63461	63471	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	49147202
53	NC_005926	AAAG	3	63475	63486	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	49147202
54	NC_005926	TTTG	3	64408	64418	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_005926	TTTA	3	65593	65604	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49147203
56	NC_005926	TTTTAA	3	65639	65656	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	49147203
57	NC_005926	AAGT	3	66584	66594	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	49147204
58	NC_005926	ATA	4	69609	69621	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_005926	ATA	4	70104	70115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_005926	ATA	4	70382	70393	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49147207
61	NC_005926	TAT	4	71431	71442	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_005926	CCCG	3	71588	71598	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	49147209
63	NC_005926	A	14	72026	72039	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	49147210
64	NC_005926	TAAA	3	74099	74110	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_005926	AT	6	74821	74832	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_005926	TAT	4	75115	75125	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_005926	AGCT	3	75578	75588	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_005926	TAAAA	3	77076	77089	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	49147212
69	NC_005926	CTAG	3	77152	77164	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	49147212
70	NC_005926	AAAG	3	77201	77212	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	49147212
71	NC_005926	TGGC	3	77595	77606	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	49147212
72	NC_005926	AAAC	3	78054	78064	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	49147212
73	NC_005926	TACAA	3	78256	78269	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	49147212
74	NC_005926	GTTTAG	3	82160	82178	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10 %	49147217
75	NC_005926	TAT	4	85102	85113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49147223
76	NC_005926	TTAT	3	87023	87033	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49147224
77	NC_005926	TTAT	3	87434	87445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49147224
78	NC_005926	CAG	4	90744	90755	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	49147226
79	NC_005926	AAAG	3	90864	90875	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	49147226
80	NC_005926	ATAA	3	92115	92125	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_005926	ATTA	3	93980	93991	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_005926	AAAT	3	94450	94460	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Pseudendoclonium akinetum mitochondrion