ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhyncholestes raphanurus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005829	GTTC	3	2470	2481	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_005829	CTC	4	2650	2661	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
3	NC_005829	TAT	4	2769	2781	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45685678
4	NC_005829	CA	6	4048	4058	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	45685679
5	NC_005829	TAT	4	4647	4658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45685679
6	NC_005829	TCT	4	4777	4787	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45685679
7	NC_005829	ATTC	3	4936	4946	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45685679
8	NC_005829	G	14	5217	5230	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005829	CTT	4	5954	5965	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45685680
10	NC_005829	TAT	4	7173	7185	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45685681
11	NC_005829	AAAT	3	9493	9503	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45685685
12	NC_005829	TAT	4	9539	9550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45685685
13	NC_005829	CAA	4	9745	9756	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45685685
14	NC_005829	GATT	3	9863	9873	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_005829	CTTA	3	10691	10703	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	45685687
16	NC_005829	ATA	4	11894	11905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45685688
17	NC_005829	AT	6	12092	12102	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45685688
18	NC_005829	TAA	4	12352	12363	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45685688
19	NC_005829	TAG	4	12528	12539	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45685688
20	NC_005829	TAA	4	12708	12719	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45685688
21	NC_005829	ATT	4	13559	13570	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45685688
22	NC_005829	TTTA	3	13574	13584	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45685688
23	NC_005829	CCA	4	13664	13675	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	45685689
24	NC_005829	CAA	4	13722	13733	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45685689
25	NC_005829	TTTA	3	14210	14221	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45685690
26	NC_005829	ATT	4	15239	15250	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45685690
27	NC_005829	TA	7	15460	15473	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_005829	TACA	3	15630	15640	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_005829	GTCTAC	24	16185	16328	144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_005829	GTGTAC	51	16185	16490	306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	3 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Rhyncholestes raphanurus mitochondrion