ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ashbya gossypii ATCC 10895 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005789	AATT	3	2	13	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_005789	TATT	4	14	29	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_005789	ATTT	3	35	46	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005789	ATT	4	51	62	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_005789	AAAT	3	607	618	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_005789	AT	7	710	722	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45239021
7	NC_005789	AAT	4	818	829	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45239021
8	NC_005789	TAT	4	827	838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45239021
9	NC_005789	TAT	4	920	930	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45239021
10	NC_005789	ATTA	6	1441	1462	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_005789	TAAT	3	1515	1526	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005789	TAA	4	1609	1621	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_005789	ATAA	6	1671	1695	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_005789	ATA	4	1699	1713	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_005789	TAA	5	1935	1948	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_005789	TTA	4	2540	2550	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45239022
17	NC_005789	GGT	4	2632	2643	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	45239022
18	NC_005789	TA	6	2690	2700	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45239022
19	NC_005789	ATT	4	2890	2901	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45239022
20	NC_005789	TTA	4	3135	3146	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45239022
21	NC_005789	TTAA	3	3572	3582	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_005789	TAAA	4	3802	3817	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_005789	TAT	4	4006	4016	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45239023
24	NC_005789	TTAC	3	4367	4377	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45239023
25	NC_005789	GAA	4	4539	4550	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45239023
26	NC_005789	ACT	4	4589	4600	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	45239023
27	NC_005789	TAA	7	4775	4794	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_005789	ATA	4	5268	5281	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_005789	TTAA	3	5352	5363	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_005789	AATT	3	5495	5505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_005789	TAT	4	5653	5664	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_005789	AATA	3	5672	5684	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_005789	ATAA	3	5791	5802	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_005789	ATTA	4	5857	5872	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_005789	TTAA	6	5884	5908	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_005789	TAAA	6	5906	5930	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45239024
37	NC_005789	TAA	4	5958	5969	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45239024
38	NC_005789	ATA	5	6101	6114	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45239024
39	NC_005789	ATA	4	6184	6195	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45239024
40	NC_005789	ATA	5	6359	6373	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45239024
41	NC_005789	ATA	4	6488	6499	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45239024
42	NC_005789	TAA	4	6579	6589	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45239024
43	NC_005789	TAA	4	6605	6617	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45239024
44	NC_005789	ATA	4	6623	6634	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45239024
45	NC_005789	ATTTA	3	6638	6651	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	45239024
46	NC_005789	TAA	4	6773	6784	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45239024
47	NC_005789	ATA	6	7260	7276	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45239026
48	NC_005789	TTA	4	7361	7372	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45239026
49	NC_005789	ATTTTT	3	7566	7584	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	45239026
50	NC_005789	TAT	4	7968	7979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45239026
51	NC_005789	ATTA	4	8039	8053	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	45239026
52	NC_005789	TAA	4	8217	8227	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_005789	GGTATT	3	8455	8472	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	45239027
54	NC_005789	TTA	4	8599	8609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45239027
55	NC_005789	TAAA	4	8733	8748	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_005789	TTA	4	8838	8849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_005789	AAT	4	9055	9065	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_005789	TAA	4	9125	9135	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_005789	TTATT	3	10031	10046	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	45239028
60	NC_005789	TTC	5	10108	10122	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45239028
61	NC_005789	ATTT	3	10206	10217	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	45239028
62	NC_005789	TATTT	3	10263	10277	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	45239028
63	NC_005789	ATA	5	10301	10316	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_005789	TAATAT	3	10331	10348	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_005789	TA	6	10492	10502	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_005789	TAA	4	10624	10635	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_005789	TTAATA	3	10696	10714	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_005789	TAA	4	11239	11249	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_005789	TAA	4	11257	11268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_005789	TATT	4	11427	11441	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_005789	AAT	4	11498	11509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_005789	ATTA	4	11716	11731	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_005789	ATT	8	12049	12073	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_005789	TAA	4	12451	12463	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_005789	TTA	4	12535	12546	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_005789	TTAA	4	12548	12563	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_005789	TTA	4	12568	12580	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_005789	ATA	4	12704	12714	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_005789	TA	7	12883	12896	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_005789	TTTA	4	12974	12989	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_005789	TTATA	3	13161	13174	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_005789	AT	6	13178	13188	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_005789	ATA	4	13483	13495	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_005789	TAA	4	13494	13505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_005789	ATT	4	13557	13569	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_005789	AAAT	3	13574	13585	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_005789	TA	6	13806	13818	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_005789	TAAA	3	13820	13832	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_005789	TAAAA	3	14031	14045	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_005789	TTA	4	14193	14204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_005789	ATT	5	14540	14555	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_005789	ATA	4	14562	14573	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_005789	ATT	4	14601	14612	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_005789	TAA	4	14961	14972	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_005789	ATA	5	15086	15099	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_005789	TAT	4	15312	15322	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_005789	AT	6	15551	15561	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_005789	AT	7	15564	15576	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_005789	TAA	5	15600	15615	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_005789	TAA	4	15619	15629	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_005789	ATA	4	15917	15927	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_005789	TA	8	16562	16576	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_005789	ATTAAT	3	16581	16599	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_005789	AT	8	16784	16798	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_005789	TTAA	3	16805	16815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_005789	AATATT	3	17014	17031	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_005789	TAA	4	17110	17120	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_005789	TA	7	17206	17220	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_005789	TTA	4	17223	17234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005789	TA	11	17257	17277	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_005789	AT	6	17311	17321	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_005789	TTA	4	17387	17399	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_005789	ATA	4	17439	17451	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_005789	ATAGT	3	17595	17610	16	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_005789	AGTA	3	17675	17686	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005789	ATT	5	17703	17717	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_005789	ATA	4	17737	17747	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_005789	AAT	4	17748	17759	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_005789	ATA	4	17892	17904	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_005789	TA	11	17899	17920	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_005789	TA	6	17958	17968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_005789	ATA	4	17996	18007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_005789	TAA	4	18033	18044	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_005789	TAA	4	18085	18097	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_005789	TA	7	18157	18170	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_005789	AT	7	18314	18326	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_005789	TAA	4	18343	18355	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_005789	TATAGA	3	18424	18442	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_005789	TTAA	3	18491	18502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_005789	TTAA	3	18817	18827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_005789	ATA	4	18834	18846	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_005789	TA	10	18848	18866	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
133	NC_005789	ATA	5	18924	18937	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_005789	AAT	4	18944	18956	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_005789	AT	7	18990	19004	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_005789	TAAATA	3	19061	19079	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_005789	TATAA	6	19410	19440	31	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_005789	ATA	5	19471	19486	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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163	NC_005789	AATT	3	23166	23176	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ashbya gossypii ATCC 10895 mitochondrion