ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Drosophila simulans mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005781	AT	6	161	172	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_005781	ATA	4	381	392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45332830
3	NC_005781	T	14	841	854	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45332830
4	NC_005781	TAA	4	1071	1082	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45332830
5	NC_005781	TATT	3	1098	1109	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45332830
6	NC_005781	TTTAT	3	1246	1260	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	45332830
7	NC_005781	TTA	7	2047	2067	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45360135
8	NC_005781	GGA	4	2140	2150	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	45360135
9	NC_005781	ATT	5	3296	3309	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45332836
10	NC_005781	ATT	7	3934	3955	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45332831
11	NC_005781	ATT	4	3990	4001	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45332831
12	NC_005781	TTAA	3	4121	4132	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45332832
13	NC_005781	TTAAT	3	4300	4314	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	45332832
14	NC_005781	TTTAAC	4	4359	4382	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	45332832
15	NC_005781	AT	6	4853	4863	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45332833
16	NC_005781	ATT	4	4865	4876	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45332833
17	NC_005781	TTAC	3	4950	4961	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	45332833
18	NC_005781	TTTAT	3	4994	5007	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45332833
19	NC_005781	TTTA	3	5228	5238	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45332833
20	NC_005781	ATTA	4	5583	5597	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_005781	TA	6	5600	5610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_005781	ATT	5	5890	5904	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45332834
23	NC_005781	TA	13	6016	6041	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_005781	CTTT	3	6274	6284	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_005781	TAA	4	6349	6359	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_005781	ATTAAA	3	6483	6500	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45332837
27	NC_005781	CATA	3	6797	6807	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	45332837
28	NC_005781	AATT	3	6866	6877	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45332837
29	NC_005781	TTA	4	7336	7347	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45332837
30	NC_005781	ATA	6	7441	7458	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	45332837
31	NC_005781	AAG	4	7585	7596	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45332837
32	NC_005781	ATT	4	7644	7655	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45332837
33	NC_005781	AAG	4	7730	7740	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45332837
34	NC_005781	ATCC	3	7840	7852	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	45332837
35	NC_005781	TAA	4	7879	7891	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45332837
36	NC_005781	TAT	4	7939	7950	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45332837
37	NC_005781	TAAA	3	8156	8167	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	45332837
38	NC_005781	ATA	5	8441	8455	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45332838
39	NC_005781	AAAAT	3	9257	9270	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45332838
40	NC_005781	TAA	5	9309	9322	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45332838
41	NC_005781	TAA	4	9330	9341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45332838
42	NC_005781	TAA	4	9381	9392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45332838
43	NC_005781	AT	6	9540	9550	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45332838
44	NC_005781	TAA	4	9570	9581	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45332838
45	NC_005781	A	13	9580	9592	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45332838
46	NC_005781	TAAA	5	9743	9763	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45332839
47	NC_005781	TAAAA	3	9845	9858	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45332839
48	NC_005781	ATTT	3	11145	11155	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45332841
49	NC_005781	AAAT	3	11815	11825	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45332842
50	NC_005781	AAAT	3	11947	11957	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45332842
51	NC_005781	ATAAAA	3	12199	12216	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	45332842
52	NC_005781	TAAAGA	3	12454	12471	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	45332842
53	NC_005781	TAA	4	12672	12684	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45332842
54	NC_005781	TCAT	3	13079	13090	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_005781	A	12	13191	13202	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_005781	TAAA	3	13254	13264	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_005781	TTAA	3	13541	13551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_005781	TAT	5	14438	14452	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_005781	TTA	4	14723	14734	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Drosophila simulans mitochondrion