ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gomphiocephalus hodgsoni mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005438	TCT	4	193	204	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_005438	ATA	5	963	977	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42632286
3	NC_005438	TCTT	3	1160	1171	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	42632286
4	NC_005438	ATT	4	1176	1187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42632286
5	NC_005438	TAT	4	1911	1922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42632287
6	NC_005438	CTT	5	1990	2005	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	42632287
7	NC_005438	TACT	3	2033	2043	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42632287
8	NC_005438	AGG	4	2079	2090	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	42632287
9	NC_005438	CAAA	3	2199	2209	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	42632287
10	NC_005438	ATTC	3	2590	2601	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42632287
11	NC_005438	TA	6	3268	3278	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42632288
12	NC_005438	AATTC	3	3449	3463	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	42632288
13	NC_005438	TAA	4	4097	4108	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42632290
14	NC_005438	TTTAT	3	4227	4240	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42632290
15	NC_005438	ATTAA	3	4694	4709	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	42632290
16	NC_005438	TTG	4	5447	5458	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42632291
17	NC_005438	AATT	3	5551	5562	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_005438	ATAA	3	6358	6369	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	42632293
19	NC_005438	AATA	3	6555	6567	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	42632293
20	NC_005438	TAA	4	7284	7296	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42632293
21	NC_005438	AT	6	7497	7507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42632293
22	NC_005438	AATA	3	7960	7971	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42632293
23	NC_005438	TAT	4	8539	8550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42632294
24	NC_005438	AAAAAT	3	8884	8902	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	42632294
25	NC_005438	TAA	4	9169	9179	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42632294
26	NC_005438	ATTAAT	3	9182	9199	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	42632294
27	NC_005438	AATAAA	3	9717	9734	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	42632295
28	NC_005438	AAGT	3	9746	9756	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42632295
29	NC_005438	TAT	4	9916	9927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42632296
30	NC_005438	ATTT	3	10042	10054	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	42632296
31	NC_005438	TAA	4	10135	10146	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42632296
32	NC_005438	ATA	4	11080	11091	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42632297
33	NC_005438	CTATT	3	11276	11291	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	42632297
34	NC_005438	ATAAA	3	12128	12141	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42632298
35	NC_005438	TAA	4	12555	12567	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42632298
36	NC_005438	ATTT	3	13355	13366	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005438	TTAA	3	13731	13742	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005438	AAT	5	13764	13777	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_005438	TTTAT	4	13821	13839	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
40	NC_005438	TAAT	3	14549	14560	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_005438	TATT	3	14606	14617	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005438	AAAATA	3	14685	14702	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_005438	TATTTT	3	14755	14773	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
44	NC_005438	TATT	3	14898	14909	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gomphiocephalus hodgsoni mitochondrion