ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Emiliania huxleyi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005332	AAAT	3	92	103	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_005332	AGGA	3	1571	1581	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_005332	AAAT	3	2556	2566	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_005332	TTTA	3	2607	2618	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_005332	AATTA	3	2700	2714	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_005332	AT	7	2844	2856	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_005332	ATTT	3	2996	3006	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_005332	CAT	4	4154	4164	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_005332	TTTA	3	4650	4662	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	41203461
10	NC_005332	TTTAT	3	5256	5271	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_005332	TTTG	3	5786	5797	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	41203462
12	NC_005332	CTTT	3	7132	7144	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	41203462
13	NC_005332	TTGT	3	7232	7243	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	41203462
14	NC_005332	TTG	4	7807	7818	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	41203462
15	NC_005332	CAAA	3	8094	8104	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	41203462
16	NC_005332	ATTT	3	9462	9472	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	41203462
17	NC_005332	AATT	3	9545	9556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	41203462
18	NC_005332	TCT	4	9609	9619	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	41203462
19	NC_005332	TTGC	4	10156	10171	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	41203462
20	NC_005332	TATT	3	11038	11048	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	41203462
21	NC_005332	TTTA	3	12372	12383	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	41203462
22	NC_005332	TTA	4	12992	13003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	41203462
23	NC_005332	TTG	4	13233	13244	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	41203462
24	NC_005332	TAG	4	13677	13688	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	41203462
25	NC_005332	ATT	4	13705	13715	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	41203462
26	NC_005332	TAT	4	15113	15123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	41203462
27	NC_005332	TCT	4	15264	15274	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	41203462
28	NC_005332	CTTT	3	15499	15510	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	41203462
29	NC_005332	TGTT	3	16318	16328	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	41203462
30	NC_005332	ATA	4	17101	17111	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	41203472
31	NC_005332	TTCTA	3	17472	17486	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	41203473
32	NC_005332	TTTCA	3	18023	18036	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	41203474
33	NC_005332	CTG	5	18101	18115	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	41203474
34	NC_005332	TTA	4	19035	19046	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_005332	GTT	4	19317	19329	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	41203475
36	NC_005332	ATT	4	19731	19742	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	41203475
37	NC_005332	TTTA	3	20067	20079	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	41203475
38	NC_005332	TAAT	3	21095	21106	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005332	TAAA	4	21503	21519	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_005332	TTTTA	3	23559	23572	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	41203479
41	NC_005332	TGA	4	23643	23654	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	41203479
42	NC_005332	TTTC	3	23728	23738	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	41203479
43	NC_005332	TAAAT	3	24049	24062	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	41203479
44	NC_005332	CAAAA	3	24317	24330	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
45	NC_005332	CAAAA	3	24565	24578	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
46	NC_005332	CAAAA	3	24811	24824	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
47	NC_005332	CAAAA	3	25059	25072	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
48	NC_005332	CAAAA	3	25305	25318	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
49	NC_005332	TAA	4	25724	25734	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_005332	TAA	4	25871	25881	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_005332	TAA	4	26018	26028	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_005332	TAA	4	26165	26175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_005332	TAA	4	26312	26322	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_005332	AT	7	26428	26441	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_005332	TA	6	26465	26475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_005332	TTTC	3	26713	26723	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_005332	CTA	4	27554	27565	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	41203480
58	NC_005332	AATT	3	27624	27635	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	41203480
59	NC_005332	TA	6	28182	28192	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Emiliania huxleyi mitochondrion