ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Haemaphysalis flava mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005292	AAT	4	91	102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39653763
2	NC_005292	AGTT	3	2518	2528	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	39653764
3	NC_005292	AAAT	3	2578	2589	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39653764
4	NC_005292	ATT	4	2778	2789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653765
5	NC_005292	ATTT	3	2935	2947	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	39653765
6	NC_005292	TTAA	3	3471	3482	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_005292	A	14	3625	3638	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39653766
8	NC_005292	AAAT	3	3815	3825	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653767
9	NC_005292	TAT	4	3876	3887	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653767
10	NC_005292	ATCT	3	4163	4173	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39653767
11	NC_005292	TAT	4	4559	4571	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39653768
12	NC_005292	TTA	4	4789	4800	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653768
13	NC_005292	TCAATT	3	5172	5189	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	39653769
14	NC_005292	ATT	5	5358	5371	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39653769
15	NC_005292	ATTA	3	5427	5439	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39653769
16	NC_005292	ATA	4	5950	5960	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39653770
17	NC_005292	ATT	4	5961	5972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653770
18	NC_005292	ATAA	4	6409	6423	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	39653770
19	NC_005292	ATT	4	6474	6485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	39653770
20	NC_005292	AT	8	7159	7174	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_005292	ATTA	3	7476	7486	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_005292	ATTT	3	8175	8185	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_005292	ATTC	3	8213	8225	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
24	NC_005292	TAA	4	9293	9303	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39653771
25	NC_005292	TAAA	3	9746	9756	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653771
26	NC_005292	TAT	4	9820	9831	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653771
27	NC_005292	ATT	5	10089	10103	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39653771
28	NC_005292	AAAT	3	10744	10755	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39653771
29	NC_005292	AAAT	3	10863	10874	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39653771
30	NC_005292	TA	7	11121	11136	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39653772
31	NC_005292	AATA	3	11800	11811	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39653772
32	NC_005292	A	20	11965	11984	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	39653772
33	NC_005292	TAT	5	12016	12030	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39653772
34	NC_005292	TAAA	3	12038	12048	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653772
35	NC_005292	AAAT	3	12399	12410	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39653773
36	NC_005292	TAT	4	12946	12957	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653774
37	NC_005292	ATA	4	13044	13054	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39653774
38	NC_005292	TA	6	13370	13381	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39653775
39	NC_005292	TAT	4	13986	13997	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653775
40	NC_005292	AATA	3	14016	14026	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653775
41	NC_005292	TTAT	3	14173	14183	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39653775

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Haemaphysalis flava mitochondrion