ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Carios capensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005291	TAAGC	3	7	21	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
2	NC_005291	TTAT	3	81	93	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	39653749
3	NC_005291	T	12	130	141	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	39653749
4	NC_005291	AAT	5	334	347	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39653749
5	NC_005291	AATT	3	474	484	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39653749
6	NC_005291	ACT	4	634	644	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39653749
7	NC_005291	TAA	4	955	965	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39653749
8	NC_005291	CTC	4	3711	3722	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	39653753
9	NC_005291	ATT	4	4485	4496	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39653754
10	NC_005291	ATT	4	4595	4607	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39653754
11	NC_005291	ATT	4	5392	5402	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39653755
12	NC_005291	ATA	4	5736	5748	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_005291	AAAT	3	6151	6161	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653756
14	NC_005291	AAT	4	6176	6187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39653756
15	NC_005291	CAA	4	7363	7375	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	39653756
16	NC_005291	A	15	7388	7402	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39653756
17	NC_005291	AATA	3	7443	7454	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39653756
18	NC_005291	ATTT	3	7682	7693	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39653757
19	NC_005291	TA	6	7735	7748	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39653757
20	NC_005291	AAAT	3	8579	8589	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653757
21	NC_005291	TAAA	3	9082	9093	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39653758
22	NC_005291	ATTAT	3	9368	9381	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	39653759
23	NC_005291	AT	16	9404	9434	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39653759
24	NC_005291	AAT	4	9646	9657	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39653759
25	NC_005291	ATTTA	3	9658	9672	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	39653759
26	NC_005291	AATT	3	9777	9787	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39653760
27	NC_005291	TTAT	3	10482	10493	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39653760
28	NC_005291	A	16	10948	10963	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39653761
29	NC_005291	AAAC	3	11087	11098	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	39653761
30	NC_005291	TCAT	3	11348	11360	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	39653761
31	NC_005291	AAAT	3	11367	11377	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653761
32	NC_005291	ATAA	3	11520	11530	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39653761
33	NC_005291	ACATTA	3	11586	11603	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	39653761
34	NC_005291	ATTTA	3	13008	13021	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_005291	TAA	4	13466	13477	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_005291	TAAC	3	13894	13905	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_005291	TA	13	14026	14050	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Carios capensis mitochondrion