ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Talaromyces marneffei mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005256	TTTA	3	634	645	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38639899
2	NC_005256	TTTA	3	1269	1281	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38639899
3	NC_005256	ATT	4	1305	1316	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639899
4	NC_005256	TAAT	4	1890	1905	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38639899
5	NC_005256	TA	6	2144	2154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38639899
6	NC_005256	ATT	5	2412	2425	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38639900
7	NC_005256	ATTAT	3	2816	2829	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	38639900
8	NC_005256	TTAT	3	2876	2886	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38639900
9	NC_005256	TTATT	3	3044	3058	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	38639900
10	NC_005256	ATTTTA	3	3180	3197	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38639900
11	NC_005256	AATC	3	3397	3409	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	38639900
12	NC_005256	TAAA	3	3511	3521	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38639900
13	NC_005256	TTTA	3	3702	3713	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38639900
14	NC_005256	AATT	3	3814	3825	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38639900
15	NC_005256	TAT	4	3943	3955	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38639900
16	NC_005256	T	13	4107	4119	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_005256	ATATTT	3	4197	4215	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_005256	AATT	3	4346	4357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38639901
19	NC_005256	TA	9	4541	4558	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_005256	TA	7	4686	4699	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_005256	CAAA	3	5304	5314	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38639902
22	NC_005256	ATAC	3	5611	5622	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38639902
23	NC_005256	ATAA	3	5958	5969	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38639902
24	NC_005256	TA	6	6213	6223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38639902
25	NC_005256	ATTT	3	6576	6587	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38639902
26	NC_005256	TATAT	3	6773	6786	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	38639902
27	NC_005256	TAT	4	7237	7247	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_005256	TAA	4	7251	7263	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_005256	TTATAA	3	7369	7387	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
30	NC_005256	ATTT	5	7483	7502	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_005256	AT	7	7532	7545	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38639904
32	NC_005256	TTA	4	8019	8029	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38639904
33	NC_005256	TTA	4	8502	8513	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639904
34	NC_005256	TCT	4	8872	8883	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38639904
35	NC_005256	TA	7	9220	9233	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_005256	TAT	5	9260	9274	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38639905
37	NC_005256	TATT	3	9384	9395	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38639905
38	NC_005256	AAT	4	9519	9530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639905
39	NC_005256	TTA	4	9688	9699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639905
40	NC_005256	TATT	3	10370	10380	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38639905
41	NC_005256	AT	12	10893	10914	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_005256	T	12	10962	10973	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	38639906
43	NC_005256	TAA	4	11291	11302	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639907
44	NC_005256	TAA	6	11322	11338	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38639907
45	NC_005256	TTA	5	12239	12252	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_005256	GATAAT	3	12713	12730	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_005256	AATG	3	13028	13038	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_005256	TA	8	13972	13987	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_005256	TAA	5	14105	14120	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38639908
50	NC_005256	TTA	4	14176	14187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639908
51	NC_005256	ATA	4	14634	14644	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38639908
52	NC_005256	TTAA	3	14679	14689	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_005256	T	12	14727	14738	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	38639909
54	NC_005256	CTG	4	14837	14848	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38639909
55	NC_005256	TAT	5	15164	15178	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38639909
56	NC_005256	TA	6	15333	15344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_005256	ATC	4	16061	16072	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38639910
58	NC_005256	TTAAA	4	16468	16486	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_005256	AT	7	16710	16723	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_005256	TAAA	3	17244	17254	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_005256	ATA	4	17327	17337	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_005256	TAAAAA	3	17474	17492	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
63	NC_005256	AT	7	18258	18271	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_005256	AT	8	18518	18532	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_005256	AGTA	3	18690	18701	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_005256	TAA	4	19393	19404	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_005256	TA	7	19549	19561	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_005256	TA	6	19717	19727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_005256	TAT	7	19907	19927	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_005256	TAA	4	20040	20051	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639911
71	NC_005256	AAGAA	3	20757	20770	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	38639911
72	NC_005256	TA	6	21261	21271	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_005256	ATT	4	21275	21286	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_005256	AT	16	21820	21853	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_005256	TA	14	23224	23251	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_005256	ATT	5	24631	24644	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38639912
77	NC_005256	A	13	24979	24991	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38639912
78	NC_005256	TAT	4	25176	25188	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38639912
79	NC_005256	TTTA	3	25224	25234	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38639912
80	NC_005256	ATTA	3	25235	25245	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38639912
81	NC_005256	TA	6	25671	25681	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38639912
82	NC_005256	AATAT	3	26045	26059	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	38639912
83	NC_005256	AAT	4	26132	26143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639912
84	NC_005256	TTA	4	26493	26504	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	38639912
85	NC_005256	TGG	4	26582	26593	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38639912
86	NC_005256	TTAGTT	3	26979	26997	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10 %	38639912
87	NC_005256	AAT	4	27596	27607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639912
88	NC_005256	AT	12	27696	27718	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38639912
89	NC_005256	TAAA	5	28718	28738	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38639912
90	NC_005256	ATTT	4	29431	29446	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	38639912
91	NC_005256	TAA	4	29506	29517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639912
92	NC_005256	AAAAT	3	29715	29728	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38639912
93	NC_005256	TAT	4	30889	30900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639912
94	NC_005256	AAAT	3	31012	31022	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38639912
95	NC_005256	GTTT	3	31522	31533	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38639912
96	NC_005256	TTAA	3	31572	31583	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38639912
97	NC_005256	ATA	4	31983	31994	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38639912
98	NC_005256	TAT	4	32045	32056	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639912
99	NC_005256	A	17	32609	32625	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	38639912
100	NC_005256	AT	14	32736	32763	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38639912
101	NC_005256	ATT	4	32795	32807	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38639912
102	NC_005256	AT	9	33822	33839	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_005256	TTTTA	3	34232	34245	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	38639921
104	NC_005256	TA	6	34577	34587	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_005256	ATA	4	34694	34704	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38639922
106	NC_005256	ATT	4	34887	34897	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38639922
107	NC_005256	TTTA	3	34923	34934	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38639922
108	NC_005256	TTA	4	35314	35325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38639922

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Talaromyces marneffei mitochondrion