ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chara vulgaris mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005255	TAGATA	4	48	69	22	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_005255	CG	6	498	508	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_005255	GGAT	3	683	693	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_005255	AAGA	3	2721	2733	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_005255	ATTG	3	3117	3128	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005255	GAT	4	3396	3406	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_005255	GAT	4	4506	4516	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_005255	AACA	3	5393	5403	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_005255	AGAAA	5	6769	6793	25	80 %	0 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_005255	ACA	4	7288	7298	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_005255	TAA	4	7719	7730	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38638300
12	NC_005255	GTTT	3	7901	7912	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38638300
13	NC_005255	ACA	4	8529	8540	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_005255	CT	6	8684	8695	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_005255	GATA	3	8914	8926	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_005255	TCATA	3	9087	9100	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_005255	GATAA	3	10116	10129	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_005255	ATAC	3	10174	10189	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
19	NC_005255	TTA	4	10796	10806	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38638274
20	NC_005255	ATAA	5	10806	10826	21	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	38638274
21	NC_005255	CATTT	3	11939	11954	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	38638274
22	NC_005255	AGT	4	12173	12184	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38638274
23	NC_005255	AAAT	3	14272	14283	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005255	TTTC	3	14944	14954	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_005255	TTTA	3	16365	16377	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38638305
26	NC_005255	TTTCCT	3	16951	16968	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	38638288
27	NC_005255	ATA	4	17960	17970	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38638299
28	NC_005255	GC	6	18668	18678	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	38638299
29	NC_005255	GCT	4	18689	18699	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	38638299
30	NC_005255	TTCTT	3	19548	19562	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	38638289
31	NC_005255	TTC	4	21309	21320	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38638286
32	NC_005255	ATTT	3	21852	21862	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38638286
33	NC_005255	AT	6	21877	21888	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38638286
34	NC_005255	TTG	4	22111	22123	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_005255	ATCT	3	23694	23704	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38638281
36	NC_005255	ATAG	3	27831	27842	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005255	TTGT	3	28094	28104	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38638271
38	NC_005255	AAC	4	28215	28226	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38638271
39	NC_005255	T	12	30719	30730	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_005255	TTGA	3	31160	31170	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_005255	CTAT	3	31577	31588	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38638284
42	NC_005255	GAT	4	32685	32695	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38638284
43	NC_005255	TAT	4	33756	33766	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38638282
44	NC_005255	TA	6	34166	34176	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38638282
45	NC_005255	GCG	4	35088	35099	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	38638282
46	NC_005255	GTAT	3	35274	35284	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38638282
47	NC_005255	AT	7	35330	35342	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38638282
48	NC_005255	TTGTAT	3	35641	35657	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	38638282
49	NC_005255	TTTG	3	38996	39006	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_005255	AT	7	39076	39088	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_005255	GAAT	3	39163	39174	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005255	TTTTC	4	39356	39375	20	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
53	NC_005255	CAC	4	39539	39549	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
54	NC_005255	TGGG	3	39552	39564	13	0 %	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_005255	GGC	4	42298	42310	13	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	38638277
56	NC_005255	GAAG	5	44759	44778	20	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005255	TAG	4	44808	44819	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_005255	A	12	45193	45204	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38638279
59	NC_005255	TAA	4	45413	45424	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38638279
60	NC_005255	TAA	4	49475	49485	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38638275
61	NC_005255	GCT	4	49833	49843	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	38638275
62	NC_005255	GTTTG	3	50671	50684	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_005255	AAC	4	51215	51225	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	38638307
64	NC_005255	AACC	3	52006	52016	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	38638307
65	NC_005255	GAAAA	3	52490	52504	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	38638307
66	NC_005255	A	13	52697	52709	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38638307
67	NC_005255	AGAAA	3	53088	53102	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	38638308
68	NC_005255	TAAA	3	53115	53126	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38638308
69	NC_005255	A	13	53595	53607	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38638309
70	NC_005255	CTA	4	53796	53806	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38638309
71	NC_005255	ACA	5	54111	54125	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	38638309
72	NC_005255	TGG	4	55213	55224	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38638292
73	NC_005255	TAAA	3	55352	55363	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38638292
74	NC_005255	AAAG	3	56139	56149	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38638273
75	NC_005255	ATAAA	3	56990	57003	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38638276
76	NC_005255	AGG	4	59083	59094	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	38638276
77	NC_005255	GGAT	3	59637	59648	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	38638276
78	NC_005255	ATTG	5	62876	62896	21	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38638276
79	NC_005255	CAAA	3	63638	63649	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38638276
80	NC_005255	TTA	4	63687	63697	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_005255	AATGAA	3	64439	64457	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	38638302

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