ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida parapsilosis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005253	TA	6	105	115	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_005253	TA	6	362	373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_005253	ATTT	3	375	387	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_005253	AT	17	388	421	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_005253	TAT	5	414	427	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_005253	TAT	4	485	495	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_005253	TTATA	3	501	515	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005253	CATT	3	551	561	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_005253	TA	6	843	853	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_005253	TA	6	1100	1111	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_005253	ATTT	3	1113	1125	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_005253	AT	17	1126	1159	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_005253	TAT	5	1152	1165	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_005253	TAT	4	1223	1233	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_005253	TTATA	3	1239	1253	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005253	CATT	3	1289	1299	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_005253	TAT	4	1448	1458	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_005253	AT	6	1503	1514	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_005253	AT	7	1733	1746	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_005253	TA	6	1762	1775	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_005253	AT	7	1824	1837	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_005253	ATA	4	1873	1884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_005253	AATA	3	1961	1972	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005253	ATA	4	2376	2386	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38640856
25	NC_005253	TAAA	3	2406	2417	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38640856
26	NC_005253	ATA	4	2533	2545	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640856
27	NC_005253	ATAA	3	2827	2839	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38640856
28	NC_005253	TAA	4	2863	2875	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640856
29	NC_005253	AAT	4	2947	2959	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640856
30	NC_005253	TAA	4	3342	3354	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640856
31	NC_005253	AAT	4	3373	3383	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38640856
32	NC_005253	ATA	5	3384	3397	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640856
33	NC_005253	TAA	5	3435	3450	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38640856
34	NC_005253	TAA	4	3706	3716	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38640856
35	NC_005253	TAT	4	3757	3767	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38640856
36	NC_005253	AT	8	3812	3828	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_005253	TAAA	4	4058	4073	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_005253	AATTA	4	4151	4170	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
39	NC_005253	TAA	4	4177	4188	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_005253	AGA	4	4410	4421	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38640857
41	NC_005253	GTAAA	3	4482	4495	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	38640857
42	NC_005253	AT	6	5009	5019	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38640857
43	NC_005253	AT	6	5030	5040	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38640857
44	NC_005253	TA	8	5078	5094	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38640857
45	NC_005253	AT	6	5106	5116	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38640857
46	NC_005253	AT	14	5145	5170	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38640857
47	NC_005253	AT	7	5352	5365	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38640857
48	NC_005253	ATT	4	5424	5435	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640857
49	NC_005253	TAA	4	5608	5619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38640857
50	NC_005253	GTA	4	5892	5902	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38640857
51	NC_005253	ATT	4	6091	6102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640857
52	NC_005253	AAAAGA	3	6449	6466	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	38640857
53	NC_005253	AGT	4	6639	6649	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38640857
54	NC_005253	TA	6	6720	6731	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38640857
55	NC_005253	TA	7	7098	7110	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38640857
56	NC_005253	TTA	4	7261	7272	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640857
57	NC_005253	TAA	4	7352	7365	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640857
58	NC_005253	GA	6	7474	7484	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38640857
59	NC_005253	TAA	4	7568	7579	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38640857
60	NC_005253	ATAAA	4	8609	8627	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	38640860
61	NC_005253	ATTT	3	8720	8730	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38640860
62	NC_005253	ATA	4	8790	8802	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38640860
63	NC_005253	AT	6	9036	9046	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_005253	AT	12	9550	9572	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_005253	AT	11	9666	9686	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_005253	AT	6	9801	9811	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_005253	AT	8	9815	9832	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_005253	TA	7	9936	9951	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_005253	TA	6	10467	10478	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_005253	AT	7	10513	10528	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_005253	AT	6	10995	11006	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_005253	CTA	4	11128	11138	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_005253	TA	6	11733	11743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_005253	TA	13	12120	12143	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_005253	TTTAT	4	12242	12261	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_005253	TA	7	12353	12365	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_005253	TAT	7	15949	15969	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38640861
78	NC_005253	ATT	4	15992	16003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640861
79	NC_005253	TAA	4	16769	16780	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38640861
80	NC_005253	ATTT	3	16823	16834	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38640861
81	NC_005253	ATTTAA	3	17269	17287	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38640861
82	NC_005253	TA	8	17369	17384	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38640861
83	NC_005253	AT	7	17410	17423	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38640861
84	NC_005253	ATA	5	17447	17461	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38640861
85	NC_005253	AAT	4	17556	17566	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38640861
86	NC_005253	TATT	3	17567	17578	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38640861
87	NC_005253	TAT	5	17650	17665	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38640861
88	NC_005253	TA	6	17958	17968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38640861
89	NC_005253	TAA	4	18167	18178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38640861
90	NC_005253	TAA	4	18278	18289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38640861
91	NC_005253	TAT	4	18328	18339	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640861
92	NC_005253	TA	6	18664	18675	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38640861
93	NC_005253	ATAA	3	19008	19018	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38640861
94	NC_005253	ATT	4	19487	19499	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38640861
95	NC_005253	ATTT	3	20050	20061	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_005253	ATA	4	20105	20115	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_005253	GA	6	20116	20127	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_005253	AAAT	3	20256	20266	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_005253	AT	6	20403	20413	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	90995398
100	NC_005253	AT	6	21001	21011	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	90995398
101	NC_005253	AAT	4	21128	21138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	90995398
102	NC_005253	ATT	4	21355	21366	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	90995398
103	NC_005253	TA	6	21612	21622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	90995398
104	NC_005253	AT	6	21639	21652	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	90995398
105	NC_005253	ATAA	4	21654	21668	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_005253	AT	7	21972	21985	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_005253	AAATAT	3	22153	22170	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_005253	TA	6	22570	22581	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_005253	TTTA	4	22883	22898	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_005253	TATT	4	23174	23189	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005253	TTA	4	23508	23518	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38640867
112	NC_005253	TTATAA	4	23551	23574	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_005253	TA	10	23586	23606	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_005253	TATT	5	23615	23634	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_005253	AAAT	3	23791	23802	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_005253	TTAA	3	23815	23825	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_005253	TA	7	23841	23853	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_005253	GTA	4	23874	23885	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38640868
119	NC_005253	ATT	4	24031	24042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640868
120	NC_005253	GCT	4	24472	24483	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38640869
121	NC_005253	TATT	3	25223	25234	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38640869
122	NC_005253	TAT	7	25245	25264	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	38640869
123	NC_005253	TAT	4	25275	25285	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_005253	AAT	4	25368	25378	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_005253	TAT	4	25497	25507	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_005253	AT	11	25703	25723	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_005253	AAATAA	3	25823	25840	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
128	NC_005253	TAT	4	26268	26278	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38640870
129	NC_005253	TA	6	26661	26674	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_005253	TTTA	3	26678	26689	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_005253	ATTT	3	26813	26825	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_005253	AT	6	26934	26944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_005253	AT	6	27042	27055	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_005253	ATAA	3	27221	27232	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_005253	ATA	4	27334	27344	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_005253	TAA	4	27357	27369	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_005253	TA	6	27376	27387	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_005253	AAATA	4	27406	27425	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	38640871
139	NC_005253	TAT	6	27444	27460	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38640871
140	NC_005253	TAT	4	27504	27515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38640871
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150	NC_005253	TAT	4	29458	29472	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
151	NC_005253	TA	7	29479	29491	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
152	NC_005253	TA	6	29671	29682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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162	NC_005253	TA	6	30912	30923	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
163	NC_005253	ATAA	3	30940	30951	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_005253	AATG	3	31447	31457	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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171	NC_005253	TA	11	31593	31618	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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174	NC_005253	AATG	3	32185	32195	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
175	NC_005253	AATAT	4	32229	32248	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
176	NC_005253	TAA	4	32252	32262	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
177	NC_005253	ATA	5	32319	32332	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
178	NC_005253	TA	11	32331	32356	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
179	NC_005253	AT	7	32374	32386	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
180	NC_005253	TAA	5	32678	32693	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida parapsilosis mitochondrion