ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_005087	TA	7	1529	1541	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
2	NC_005087	AT	9	5872	5888	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34501389
3	NC_005087	AT	7	7264	7276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
4	NC_005087	AT	6	7290	7301	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34501389
5	NC_005087	TA	7	8433	8446	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
6	NC_005087	TA	7	9737	9749	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
7	NC_005087	TA	7	11462	11474	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
8	NC_005087	TA	7	11477	11489	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
9	NC_005087	AT	7	12761	12774	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501389
10	NC_005087	AT	17	14217	14250	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_005087	AT	12	14292	14314	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_005087	AT	6	15566	15576	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_005087	AT	13	15904	15929	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_005087	TA	6	18718	18729	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34501401
15	NC_005087	TA	6	18910	18920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34501401
16	NC_005087	TA	6	21519	21530	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34501403
17	NC_005087	TA	6	29340	29351	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_005087	AT	6	32054	32064	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_005087	TA	6	34565	34575	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34501414
20	NC_005087	AT	7	41197	41210	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_005087	CT	6	41927	41937	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_005087	TA	8	56768	56782	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_005087	TA	7	56927	56940	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_005087	AT	6	59591	59602	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_005087	AG	6	60195	60205	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_005087	AT	8	61723	61738	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_005087	AT	8	65830	65844	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_005087	AT	7	73929	73941	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34501435
29	NC_005087	AT	6	77906	77917	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_005087	AT	12	79720	79742	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_005087	AT	7	79835	79847	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_005087	TA	7	83073	83086	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_005087	AT	6	97185	97195	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_005087	AT	7	97726	97739	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_005087	AT	6	98031	98041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_005087	TA	6	98412	98422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_005087	TA	7	102349	102362	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_005087	TA	6	103262	103272	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34501456

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast