Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_005087GTA43533641233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34501389
2NC_005087TAT44754851133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501389
3NC_005087TTA4292629361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501389
4NC_005087TAT4357135811133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501389
5NC_005087TAA4440844181166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501389
6NC_005087TCT485178527110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34501389
7NC_005087TAA411415114261266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501389
8NC_005087AGA411670116811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34501389
9NC_005087ATA413875138851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_005087ATA414270142811266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_005087GCA414682146941333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %34501390
12NC_005087GTT41501715027110 %66.67 %33.33 %0 %9 %146216940
13NC_005087ATA715483155032166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_005087ATT415515155261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_005087TAT516214162291633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_005087ATT416255162671333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
17NC_005087AAT421273212841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501403
18NC_005087AAT423273232831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501406
19NC_005087AAT426249262591166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_005087AGA427634276461366.67 %0 %33.33 %0 %7 %34501408
21NC_005087TAA428518285291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_005087TAA428618286291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_005087ATT529293293071533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_005087TAA431991320011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_005087ATA432144321541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_005087TAT532582325971633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_005087ATA435497355081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_005087ATA535670356831466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_005087CAT436632366421133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34501415
30NC_005087GTG43727737288120 %33.33 %66.67 %0 %8 %34501415
31NC_005087ATG438136381461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34501416
32NC_005087TAA439538395491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501416
33NC_005087TAA440415404261266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_005087ATA444230442411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501420
35NC_005087AAT447688476991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501421
36NC_005087TAT449802498131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34501421
37NC_005087ATT450536505461133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501421
38NC_005087TCT45111251122110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34501421
39NC_005087TAA452948529601366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
40NC_005087TAA552963529771566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
41NC_005087TAT452984529951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_005087CAG453812538231233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34501422
43NC_005087TAA554297543101466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
44NC_005087ATA454852548631266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501423
45NC_005087AAT455802558131266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501423
46NC_005087ATA457154571641166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_005087CTA458674586841133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34501424
48NC_005087ATA458885588961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_005087TAA459221592321266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
50NC_005087TAA460362603741366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
51NC_005087ATT461139611491133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
52NC_005087ATA461616616261166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_005087TTA465704657141133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_005087AAT466781667911166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_005087TAT472093721041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34501435
56NC_005087TAA473425734351166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501435
57NC_005087TTA473436734461133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501435
58NC_005087ATA477712777251466.67 %33.33 %0 %0 %7 %34501436
59NC_005087ATT478018780301333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
60NC_005087AAT480160801701166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501441
61NC_005087TTA480867808771133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501442
62NC_005087ATT580947809601433.33 %66.67 %0 %0 %7 %34501442
63NC_005087ATT481314813241133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501442
64NC_005087TAA481378813891266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501442
65NC_005087TAA481763817741266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501443
66NC_005087TGC48256882579120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34501444
67NC_005087TAT484053840651333.33 %66.67 %0 %0 %7 %34501446
68NC_005087AGG487760877711233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
69NC_005087ATA487992880041366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_005087ATT488583885941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
71NC_005087AGA488744887551266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
72NC_005087TAA496799968101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501448
73NC_005087TAT497164971751233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
74NC_005087TAA41000051000151166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501451
75NC_005087TAA41001151001251166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501451
76NC_005087ATA41006691006801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
77NC_005087TTA41017331017441233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_005087ATT41045261045371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34501457
79NC_005087CTT4104710104720110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34501457
80NC_005087ATA41056661056771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34501458
81NC_005087TAT51057351057491533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
82NC_005087ATT41061901062001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34501459
83NC_005087ATT41067181067291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34501459
84NC_005087ATT41078491078611333.33 %66.67 %0 %0 %7 %34501459
85NC_005087ATA41083611083711166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501459
86NC_005087ATT41096941097051233.33 %66.67 %0 %0 %0 %34501459
87NC_005087ATA41106821106921166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34501459
88NC_005087TCT4119347119358120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
89NC_005087TAT41200981201101333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
90NC_005087ATT41227091227201233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding