ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005087	AGTA	3	823	834	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34501389
2	NC_005087	T	12	2753	2764	12	0 %	100 %	0 %	0 %	34501389
3	NC_005087	AT	6	5872	5883	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501389
4	NC_005087	ATTA	3	6366	6377	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501389
5	NC_005087	TAAT	3	6404	6415	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501389
6	NC_005087	TTTA	3	7010	7021	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34501389
7	NC_005087	TA	6	8433	8444	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501389
8	NC_005087	TAAA	3	8941	8952	12	75 %	25 %	0 %	0 %	34501389
9	NC_005087	AT	6	12761	12772	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501389
10	NC_005087	AT	8	14223	14238	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005087	AT	8	14294	14309	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005087	ATA	5	15486	15500	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005087	AT	7	15906	15919	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005087	TAT	4	16214	16225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005087	T	13	16954	16966	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005087	CAAA	3	17822	17833	12	75 %	0 %	0 %	25 %	34501398
17	NC_005087	CTAA	3	18000	18011	12	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005087	A	14	18414	18427	14	100 %	0 %	0 %	0 %	34501400
19	NC_005087	T	13	18754	18766	13	0 %	100 %	0 %	0 %	34501401
20	NC_005087	A	12	18891	18902	12	100 %	0 %	0 %	0 %	34501401
21	NC_005087	TTTAT	3	21770	21784	15	20 %	80 %	0 %	0 %	34501404
22	NC_005087	T	13	22038	22050	13	0 %	100 %	0 %	0 %	34501404
23	NC_005087	ATT	4	29293	29304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005087	ATAA	3	29351	29362	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005087	AATT	3	29370	29381	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005087	A	12	32408	32419	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005087	TAT	4	32582	32593	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005087	ATTT	3	33531	33542	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005087	AATT	3	35262	35273	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501414
30	NC_005087	AT	6	41197	41208	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005087	T	12	41232	41243	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005087	ATTTT	3	41395	41409	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005087	CTTTT	3	44699	44713	15	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_005087	A	13	45505	45517	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005087	T	15	45551	45565	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005087	T	13	45846	45858	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005087	A	12	45899	45910	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005087	TAAA	3	48443	48454	12	75 %	25 %	0 %	0 %	34501421
39	NC_005087	T	14	49571	49584	14	0 %	100 %	0 %	0 %	34501421
40	NC_005087	T	14	49625	49638	14	0 %	100 %	0 %	0 %	34501421
41	NC_005087	TATTTT	3	50189	50206	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	34501421
42	NC_005087	T	16	52245	52260	16	0 %	100 %	0 %	0 %	34501421
43	NC_005087	TAA	4	52963	52974	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005087	TA	6	56927	56938	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005087	A	13	57138	57150	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005087	TCTAT	3	59951	59965	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_005087	A	12	60477	60488	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005087	AT	6	61723	61734	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005087	TATT	3	64157	64168	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34501430
50	NC_005087	TTTA	3	65662	65673	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005087	TTTTG	3	68921	68935	15	0 %	80 %	20 %	0 %	126021017
52	NC_005087	TAAT	3	73649	73660	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34501435
53	NC_005087	TATT	3	73759	73770	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34501435
54	NC_005087	T	16	77151	77166	16	0 %	100 %	0 %	0 %	34501436
55	NC_005087	TTAT	3	78455	78466	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005087	T	12	79351	79362	12	0 %	100 %	0 %	0 %	34501440
57	NC_005087	AT	8	79722	79737	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005087	T	12	81290	81301	12	0 %	100 %	0 %	0 %	34501442
59	NC_005087	T	13	81342	81354	13	0 %	100 %	0 %	0 %	34501442
60	NC_005087	TA	6	83073	83084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005087	T	12	84665	84676	12	0 %	100 %	0 %	0 %	34501447
62	NC_005087	ATTT	3	88840	88851	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005087	AGGT	3	91617	91628	12	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005087	T	12	93788	93799	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005087	ATAA	3	98708	98719	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005087	TA	6	102349	102360	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005087	TAT	4	105738	105749	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005087	T	13	108103	108115	13	0 %	100 %	0 %	0 %	34501459
69	NC_005087	ATT	4	109694	109705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34501459
70	NC_005087	A	12	114303	114314	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005087	CTAC	3	116472	116483	12	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005087	AAAT	3	119251	119262	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast