Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Amborella trichopoda chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_005086CAG4103110421233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %126022810
2NC_005086AAT4473547461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_005086ATT4559656061133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_005086TAA4582158331366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_005086TAA4798379931166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_005086ATT4812181321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_005086TAT410974109841133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_005086AAG411265112771366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
9NC_005086ATT515585155991533.33 %66.67 %0 %0 %6 %34500900
10NC_005086ATT515613156271533.33 %66.67 %0 %0 %6 %34500900
11NC_005086ATT515641156551533.33 %66.67 %0 %0 %6 %34500900
12NC_005086ATT415716157271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34500900
13NC_005086TTC41847318484120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34500902
14NC_005086ATA619923199391766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_005086TGT42011020120110 %66.67 %33.33 %0 %9 %126022811
16NC_005086TCT42156421575120 %66.67 %0 %33.33 %0 %126022811
17NC_005086GTT42700927020120 %66.67 %33.33 %0 %8 %34500905
18NC_005086CAA432319323291166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
19NC_005086ATG443804438141133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34500913
20NC_005086CTA445367453781233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34500914
21NC_005086TAT548488485011433.33 %66.67 %0 %0 %7 %34500915
22NC_005086TAT455423554331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_005086AAT456017560281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_005086TTC45618556196120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_005086CTT45742057431120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_005086ATA565268652831666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_005086TAA466948669581166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_005086GAT468454684641133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34500927
29NC_005086CAA475855758651166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_005086CTT47722277234130 %66.67 %0 %33.33 %7 %34500973
31NC_005086TAC478294783051233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34500973
32NC_005086TTA488523885331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34500973
33NC_005086ACG490990910011233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34500973
34NC_005086CTT49103391044120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34500973
35NC_005086GAT492866928761133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34500973
36NC_005086GAT495888958991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34500973
37NC_005086TGA497630976411233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34500973
38NC_005086AAG41022701022811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34500973
39NC_005086TAC41053871053981233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34500973
40NC_005086AAG41100111100211166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34500973
41NC_005086ATT41184101184221333.33 %66.67 %0 %0 %7 %34500973
42NC_005086AAG41190491190601266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34500973
43NC_005086ACA41205261205401566.67 %0 %0 %33.33 %6 %34500973
44NC_005086AAC41211781211891266.67 %0 %0 %33.33 %8 %34500973
45NC_005086CTT4123085123095110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34500973
46NC_005086CTT4134434134444110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34500973
47NC_005086TTA41347011347131333.33 %66.67 %0 %0 %7 %34500973
48NC_005086ATT41383821383921133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34500973
49NC_005086TTC4143634143644110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34500973
50NC_005086GTA41482591482701233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34500973
51NC_005086TCA41560191560311333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %34500977
52NC_005086ATC41577581577691233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34500977
53NC_005086ATC41607811607911133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
54NC_005086TCG4162655162666120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34500979