ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Amborella trichopoda chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005086	ATTT	3	6605	6616	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34500896
2	NC_005086	A	13	7443	7455	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005086	CTTTA	3	10347	10361	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_005086	AT	9	10674	10691	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005086	TAAT	3	10765	10776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005086	A	14	11884	11897	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005086	A	15	12294	12308	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005086	A	14	14480	14493	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005086	ATT	4	15616	15627	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34500900
10	NC_005086	ATT	4	15644	15655	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34500900
11	NC_005086	TTAGA	3	15949	15963	15	40 %	40 %	20 %	0 %	34500900
12	NC_005086	ATTCA	3	19878	19892	15	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_005086	ATA	4	19923	19934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005086	TCT	4	21564	21575	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126022811
15	NC_005086	T	13	21970	21982	13	0 %	100 %	0 %	0 %	126022811
16	NC_005086	T	12	40351	40362	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005086	T	13	41972	41984	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005086	TAT	4	48490	48501	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34500915
19	NC_005086	TAAT	3	55395	55406	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005086	A	13	55583	55595	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005086	ATTCTA	3	64986	65003	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005086	ATA	4	65272	65283	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005086	A	14	71787	71800	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005086	TA	9	72309	72326	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005086	TA	6	73035	73046	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005086	A	15	77775	77789	15	100 %	0 %	0 %	0 %	34500973
27	NC_005086	A	13	77904	77916	13	100 %	0 %	0 %	0 %	34500973
28	NC_005086	A	12	81372	81383	12	100 %	0 %	0 %	0 %	34500973
29	NC_005086	T	14	87686	87699	14	0 %	100 %	0 %	0 %	34500973
30	NC_005086	TTAT	3	120036	120047	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34500973
31	NC_005086	T	12	120841	120852	12	0 %	100 %	0 %	0 %	34500973
32	NC_005086	AGTA	3	120897	120908	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34500973
33	NC_005086	TGAT	3	125771	125782	12	25 %	50 %	25 %	0 %	34500973
34	NC_005086	T	13	126389	126401	13	0 %	100 %	0 %	0 %	34500973
35	NC_005086	AAAG	3	128888	128899	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34500973
36	NC_005086	AT	9	129495	129512	18	50 %	50 %	0 %	0 %	34500973

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Amborella trichopoda chloroplast