ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Calycanthus floridus var. glaucus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004993	ACT	4	1844	1854	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_004993	GCT	4	11554	11565	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32480828
3	NC_004993	ATT	4	13582	13594	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_004993	GAT	4	16376	16388	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	32480832
5	NC_004993	GTT	4	24126	24137	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32480834
6	NC_004993	TTG	4	35885	35895	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32480839
7	NC_004993	ATG	4	39764	39774	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32480842
8	NC_004993	GCA	4	41662	41673	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32480843
9	NC_004993	ATA	4	46185	46196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_004993	AGT	4	46869	46880	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32480845
11	NC_004993	AAG	4	47227	47238	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_004993	GTT	5	52461	52474	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_004993	TAA	4	56084	56094	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_004993	AGA	4	58991	59002	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32480852
15	NC_004993	TTA	4	60864	60874	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_004993	TAT	4	65089	65100	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_004993	TTA	4	66994	67008	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_004993	TCT	4	68950	68961	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_004993	ATA	4	69738	69749	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_004993	TAT	5	72079	72094	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32480890
21	NC_004993	GGA	4	81264	81276	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	32480890
22	NC_004993	CTT	4	85515	85526	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32480890
23	NC_004993	GAT	4	87350	87360	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32480890
24	NC_004993	GAT	4	90355	90366	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32480890
25	NC_004993	TGA	4	92079	92090	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32480890
26	NC_004993	TGA	4	116447	116459	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	32480904
27	NC_004993	ATA	5	119129	119142	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32480904
28	NC_004993	AAT	4	124517	124528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	32480904
29	NC_004993	TTC	5	125701	125715	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	32480904
30	NC_004993	CTT	4	127058	127069	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32480904
31	NC_004993	GTT	4	129815	129825	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32480904
32	NC_004993	TTA	4	140061	140071	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32480904
33	NC_004993	ATC	4	149916	149927	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32480909
34	NC_004993	ATC	4	152922	152932	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Calycanthus floridus var. glaucus chloroplast