ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Eimeria tenella strain Penn State apicoplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004823	AGT	4	214	225	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_004823	TAA	4	336	348	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_004823	ATA	4	2261	2271	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_004823	TTA	4	2467	2479	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_004823	GAA	4	2784	2796	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_004823	ATA	4	4148	4159	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_004823	ATA	4	5399	5410	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442364
8	NC_004823	ATT	4	5542	5553	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442364
9	NC_004823	ATT	4	5815	5826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442364
10	NC_004823	ATA	9	5842	5869	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31442364
11	NC_004823	TAT	4	6207	6218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_004823	TAT	4	6524	6534	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_004823	ATA	6	6725	6742	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_004823	TAA	4	7105	7116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442365
15	NC_004823	ATA	4	7780	7791	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442366
16	NC_004823	GGA	5	8283	8297	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	31442366
17	NC_004823	ATT	4	8682	8693	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442367
18	NC_004823	TAT	4	8867	8878	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	301088585
19	NC_004823	ATT	4	8880	8890	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	301088585
20	NC_004823	TAA	4	9895	9907	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31442370
21	NC_004823	AAT	4	11079	11089	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31442373
22	NC_004823	ATT	4	11521	11531	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31442374
23	NC_004823	ATT	4	11776	11786	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31442374
24	NC_004823	TCT	4	11870	11881	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31442374
25	NC_004823	ATT	5	11890	11903	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31442374
26	NC_004823	ATA	4	12129	12139	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31442375
27	NC_004823	TAT	4	12577	12587	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31442377
28	NC_004823	TAT	4	13076	13087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442378
29	NC_004823	ATT	4	14619	14631	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31442379
30	NC_004823	ATA	4	14653	14664	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442380
31	NC_004823	ATA	4	15253	15264	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	126022809
32	NC_004823	ATA	4	15834	15845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442383
33	NC_004823	ATA	4	15991	16001	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31442383
34	NC_004823	TAA	5	16085	16100	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_004823	TAA	4	16217	16228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	31442384
36	NC_004823	ATA	4	16869	16879	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31442384
37	NC_004823	ATT	4	16966	16977	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442384
38	NC_004823	AAT	4	17132	17143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442384
39	NC_004823	TAT	4	17359	17370	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442384
40	NC_004823	TCT	4	17432	17442	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	31442384
41	NC_004823	ATA	4	18081	18091	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31442384
42	NC_004823	ATA	4	18710	18722	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31442385
43	NC_004823	ATA	4	19017	19028	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442386
44	NC_004823	TTA	4	19122	19132	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31442387
45	NC_004823	TAA	4	19221	19232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442387
46	NC_004823	ATT	4	19812	19822	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_004823	TAA	4	20317	20327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_004823	AAT	4	20350	20361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_004823	TAT	4	20787	20797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_004823	AAT	4	20798	20808	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_004823	ATT	4	20867	20877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_004823	TAA	4	21319	21331	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	301088586
53	NC_004823	TAA	4	21682	21693	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	301088586
54	NC_004823	TAT	4	21843	21854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	301088586
55	NC_004823	ATT	4	22699	22709	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	301088586
56	NC_004823	AAT	4	22896	22906	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	301088586
57	NC_004823	AGA	4	23944	23954	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	31442389
58	NC_004823	ATT	4	23961	23972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	31442389
59	NC_004823	ATA	4	24287	24297	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31442389
60	NC_004823	TTA	4	24596	24606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31442389
61	NC_004823	TAA	4	24626	24638	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31442389
62	NC_004823	TAT	4	24701	24712	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31442389
63	NC_004823	GTA	4	24879	24890	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	31442390
64	NC_004823	TAT	5	27502	27516	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31442390
65	NC_004823	TAA	4	27632	27644	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31442390
66	NC_004823	TAA	4	28243	28254	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31442391
67	NC_004823	ATA	4	32240	32252	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_004823	ATT	4	34371	34383	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_004823	TAC	4	34494	34505	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_004823	ATT	4	34724	34734	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Eimeria tenella strain Penn State apicoplast